Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8QQU3

Protein Details
Accession A0A0J8QQU3    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-78GKGASSKKPEDNSKLKKRRGRKVIEDSEDEDVQPVKTTPKPEPKKKRQKPEETEEPTTTHydrophilic
134-153AVVVRNGRTRQKPKATKILDHydrophilic
248-269VKSPTKPTPKKQKAAAKPPQAEHydrophilic
835-901LDLKKDKYVRAPKKTGAKKATAGKGTAKPKKKRNKRKKSDSDLDISDREEDSKPSKARKGKKTKGKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-41SGKGASSKKPEDNSKLKKRRGRK
59-68KPEPKKKRQK
121-134RKSDAKRDRERSPA
138-146RNGRTRQKP
237-265KQKKKAARGQAVKSPTKPTPKKQKAAAKP
840-873DKYVRAPKKTGAKKATAGKGTAKPKKKRNKRKKS
887-901KPSKARKGKKTKGKA
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001357  BRCT_dom  
IPR036420  BRCT_dom_sf  
IPR008921  DNA_pol3_clamp-load_cplx_C  
IPR013725  DNA_replication_fac_RFC1_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR012178  RFC1  
Gene Ontology GO:0005663  C:DNA replication factor C complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003689  F:DNA clamp loader activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006271  P:DNA strand elongation involved in DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF00533  BRCT  
PF08519  RFC1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50172  BRCT  
CDD cd18140  HLD_clamp_RFC  
Amino Acid Sequences MAPDIRSFFGTQSSQGSKSGKGASSKKPEDNSKLKKRRGRKVIEDSEDEDVQPVKTTPKPEPKKKRQKPEETEEPTTTSDYFASSRKSLRGPKSSAPVEESKPEKSEVSEAKSVDVTSKSRKSDAKRDRERSPAVVVRNGRTRQKPKATKILDADDSLGGDDIFATEYQKRGGGGGDDDYQEEEDEDSDFEELQVESRPLQPAKKVSRSTNTSTRNGQKRKSDALHDEDEESELSDKQKKKAARGQAVKSPTKPTPKKQKAAAKPPQAESKEIQAIFDSIPTVRPPSPPAEAKKFNFMAANQRAHASAAGEPAELPIGAENCLAGLSFVFTGVLDSLGRDEGQALVKRYGGKVTGAPSSKTSYVVLGSDAGPKKLATIRKHNLKTINESKRLLEDGLRGVLDTTSLQGYFSGEGKKVQSEKKNLVLIMDEVDGMSAGDRGGVGALAAVAKKTRIPMILICNERRLPKMRPFDHVTYELPFRRPTADQIRSRLATICFREGLKIPPQVLDGLIEGTHSDIRQIVNMLSTVKLDSQNLDFDEGKQMSKAWEKHVILKPWDIVGKILSAQMFSQSSTATLNDKIELYFNDHEFSYLMLQENYLKTNPIAAGSYNGRERKFKLLELADNAAQSISDGDLVDRMIHGSQQQWSLMPTHAVFSFVRPASFVSGNMVDRVGFTSWLGNNSKQGKMARQIKEIQGHMRLRASGDRHEIRQQYLPALWEKLVHRLDVDGKDAVQEVIDLMDSYFLTREDWDSILELGLGPMSEKTVNIESQTKATFTRLYNQQSHPLPFMKASTVVAPKRLPKIKPDLEDAMDESDEGEEILGEEEVKEDDDELDLKKDKYVRAPKKTGAKKATAGKGTAKPKKKRNKRKKSDSDLDISDREEDSKPSKARKGKKTKGKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.34
3 0.35
4 0.31
5 0.35
6 0.4
7 0.37
8 0.41
9 0.46
10 0.51
11 0.6
12 0.65
13 0.67
14 0.68
15 0.73
16 0.74
17 0.78
18 0.79
19 0.79
20 0.82
21 0.85
22 0.86
23 0.88
24 0.89
25 0.89
26 0.88
27 0.88
28 0.88
29 0.89
30 0.87
31 0.82
32 0.74
33 0.68
34 0.59
35 0.48
36 0.39
37 0.29
38 0.23
39 0.19
40 0.17
41 0.17
42 0.2
43 0.25
44 0.33
45 0.43
46 0.53
47 0.63
48 0.73
49 0.79
50 0.87
51 0.93
52 0.95
53 0.94
54 0.95
55 0.94
56 0.92
57 0.92
58 0.89
59 0.85
60 0.76
61 0.68
62 0.58
63 0.51
64 0.41
65 0.31
66 0.23
67 0.18
68 0.18
69 0.18
70 0.22
71 0.23
72 0.27
73 0.3
74 0.37
75 0.44
76 0.51
77 0.57
78 0.58
79 0.61
80 0.67
81 0.66
82 0.61
83 0.58
84 0.54
85 0.48
86 0.49
87 0.46
88 0.41
89 0.39
90 0.38
91 0.34
92 0.3
93 0.35
94 0.34
95 0.37
96 0.38
97 0.36
98 0.36
99 0.36
100 0.34
101 0.29
102 0.27
103 0.25
104 0.29
105 0.36
106 0.37
107 0.41
108 0.48
109 0.52
110 0.6
111 0.66
112 0.68
113 0.72
114 0.77
115 0.77
116 0.79
117 0.76
118 0.69
119 0.66
120 0.61
121 0.54
122 0.54
123 0.52
124 0.48
125 0.53
126 0.54
127 0.54
128 0.58
129 0.62
130 0.65
131 0.73
132 0.77
133 0.75
134 0.81
135 0.77
136 0.74
137 0.72
138 0.68
139 0.6
140 0.51
141 0.45
142 0.34
143 0.31
144 0.23
145 0.18
146 0.11
147 0.08
148 0.07
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.07
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.13
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.15
163 0.17
164 0.16
165 0.17
166 0.17
167 0.16
168 0.14
169 0.13
170 0.1
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.13
185 0.18
186 0.19
187 0.22
188 0.26
189 0.33
190 0.41
191 0.49
192 0.51
193 0.53
194 0.59
195 0.63
196 0.65
197 0.66
198 0.64
199 0.59
200 0.62
201 0.65
202 0.66
203 0.67
204 0.67
205 0.65
206 0.65
207 0.69
208 0.66
209 0.64
210 0.6
211 0.59
212 0.57
213 0.5
214 0.45
215 0.37
216 0.33
217 0.26
218 0.2
219 0.15
220 0.11
221 0.13
222 0.19
223 0.22
224 0.24
225 0.3
226 0.33
227 0.4
228 0.47
229 0.55
230 0.58
231 0.63
232 0.65
233 0.66
234 0.7
235 0.66
236 0.61
237 0.57
238 0.52
239 0.54
240 0.56
241 0.58
242 0.63
243 0.68
244 0.72
245 0.75
246 0.79
247 0.79
248 0.83
249 0.83
250 0.81
251 0.77
252 0.74
253 0.74
254 0.66
255 0.59
256 0.49
257 0.45
258 0.42
259 0.36
260 0.33
261 0.24
262 0.24
263 0.2
264 0.19
265 0.14
266 0.08
267 0.09
268 0.1
269 0.13
270 0.13
271 0.14
272 0.16
273 0.19
274 0.25
275 0.29
276 0.35
277 0.4
278 0.46
279 0.46
280 0.51
281 0.47
282 0.43
283 0.4
284 0.34
285 0.36
286 0.35
287 0.37
288 0.3
289 0.3
290 0.29
291 0.27
292 0.26
293 0.17
294 0.12
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.08
302 0.06
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.03
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.05
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.11
330 0.14
331 0.15
332 0.16
333 0.17
334 0.19
335 0.19
336 0.19
337 0.15
338 0.14
339 0.14
340 0.15
341 0.19
342 0.19
343 0.2
344 0.2
345 0.23
346 0.22
347 0.21
348 0.19
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.11
353 0.1
354 0.1
355 0.15
356 0.15
357 0.15
358 0.14
359 0.14
360 0.15
361 0.18
362 0.25
363 0.23
364 0.33
365 0.41
366 0.5
367 0.53
368 0.56
369 0.58
370 0.54
371 0.58
372 0.58
373 0.58
374 0.53
375 0.52
376 0.48
377 0.42
378 0.41
379 0.33
380 0.24
381 0.18
382 0.14
383 0.14
384 0.13
385 0.11
386 0.1
387 0.1
388 0.08
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.08
398 0.09
399 0.09
400 0.11
401 0.11
402 0.14
403 0.17
404 0.23
405 0.27
406 0.31
407 0.35
408 0.39
409 0.4
410 0.37
411 0.34
412 0.28
413 0.22
414 0.18
415 0.15
416 0.09
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.04
422 0.03
423 0.02
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.02
430 0.02
431 0.02
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.07
440 0.07
441 0.09
442 0.12
443 0.18
444 0.24
445 0.27
446 0.27
447 0.29
448 0.3
449 0.3
450 0.3
451 0.29
452 0.28
453 0.33
454 0.42
455 0.41
456 0.44
457 0.49
458 0.49
459 0.48
460 0.45
461 0.38
462 0.3
463 0.32
464 0.29
465 0.24
466 0.22
467 0.19
468 0.19
469 0.19
470 0.23
471 0.29
472 0.35
473 0.37
474 0.4
475 0.44
476 0.42
477 0.42
478 0.38
479 0.3
480 0.27
481 0.26
482 0.24
483 0.21
484 0.2
485 0.21
486 0.19
487 0.21
488 0.21
489 0.22
490 0.21
491 0.2
492 0.21
493 0.2
494 0.18
495 0.15
496 0.1
497 0.07
498 0.07
499 0.06
500 0.05
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.08
509 0.08
510 0.07
511 0.08
512 0.09
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.09
518 0.09
519 0.1
520 0.11
521 0.12
522 0.12
523 0.15
524 0.13
525 0.13
526 0.19
527 0.18
528 0.17
529 0.15
530 0.15
531 0.15
532 0.21
533 0.22
534 0.2
535 0.28
536 0.29
537 0.38
538 0.44
539 0.46
540 0.41
541 0.41
542 0.38
543 0.32
544 0.32
545 0.23
546 0.17
547 0.13
548 0.12
549 0.1
550 0.11
551 0.09
552 0.08
553 0.08
554 0.1
555 0.1
556 0.09
557 0.09
558 0.08
559 0.08
560 0.09
561 0.1
562 0.09
563 0.1
564 0.11
565 0.11
566 0.12
567 0.11
568 0.12
569 0.11
570 0.16
571 0.16
572 0.16
573 0.17
574 0.16
575 0.16
576 0.15
577 0.15
578 0.1
579 0.09
580 0.1
581 0.08
582 0.09
583 0.12
584 0.12
585 0.14
586 0.13
587 0.13
588 0.11
589 0.14
590 0.14
591 0.12
592 0.11
593 0.1
594 0.13
595 0.14
596 0.17
597 0.21
598 0.24
599 0.25
600 0.27
601 0.29
602 0.35
603 0.36
604 0.34
605 0.35
606 0.35
607 0.37
608 0.38
609 0.39
610 0.31
611 0.28
612 0.27
613 0.19
614 0.15
615 0.11
616 0.08
617 0.05
618 0.05
619 0.05
620 0.05
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.07
628 0.08
629 0.09
630 0.12
631 0.13
632 0.14
633 0.13
634 0.14
635 0.15
636 0.15
637 0.15
638 0.13
639 0.13
640 0.12
641 0.14
642 0.14
643 0.13
644 0.2
645 0.18
646 0.18
647 0.17
648 0.18
649 0.19
650 0.2
651 0.18
652 0.15
653 0.17
654 0.18
655 0.18
656 0.17
657 0.13
658 0.13
659 0.15
660 0.12
661 0.09
662 0.09
663 0.12
664 0.13
665 0.18
666 0.21
667 0.2
668 0.26
669 0.3
670 0.31
671 0.31
672 0.33
673 0.33
674 0.4
675 0.49
676 0.47
677 0.48
678 0.52
679 0.53
680 0.57
681 0.54
682 0.49
683 0.48
684 0.46
685 0.43
686 0.4
687 0.34
688 0.31
689 0.33
690 0.31
691 0.28
692 0.35
693 0.36
694 0.37
695 0.44
696 0.44
697 0.41
698 0.44
699 0.4
700 0.34
701 0.32
702 0.32
703 0.27
704 0.27
705 0.24
706 0.23
707 0.22
708 0.28
709 0.28
710 0.25
711 0.23
712 0.24
713 0.29
714 0.27
715 0.28
716 0.2
717 0.19
718 0.2
719 0.2
720 0.17
721 0.11
722 0.09
723 0.06
724 0.06
725 0.06
726 0.05
727 0.05
728 0.06
729 0.06
730 0.07
731 0.07
732 0.07
733 0.08
734 0.09
735 0.11
736 0.12
737 0.13
738 0.13
739 0.13
740 0.13
741 0.12
742 0.12
743 0.09
744 0.07
745 0.07
746 0.06
747 0.05
748 0.05
749 0.07
750 0.07
751 0.07
752 0.11
753 0.14
754 0.15
755 0.17
756 0.22
757 0.21
758 0.25
759 0.26
760 0.24
761 0.22
762 0.24
763 0.26
764 0.23
765 0.31
766 0.35
767 0.41
768 0.47
769 0.49
770 0.55
771 0.55
772 0.56
773 0.52
774 0.46
775 0.41
776 0.35
777 0.34
778 0.28
779 0.24
780 0.22
781 0.24
782 0.3
783 0.3
784 0.33
785 0.36
786 0.39
787 0.47
788 0.53
789 0.49
790 0.49
791 0.58
792 0.61
793 0.61
794 0.62
795 0.58
796 0.53
797 0.53
798 0.47
799 0.39
800 0.3
801 0.26
802 0.2
803 0.14
804 0.12
805 0.09
806 0.07
807 0.04
808 0.05
809 0.06
810 0.05
811 0.05
812 0.05
813 0.06
814 0.07
815 0.08
816 0.08
817 0.07
818 0.08
819 0.09
820 0.11
821 0.12
822 0.17
823 0.19
824 0.2
825 0.23
826 0.28
827 0.3
828 0.39
829 0.48
830 0.54
831 0.6
832 0.68
833 0.71
834 0.77
835 0.83
836 0.83
837 0.79
838 0.75
839 0.72
840 0.74
841 0.76
842 0.69
843 0.63
844 0.61
845 0.62
846 0.66
847 0.68
848 0.69
849 0.69
850 0.75
851 0.84
852 0.87
853 0.9
854 0.91
855 0.93
856 0.94
857 0.96
858 0.97
859 0.96
860 0.95
861 0.91
862 0.87
863 0.82
864 0.76
865 0.66
866 0.57
867 0.48
868 0.39
869 0.34
870 0.28
871 0.27
872 0.26
873 0.33
874 0.37
875 0.43
876 0.51
877 0.58
878 0.66
879 0.73
880 0.8
881 0.82