Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8QQF2

Protein Details
Accession A0A0J8QQF2    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-54QGTAPEQPLKRKRGRPRKEGGPAKPKPVVLDHTGQPRKRGRPRKYPLDTTAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-46LKRKRGRPRKEGGPAKPKPVVLDHTGQPRKRGRPRK
69-107KRGRGRPRKSDSLPPKPVAAPGPEQGPEATPRRGRPRKE
128-136KRGRGRPKK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MVQGTAPEQPLKRKRGRPRKEGGPAKPKPVVLDHTGQPRKRGRPRKYPLDTTAPPAAKPQNVSDDNLQKRGRGRPRKSDSLPPKPVAAPGPEQGPEATPRRGRPRKEHGAQPAEVVPDVAAQTVMQSKRGRGRPKKSEGTIMTEEATQPVKAPSALGRGRPKKLSTATSGSANGLAQQSSASSASNPLAKMVVGSYELKCATVENEWPHVAVGMEMTILESEETYGLGFIAGFNLGIVEGTMLLAADKESLEKLYNKMSKGENRSLYGSFGSNENDGDDGDEGRTFKKRKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.79
3 0.86
4 0.86
5 0.87
6 0.88
7 0.89
8 0.9
9 0.88
10 0.88
11 0.83
12 0.8
13 0.76
14 0.66
15 0.58
16 0.53
17 0.48
18 0.42
19 0.42
20 0.4
21 0.46
22 0.53
23 0.51
24 0.54
25 0.58
26 0.63
27 0.68
28 0.74
29 0.73
30 0.76
31 0.84
32 0.87
33 0.87
34 0.85
35 0.81
36 0.79
37 0.72
38 0.66
39 0.65
40 0.55
41 0.46
42 0.43
43 0.41
44 0.35
45 0.35
46 0.32
47 0.33
48 0.34
49 0.37
50 0.38
51 0.43
52 0.44
53 0.5
54 0.47
55 0.4
56 0.43
57 0.5
58 0.54
59 0.55
60 0.6
61 0.63
62 0.71
63 0.78
64 0.77
65 0.79
66 0.78
67 0.78
68 0.77
69 0.67
70 0.62
71 0.53
72 0.51
73 0.43
74 0.36
75 0.28
76 0.23
77 0.24
78 0.21
79 0.21
80 0.19
81 0.18
82 0.19
83 0.19
84 0.23
85 0.24
86 0.29
87 0.39
88 0.46
89 0.51
90 0.56
91 0.62
92 0.67
93 0.69
94 0.71
95 0.69
96 0.68
97 0.62
98 0.55
99 0.46
100 0.37
101 0.31
102 0.24
103 0.14
104 0.09
105 0.09
106 0.07
107 0.05
108 0.04
109 0.05
110 0.1
111 0.1
112 0.14
113 0.15
114 0.18
115 0.25
116 0.32
117 0.42
118 0.47
119 0.56
120 0.61
121 0.69
122 0.73
123 0.67
124 0.68
125 0.6
126 0.57
127 0.49
128 0.4
129 0.33
130 0.26
131 0.24
132 0.17
133 0.16
134 0.09
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.14
142 0.16
143 0.21
144 0.3
145 0.34
146 0.38
147 0.41
148 0.4
149 0.39
150 0.41
151 0.39
152 0.34
153 0.34
154 0.32
155 0.31
156 0.31
157 0.25
158 0.22
159 0.19
160 0.15
161 0.11
162 0.09
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.09
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.1
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.16
191 0.16
192 0.19
193 0.19
194 0.19
195 0.19
196 0.17
197 0.15
198 0.11
199 0.08
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.11
239 0.14
240 0.16
241 0.25
242 0.29
243 0.3
244 0.34
245 0.4
246 0.46
247 0.51
248 0.58
249 0.53
250 0.53
251 0.55
252 0.51
253 0.46
254 0.39
255 0.33
256 0.25
257 0.22
258 0.21
259 0.18
260 0.18
261 0.16
262 0.15
263 0.13
264 0.14
265 0.13
266 0.11
267 0.11
268 0.13
269 0.13
270 0.15
271 0.24