Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8UBV1

Protein Details
Accession A0A0J8UBV1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-32DQTETRRRQHRLGKDLKERERIABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-50RRQHRLGKDLKERERIAKQEALEKAETLGRGKRKR
220-231VRRKKHKPARAG
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040934  Znf-CCCH_6  
Pfam View protein in Pfam  
PF18585  zf-CCCH_6  
Amino Acid Sequences MTLRSEDRLDQTETRRRQHRLGKDLKERERIAKQEALEKAETLGRGKRKRQAVDYALPSSPFRKDGKDSDTEFTGTEADSDNDGIRSDSFASPERAKKRIVSPQNRDSALGRPYKRAQVPDLEATTGEAPLNGTSMTMNHERCIACDTIHPQGHCRLKQAGVEHCGLCGIAHFGHSRTCPHLNSEVQVASMLSSLKESTEQRALVEEATKYLRGIRGDLVRRKKHKPARAGAPAAPHNPTMNPNANHWNHPPTPPIPPVLAPPPRLAPVPGPGPAHWHQPYYPWPPAQGPLNPNHPPAYFPPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.63
3 0.65
4 0.69
5 0.73
6 0.74
7 0.75
8 0.78
9 0.8
10 0.82
11 0.87
12 0.86
13 0.85
14 0.78
15 0.75
16 0.73
17 0.68
18 0.63
19 0.57
20 0.51
21 0.5
22 0.49
23 0.46
24 0.39
25 0.35
26 0.3
27 0.28
28 0.28
29 0.23
30 0.26
31 0.31
32 0.38
33 0.44
34 0.5
35 0.56
36 0.62
37 0.65
38 0.68
39 0.66
40 0.66
41 0.65
42 0.62
43 0.54
44 0.49
45 0.44
46 0.36
47 0.31
48 0.27
49 0.23
50 0.24
51 0.28
52 0.33
53 0.38
54 0.43
55 0.44
56 0.42
57 0.42
58 0.38
59 0.33
60 0.27
61 0.22
62 0.15
63 0.12
64 0.1
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.09
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.15
78 0.19
79 0.23
80 0.3
81 0.33
82 0.33
83 0.34
84 0.36
85 0.41
86 0.47
87 0.53
88 0.56
89 0.59
90 0.65
91 0.69
92 0.66
93 0.6
94 0.51
95 0.46
96 0.41
97 0.4
98 0.34
99 0.33
100 0.35
101 0.4
102 0.42
103 0.39
104 0.36
105 0.34
106 0.36
107 0.35
108 0.33
109 0.27
110 0.24
111 0.22
112 0.2
113 0.14
114 0.1
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.06
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.08
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.16
128 0.16
129 0.16
130 0.19
131 0.16
132 0.12
133 0.14
134 0.16
135 0.19
136 0.21
137 0.21
138 0.2
139 0.26
140 0.32
141 0.3
142 0.31
143 0.26
144 0.26
145 0.28
146 0.31
147 0.28
148 0.25
149 0.27
150 0.24
151 0.22
152 0.2
153 0.17
154 0.13
155 0.09
156 0.07
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.1
162 0.11
163 0.13
164 0.16
165 0.19
166 0.18
167 0.21
168 0.26
169 0.25
170 0.25
171 0.26
172 0.21
173 0.18
174 0.17
175 0.14
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.09
184 0.1
185 0.13
186 0.17
187 0.17
188 0.17
189 0.19
190 0.19
191 0.16
192 0.18
193 0.14
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.12
198 0.13
199 0.16
200 0.15
201 0.16
202 0.19
203 0.25
204 0.33
205 0.41
206 0.49
207 0.55
208 0.61
209 0.65
210 0.71
211 0.73
212 0.73
213 0.75
214 0.74
215 0.75
216 0.78
217 0.76
218 0.68
219 0.65
220 0.61
221 0.54
222 0.47
223 0.38
224 0.3
225 0.27
226 0.27
227 0.27
228 0.31
229 0.3
230 0.32
231 0.4
232 0.41
233 0.44
234 0.46
235 0.46
236 0.41
237 0.42
238 0.43
239 0.36
240 0.4
241 0.38
242 0.36
243 0.31
244 0.29
245 0.32
246 0.36
247 0.39
248 0.34
249 0.35
250 0.35
251 0.35
252 0.35
253 0.33
254 0.26
255 0.26
256 0.28
257 0.29
258 0.29
259 0.27
260 0.34
261 0.34
262 0.4
263 0.36
264 0.35
265 0.32
266 0.34
267 0.42
268 0.43
269 0.48
270 0.4
271 0.41
272 0.41
273 0.46
274 0.46
275 0.45
276 0.42
277 0.42
278 0.49
279 0.49
280 0.49
281 0.49
282 0.43
283 0.39