Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8RHJ2

Protein Details
Accession A0A0J8RHJ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1037-1063LLIDDTPKPKNKAKKETDRGRGRGGPRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1044-1078KPKNKAKKETDRGRGRGGPRGRGGRGRGRGRGRGF
Subcellular Location(s) nucl 14.5cyto_nucl 14.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR047575  Sm  
IPR034102  Sm_D1  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
IPR000795  T_Tr_GTP-bd_dom  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00009  GTP_EFTU  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01724  Sm_D1  
Amino Acid Sequences MASVFTYDPDPPRVSSPWSTPGSTTPNLRKTASGYLSTGSHDTTAPDPSDPSYLTYHGISKLDVEPQDGPTEYKLHLLLRSRRSFLSLSTGSLISGSNHSKSAQDVEQLDSASKPLSSSSQTRQHRLHQLTTQLLWRLQQSSPFHSASTTVDLVLPVLPEATPTLNVPNALAPLLPGLEESQGALYEIGVSDDGTFVGLAEDELEESLVNLRAMAASLGCTVEVLRKVAVGYCEWAESGTDNHNPVTVRDKLWVAEALVRPDLRNDDDQHPGSDVLQSETENMALMHKVPDISRSTEQLYVALVGPFGAGKSSLLGILSTSSFDNGRGKIRISLLKHPHEIASGVTSSVAQELIGYSAQGGCVLGETPSVVNYASGNVSAWNDIHATAAGGRLVFLSDLPGSLRYSKSTLRGLMSWEPHYVCLCTPADGSRSAERGEMVEADLTLSYLDLCLKLDLPVVLVVTKVDLGTQLVKRTLSPILSAIKAAGRKPVLLYRSSEIPKPNPDLQKISASDQEIVDSAIASINDVAIEDVVPIVLTSAVTGAGIGHLHALLRSLPLPRRSSPKPTAMARNCHCEKILDINDVFEMPLSKVYSASSENDHRNDRGIILCGRIRRGMISVGDCLVVGPLQPDSKLENKAGDNLSQRPRATCSKSFPDNLTSLRLQRLQHHTSQTHVETYWQEVRIVSVRNLRQPVKSLYEHQIGTIGIDPVNPHACLGRIRKGMILASFKSSAESHAPFPVAQPYFHTGFIASFPASNFSGLPSAVTVGSNMIIYIRSIRTSAKVLAINRTESQRRQSSSAEPEIFTFDGPDELDGSLGSASQFRSHDKAPAPEIKITFSFVSSVECIEVPSRVLAMPSIASSSTAASSSPSSSTRGTQSLRGLVGWFVLVGIDQEKLDRNFCGSFQSTVKWLSLYNMKVIPSRLHALGGRQISQLSQRSLDQFAAGGKELAVKLLCNHEACPISYEMRHETVTIELKNGTILHGTIASVSPQMNTALRTVKMTPKGREPISLDTINIRGSTIRYFILPDSLPLDTLLIDDTPKPKNKAKKETDRGRGRGGPRGRGGRGRGRGRGRGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.37
3 0.39
4 0.42
5 0.44
6 0.44
7 0.4
8 0.44
9 0.44
10 0.43
11 0.46
12 0.47
13 0.51
14 0.53
15 0.53
16 0.49
17 0.47
18 0.52
19 0.48
20 0.42
21 0.36
22 0.34
23 0.34
24 0.34
25 0.31
26 0.22
27 0.19
28 0.16
29 0.17
30 0.17
31 0.2
32 0.19
33 0.19
34 0.19
35 0.2
36 0.23
37 0.21
38 0.22
39 0.21
40 0.21
41 0.22
42 0.23
43 0.24
44 0.24
45 0.24
46 0.22
47 0.22
48 0.23
49 0.27
50 0.26
51 0.26
52 0.25
53 0.26
54 0.29
55 0.26
56 0.25
57 0.21
58 0.23
59 0.2
60 0.21
61 0.21
62 0.21
63 0.25
64 0.33
65 0.39
66 0.47
67 0.52
68 0.52
69 0.51
70 0.52
71 0.48
72 0.41
73 0.42
74 0.33
75 0.29
76 0.28
77 0.28
78 0.24
79 0.23
80 0.21
81 0.14
82 0.18
83 0.19
84 0.18
85 0.19
86 0.2
87 0.2
88 0.22
89 0.26
90 0.23
91 0.25
92 0.25
93 0.27
94 0.28
95 0.28
96 0.27
97 0.22
98 0.2
99 0.15
100 0.13
101 0.1
102 0.1
103 0.13
104 0.16
105 0.22
106 0.3
107 0.39
108 0.45
109 0.52
110 0.55
111 0.6
112 0.66
113 0.65
114 0.64
115 0.59
116 0.6
117 0.57
118 0.55
119 0.51
120 0.44
121 0.4
122 0.35
123 0.32
124 0.29
125 0.26
126 0.31
127 0.31
128 0.34
129 0.38
130 0.37
131 0.34
132 0.32
133 0.32
134 0.27
135 0.28
136 0.22
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.15
142 0.13
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.13
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.12
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.05
194 0.07
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.06
203 0.05
204 0.06
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.1
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.15
216 0.16
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.11
224 0.1
225 0.11
226 0.13
227 0.15
228 0.16
229 0.16
230 0.18
231 0.18
232 0.19
233 0.23
234 0.22
235 0.2
236 0.22
237 0.23
238 0.21
239 0.22
240 0.22
241 0.18
242 0.21
243 0.22
244 0.22
245 0.24
246 0.24
247 0.22
248 0.22
249 0.24
250 0.21
251 0.23
252 0.25
253 0.26
254 0.32
255 0.34
256 0.33
257 0.31
258 0.28
259 0.24
260 0.22
261 0.19
262 0.14
263 0.14
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.1
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.13
278 0.15
279 0.2
280 0.21
281 0.23
282 0.25
283 0.26
284 0.26
285 0.22
286 0.2
287 0.16
288 0.15
289 0.12
290 0.09
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.09
311 0.13
312 0.14
313 0.18
314 0.18
315 0.19
316 0.22
317 0.26
318 0.3
319 0.3
320 0.38
321 0.42
322 0.46
323 0.47
324 0.44
325 0.41
326 0.36
327 0.32
328 0.23
329 0.17
330 0.12
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.03
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.04
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.1
390 0.11
391 0.11
392 0.14
393 0.16
394 0.2
395 0.22
396 0.23
397 0.23
398 0.23
399 0.26
400 0.28
401 0.28
402 0.26
403 0.25
404 0.23
405 0.22
406 0.22
407 0.18
408 0.14
409 0.15
410 0.13
411 0.12
412 0.12
413 0.13
414 0.14
415 0.14
416 0.17
417 0.15
418 0.16
419 0.16
420 0.16
421 0.15
422 0.14
423 0.13
424 0.11
425 0.08
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.03
434 0.03
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.05
455 0.09
456 0.1
457 0.12
458 0.13
459 0.13
460 0.13
461 0.15
462 0.16
463 0.13
464 0.12
465 0.13
466 0.14
467 0.14
468 0.14
469 0.12
470 0.13
471 0.14
472 0.14
473 0.15
474 0.14
475 0.14
476 0.15
477 0.19
478 0.19
479 0.18
480 0.2
481 0.18
482 0.23
483 0.24
484 0.26
485 0.25
486 0.26
487 0.28
488 0.31
489 0.36
490 0.33
491 0.35
492 0.35
493 0.35
494 0.37
495 0.34
496 0.31
497 0.28
498 0.25
499 0.24
500 0.2
501 0.18
502 0.13
503 0.11
504 0.09
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.03
515 0.02
516 0.03
517 0.03
518 0.02
519 0.02
520 0.02
521 0.02
522 0.02
523 0.02
524 0.02
525 0.02
526 0.03
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.03
535 0.03
536 0.03
537 0.03
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.06
542 0.09
543 0.12
544 0.17
545 0.21
546 0.22
547 0.29
548 0.32
549 0.39
550 0.41
551 0.44
552 0.45
553 0.45
554 0.53
555 0.51
556 0.56
557 0.5
558 0.54
559 0.49
560 0.44
561 0.41
562 0.31
563 0.27
564 0.28
565 0.28
566 0.22
567 0.21
568 0.2
569 0.2
570 0.19
571 0.18
572 0.09
573 0.08
574 0.05
575 0.07
576 0.07
577 0.07
578 0.07
579 0.08
580 0.1
581 0.1
582 0.11
583 0.13
584 0.17
585 0.21
586 0.23
587 0.25
588 0.24
589 0.24
590 0.23
591 0.21
592 0.17
593 0.16
594 0.14
595 0.15
596 0.17
597 0.16
598 0.17
599 0.17
600 0.16
601 0.14
602 0.14
603 0.14
604 0.14
605 0.14
606 0.13
607 0.13
608 0.13
609 0.12
610 0.1
611 0.08
612 0.06
613 0.04
614 0.04
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.06
619 0.09
620 0.13
621 0.16
622 0.16
623 0.18
624 0.19
625 0.23
626 0.23
627 0.24
628 0.24
629 0.28
630 0.32
631 0.33
632 0.33
633 0.3
634 0.33
635 0.36
636 0.39
637 0.38
638 0.39
639 0.41
640 0.45
641 0.46
642 0.44
643 0.41
644 0.37
645 0.33
646 0.31
647 0.26
648 0.24
649 0.24
650 0.27
651 0.24
652 0.29
653 0.36
654 0.35
655 0.38
656 0.43
657 0.4
658 0.38
659 0.42
660 0.35
661 0.29
662 0.25
663 0.23
664 0.17
665 0.22
666 0.24
667 0.2
668 0.19
669 0.18
670 0.19
671 0.2
672 0.21
673 0.19
674 0.22
675 0.24
676 0.29
677 0.34
678 0.35
679 0.33
680 0.35
681 0.36
682 0.35
683 0.35
684 0.34
685 0.35
686 0.37
687 0.35
688 0.31
689 0.29
690 0.23
691 0.21
692 0.18
693 0.13
694 0.09
695 0.09
696 0.09
697 0.1
698 0.12
699 0.11
700 0.1
701 0.09
702 0.11
703 0.16
704 0.21
705 0.26
706 0.26
707 0.27
708 0.28
709 0.29
710 0.3
711 0.28
712 0.28
713 0.21
714 0.22
715 0.23
716 0.21
717 0.22
718 0.2
719 0.19
720 0.19
721 0.19
722 0.18
723 0.19
724 0.2
725 0.18
726 0.18
727 0.23
728 0.2
729 0.18
730 0.19
731 0.21
732 0.23
733 0.23
734 0.22
735 0.15
736 0.14
737 0.15
738 0.14
739 0.1
740 0.09
741 0.09
742 0.12
743 0.12
744 0.12
745 0.11
746 0.1
747 0.11
748 0.1
749 0.1
750 0.07
751 0.08
752 0.08
753 0.08
754 0.07
755 0.06
756 0.07
757 0.06
758 0.06
759 0.05
760 0.05
761 0.05
762 0.09
763 0.09
764 0.09
765 0.1
766 0.12
767 0.14
768 0.17
769 0.18
770 0.2
771 0.23
772 0.24
773 0.3
774 0.32
775 0.32
776 0.31
777 0.35
778 0.35
779 0.34
780 0.4
781 0.4
782 0.41
783 0.41
784 0.42
785 0.44
786 0.46
787 0.5
788 0.45
789 0.39
790 0.37
791 0.36
792 0.33
793 0.26
794 0.2
795 0.12
796 0.1
797 0.1
798 0.1
799 0.08
800 0.07
801 0.07
802 0.06
803 0.07
804 0.06
805 0.06
806 0.06
807 0.06
808 0.07
809 0.1
810 0.12
811 0.14
812 0.18
813 0.19
814 0.25
815 0.28
816 0.32
817 0.34
818 0.41
819 0.41
820 0.42
821 0.41
822 0.38
823 0.35
824 0.33
825 0.28
826 0.2
827 0.18
828 0.14
829 0.16
830 0.13
831 0.13
832 0.11
833 0.11
834 0.11
835 0.11
836 0.11
837 0.09
838 0.09
839 0.09
840 0.08
841 0.09
842 0.08
843 0.08
844 0.08
845 0.08
846 0.09
847 0.08
848 0.08
849 0.09
850 0.09
851 0.09
852 0.09
853 0.08
854 0.09
855 0.1
856 0.11
857 0.13
858 0.13
859 0.16
860 0.17
861 0.2
862 0.22
863 0.27
864 0.27
865 0.3
866 0.33
867 0.34
868 0.33
869 0.31
870 0.27
871 0.22
872 0.2
873 0.15
874 0.11
875 0.06
876 0.06
877 0.05
878 0.05
879 0.05
880 0.06
881 0.06
882 0.07
883 0.13
884 0.14
885 0.16
886 0.16
887 0.18
888 0.19
889 0.19
890 0.24
891 0.21
892 0.23
893 0.24
894 0.25
895 0.24
896 0.25
897 0.25
898 0.2
899 0.18
900 0.18
901 0.23
902 0.23
903 0.25
904 0.26
905 0.27
906 0.29
907 0.31
908 0.29
909 0.27
910 0.3
911 0.26
912 0.26
913 0.26
914 0.26
915 0.31
916 0.31
917 0.29
918 0.25
919 0.25
920 0.23
921 0.29
922 0.31
923 0.27
924 0.26
925 0.26
926 0.28
927 0.3
928 0.3
929 0.23
930 0.19
931 0.18
932 0.18
933 0.16
934 0.14
935 0.11
936 0.15
937 0.14
938 0.15
939 0.14
940 0.12
941 0.14
942 0.2
943 0.23
944 0.2
945 0.21
946 0.25
947 0.27
948 0.27
949 0.28
950 0.25
951 0.24
952 0.25
953 0.28
954 0.27
955 0.27
956 0.27
957 0.24
958 0.22
959 0.25
960 0.3
961 0.26
962 0.24
963 0.21
964 0.21
965 0.22
966 0.21
967 0.17
968 0.12
969 0.12
970 0.11
971 0.11
972 0.11
973 0.1
974 0.11
975 0.11
976 0.11
977 0.11
978 0.1
979 0.11
980 0.13
981 0.14
982 0.14
983 0.17
984 0.2
985 0.2
986 0.24
987 0.26
988 0.32
989 0.4
990 0.47
991 0.48
992 0.53
993 0.6
994 0.58
995 0.61
996 0.58
997 0.56
998 0.55
999 0.51
1000 0.43
1001 0.38
1002 0.38
1003 0.33
1004 0.28
1005 0.21
1006 0.16
1007 0.17
1008 0.19
1009 0.17
1010 0.16
1011 0.15
1012 0.18
1013 0.18
1014 0.22
1015 0.2
1016 0.19
1017 0.2
1018 0.2
1019 0.2
1020 0.18
1021 0.17
1022 0.11
1023 0.12
1024 0.11
1025 0.09
1026 0.09
1027 0.12
1028 0.17
1029 0.24
1030 0.32
1031 0.37
1032 0.44
1033 0.54
1034 0.63
1035 0.71
1036 0.77
1037 0.81
1038 0.85
1039 0.89
1040 0.92
1041 0.92
1042 0.87
1043 0.84
1044 0.81
1045 0.74
1046 0.73
1047 0.69
1048 0.67
1049 0.65
1050 0.68
1051 0.65
1052 0.65
1053 0.68
1054 0.69
1055 0.71
1056 0.71
1057 0.72
1058 0.72