Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8TXJ4

Protein Details
Accession A0A0J8TXJ4    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-35DDSRTAAVRPRSKQKPSRVTKAAAHydrophilic
58-79GPAPRIPRFRPARRHLHKCVAPBasic
511-530TGATRWKPLNKQPPRTHIRFHydrophilic
591-613GSVRPAPPRSPPRGRGRHPLPPLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
61-70PRIPRFRPAR
584-637PPRPRGGGSVRPAPPRSPPRGRGRHPLPPLPPPPARGGSKNKRGGSRGGKGAKN
Subcellular Location(s) nucl 6, plas 5, extr 5, cyto 3, pero 2, golg 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Amino Acid Sequences MPGRDQGNDSADDSRTAAVRPRSKQKPSRVTKAAATTAAIVVVAAVPPEAVARRGVAGPAPRIPRFRPARRHLHKCVAPVDGDSSSDQPSDNGGSQHSPSDAAAQPLSDVIMQPAVNWNKGGGGAIRTSLRGSGGTSTPVSAPASAAFDAVNDRYWRSRSASASEDEGPNSSRPSANKPDNNSGDDGRISNESAGGLVMSEDSELESDAEADNSIMLNLSTPTQNENVVQTSAINGMETFNSHANGPTETQTQMQEVRAESVIEQPPVSRDNAVSRKHNSAETIAAFESFSSKYPSPPHTLADLAREDRDMQIKYIHYNKELKNVDMNLPIRCTDCMAEGHLSEICPYKECKHCGAWGIHESRFCPAWRRCQRCRERGHDEVDCPSLLKGLASEVPCDFCGSSQHIEGECDLLWKLPKRDLGISQIFVSVCCSFCTSKQHLLGDCPIRPFSMNSSSWTLRTVDPASIANLGDTKLSLDAQNTNRDEHLTGLRIKGRANERAESDEENDDFTGATRWKPLNKQPPRTHIRFGSGIGRGRNLGEDRQDGNGGDRYIPHDYGREYRDREPFAGRSSRQRSLSPEPYPPRPRGGGSVRPAPPRSPPRGRGRHPLPPLPPPPARGGSKNKRGGSRGGKGAKNSDNRDVYRPMPSAAKRAWDKHRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.18
4 0.23
5 0.29
6 0.36
7 0.43
8 0.52
9 0.61
10 0.7
11 0.78
12 0.82
13 0.83
14 0.84
15 0.87
16 0.84
17 0.79
18 0.75
19 0.73
20 0.67
21 0.57
22 0.49
23 0.4
24 0.33
25 0.28
26 0.21
27 0.13
28 0.09
29 0.08
30 0.07
31 0.05
32 0.04
33 0.04
34 0.04
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.09
39 0.1
40 0.12
41 0.13
42 0.14
43 0.16
44 0.21
45 0.24
46 0.3
47 0.35
48 0.37
49 0.42
50 0.43
51 0.49
52 0.54
53 0.6
54 0.64
55 0.66
56 0.74
57 0.79
58 0.86
59 0.85
60 0.85
61 0.8
62 0.75
63 0.7
64 0.62
65 0.53
66 0.45
67 0.4
68 0.3
69 0.27
70 0.23
71 0.21
72 0.19
73 0.18
74 0.17
75 0.13
76 0.15
77 0.16
78 0.17
79 0.16
80 0.16
81 0.18
82 0.19
83 0.21
84 0.19
85 0.17
86 0.15
87 0.19
88 0.19
89 0.19
90 0.18
91 0.16
92 0.16
93 0.15
94 0.15
95 0.1
96 0.09
97 0.07
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.18
102 0.2
103 0.21
104 0.2
105 0.2
106 0.17
107 0.18
108 0.18
109 0.12
110 0.12
111 0.11
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.13
118 0.11
119 0.12
120 0.13
121 0.13
122 0.15
123 0.15
124 0.16
125 0.15
126 0.16
127 0.16
128 0.13
129 0.12
130 0.1
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.1
135 0.09
136 0.11
137 0.12
138 0.14
139 0.12
140 0.14
141 0.17
142 0.19
143 0.22
144 0.24
145 0.29
146 0.29
147 0.33
148 0.35
149 0.33
150 0.35
151 0.35
152 0.31
153 0.26
154 0.24
155 0.22
156 0.19
157 0.19
158 0.17
159 0.17
160 0.18
161 0.25
162 0.33
163 0.4
164 0.45
165 0.5
166 0.57
167 0.58
168 0.59
169 0.54
170 0.46
171 0.38
172 0.34
173 0.28
174 0.2
175 0.17
176 0.16
177 0.13
178 0.12
179 0.1
180 0.09
181 0.08
182 0.06
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.11
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.1
221 0.08
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.11
232 0.12
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.14
237 0.15
238 0.14
239 0.15
240 0.15
241 0.15
242 0.15
243 0.14
244 0.15
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.17
249 0.18
250 0.16
251 0.16
252 0.14
253 0.15
254 0.16
255 0.17
256 0.11
257 0.1
258 0.18
259 0.25
260 0.29
261 0.32
262 0.34
263 0.38
264 0.38
265 0.39
266 0.32
267 0.26
268 0.25
269 0.21
270 0.19
271 0.15
272 0.13
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.08
277 0.09
278 0.11
279 0.12
280 0.14
281 0.19
282 0.22
283 0.26
284 0.27
285 0.27
286 0.25
287 0.26
288 0.24
289 0.24
290 0.23
291 0.18
292 0.17
293 0.16
294 0.15
295 0.14
296 0.18
297 0.14
298 0.13
299 0.15
300 0.15
301 0.18
302 0.23
303 0.23
304 0.23
305 0.29
306 0.29
307 0.35
308 0.36
309 0.34
310 0.31
311 0.32
312 0.3
313 0.29
314 0.3
315 0.21
316 0.21
317 0.21
318 0.18
319 0.16
320 0.15
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.11
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.11
335 0.15
336 0.21
337 0.23
338 0.26
339 0.26
340 0.27
341 0.31
342 0.31
343 0.3
344 0.3
345 0.31
346 0.29
347 0.28
348 0.27
349 0.23
350 0.24
351 0.2
352 0.23
353 0.23
354 0.32
355 0.41
356 0.49
357 0.55
358 0.64
359 0.73
360 0.74
361 0.78
362 0.76
363 0.74
364 0.71
365 0.69
366 0.62
367 0.54
368 0.47
369 0.4
370 0.32
371 0.24
372 0.18
373 0.14
374 0.1
375 0.09
376 0.06
377 0.06
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.11
382 0.12
383 0.12
384 0.13
385 0.12
386 0.08
387 0.1
388 0.13
389 0.14
390 0.14
391 0.16
392 0.15
393 0.16
394 0.16
395 0.14
396 0.11
397 0.1
398 0.09
399 0.08
400 0.11
401 0.15
402 0.16
403 0.19
404 0.22
405 0.24
406 0.27
407 0.28
408 0.32
409 0.32
410 0.31
411 0.28
412 0.27
413 0.24
414 0.21
415 0.21
416 0.14
417 0.12
418 0.11
419 0.13
420 0.12
421 0.15
422 0.22
423 0.25
424 0.31
425 0.34
426 0.37
427 0.36
428 0.38
429 0.42
430 0.4
431 0.37
432 0.32
433 0.29
434 0.26
435 0.25
436 0.24
437 0.22
438 0.24
439 0.23
440 0.24
441 0.29
442 0.3
443 0.29
444 0.3
445 0.27
446 0.2
447 0.24
448 0.22
449 0.16
450 0.17
451 0.17
452 0.17
453 0.16
454 0.16
455 0.11
456 0.11
457 0.1
458 0.09
459 0.08
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.09
465 0.15
466 0.19
467 0.27
468 0.27
469 0.28
470 0.28
471 0.29
472 0.28
473 0.24
474 0.24
475 0.19
476 0.2
477 0.23
478 0.26
479 0.26
480 0.26
481 0.3
482 0.33
483 0.37
484 0.39
485 0.39
486 0.37
487 0.4
488 0.42
489 0.37
490 0.35
491 0.3
492 0.26
493 0.24
494 0.22
495 0.17
496 0.15
497 0.13
498 0.14
499 0.11
500 0.12
501 0.16
502 0.19
503 0.25
504 0.32
505 0.41
506 0.49
507 0.58
508 0.68
509 0.7
510 0.78
511 0.81
512 0.79
513 0.76
514 0.69
515 0.65
516 0.56
517 0.5
518 0.47
519 0.44
520 0.43
521 0.38
522 0.35
523 0.3
524 0.28
525 0.31
526 0.26
527 0.25
528 0.24
529 0.27
530 0.27
531 0.28
532 0.29
533 0.25
534 0.26
535 0.26
536 0.23
537 0.19
538 0.19
539 0.21
540 0.24
541 0.25
542 0.22
543 0.22
544 0.24
545 0.3
546 0.33
547 0.37
548 0.37
549 0.43
550 0.5
551 0.5
552 0.5
553 0.49
554 0.48
555 0.47
556 0.5
557 0.46
558 0.49
559 0.52
560 0.57
561 0.54
562 0.54
563 0.56
564 0.57
565 0.63
566 0.58
567 0.6
568 0.59
569 0.66
570 0.7
571 0.65
572 0.62
573 0.56
574 0.53
575 0.52
576 0.54
577 0.53
578 0.52
579 0.58
580 0.58
581 0.62
582 0.62
583 0.56
584 0.58
585 0.58
586 0.62
587 0.62
588 0.66
589 0.69
590 0.77
591 0.81
592 0.82
593 0.8
594 0.81
595 0.79
596 0.78
597 0.73
598 0.72
599 0.71
600 0.68
601 0.64
602 0.57
603 0.56
604 0.54
605 0.54
606 0.52
607 0.58
608 0.61
609 0.67
610 0.73
611 0.72
612 0.73
613 0.71
614 0.73
615 0.72
616 0.69
617 0.69
618 0.68
619 0.66
620 0.64
621 0.68
622 0.67
623 0.67
624 0.64
625 0.64
626 0.63
627 0.63
628 0.64
629 0.6
630 0.54
631 0.53
632 0.49
633 0.42
634 0.43
635 0.43
636 0.45
637 0.43
638 0.49
639 0.49
640 0.55