Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8RDD3

Protein Details
Accession A0A0J8RDD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
190-216ISAVKKVPPKAKGRKRRREADKPLSGLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-209KKVPPKAKGRKRRREA
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, mito 5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006164  Ku70/Ku80_beta-barrel_dom  
IPR024193  Ku80  
IPR036494  Ku_C_sf  
IPR014893  Ku_PK_bind  
IPR016194  SPOC-like_C_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000781  C:chromosome, telomeric region  
GO:0043564  C:Ku70:Ku80 complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0042162  F:telomeric DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006303  P:double-strand break repair via nonhomologous end joining  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
Pfam View protein in Pfam  
PF02735  Ku  
PF08785  Ku_PK_bind  
CDD cd00873  KU80  
Amino Acid Sequences MNMSTSNVIIAQKINDKAILALSSMIHALFELEYYAIGRLVTKDGKPPLMVLLAPLIETDFECLLEVQLPFAEDTRSYRFPPLDKIVTVSGKVVKEHRNLPSDDLLETMGKYVEDMDLSEFDENGDPFQSLALEDCYSPLVHRIDQAIRWRAVHPTKPLPPVPKVLEKLSHWPEELVKKSHDSLRDLISISAVKKVPPKAKGRKRRREADKPLSGLNVDDLLRGEKRLKISPENPIPEFKQTLANTEDISAISDAVKQMSAIIEDQIRQSLGDINYDRAIEGIGTMREELIAYEEPGLYNDFIRGLKEKLLDDKLGGDRREMWWLIRKSRLGLIDQKALDISDITEEQAREFLSSRPTTV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.24
4 0.23
5 0.24
6 0.2
7 0.14
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.11
13 0.08
14 0.07
15 0.08
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.06
21 0.07
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.08
26 0.09
27 0.14
28 0.18
29 0.19
30 0.25
31 0.29
32 0.32
33 0.32
34 0.31
35 0.29
36 0.26
37 0.24
38 0.18
39 0.16
40 0.14
41 0.13
42 0.12
43 0.1
44 0.08
45 0.08
46 0.1
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.11
53 0.11
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.11
60 0.08
61 0.13
62 0.19
63 0.22
64 0.23
65 0.27
66 0.3
67 0.31
68 0.37
69 0.4
70 0.37
71 0.34
72 0.35
73 0.35
74 0.34
75 0.32
76 0.27
77 0.25
78 0.23
79 0.25
80 0.28
81 0.3
82 0.32
83 0.38
84 0.42
85 0.42
86 0.42
87 0.44
88 0.43
89 0.37
90 0.33
91 0.27
92 0.22
93 0.17
94 0.16
95 0.13
96 0.09
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.13
130 0.16
131 0.17
132 0.2
133 0.27
134 0.28
135 0.27
136 0.28
137 0.28
138 0.31
139 0.34
140 0.35
141 0.33
142 0.36
143 0.4
144 0.43
145 0.46
146 0.44
147 0.42
148 0.42
149 0.41
150 0.4
151 0.37
152 0.34
153 0.34
154 0.31
155 0.37
156 0.35
157 0.33
158 0.27
159 0.25
160 0.27
161 0.28
162 0.3
163 0.25
164 0.22
165 0.21
166 0.23
167 0.26
168 0.25
169 0.23
170 0.22
171 0.22
172 0.22
173 0.22
174 0.2
175 0.18
176 0.16
177 0.14
178 0.16
179 0.13
180 0.13
181 0.17
182 0.23
183 0.27
184 0.33
185 0.42
186 0.49
187 0.59
188 0.69
189 0.76
190 0.81
191 0.84
192 0.87
193 0.88
194 0.88
195 0.88
196 0.87
197 0.83
198 0.74
199 0.66
200 0.57
201 0.47
202 0.36
203 0.26
204 0.18
205 0.11
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.11
211 0.12
212 0.13
213 0.16
214 0.21
215 0.24
216 0.29
217 0.32
218 0.4
219 0.46
220 0.48
221 0.47
222 0.45
223 0.43
224 0.39
225 0.37
226 0.29
227 0.3
228 0.25
229 0.27
230 0.26
231 0.25
232 0.22
233 0.21
234 0.21
235 0.13
236 0.14
237 0.1
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.07
249 0.08
250 0.09
251 0.1
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.14
258 0.14
259 0.19
260 0.19
261 0.21
262 0.22
263 0.22
264 0.21
265 0.15
266 0.15
267 0.09
268 0.08
269 0.09
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.14
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.13
291 0.15
292 0.15
293 0.19
294 0.22
295 0.23
296 0.28
297 0.32
298 0.3
299 0.28
300 0.32
301 0.35
302 0.39
303 0.38
304 0.32
305 0.31
306 0.32
307 0.38
308 0.34
309 0.3
310 0.33
311 0.39
312 0.43
313 0.48
314 0.48
315 0.45
316 0.49
317 0.49
318 0.45
319 0.47
320 0.46
321 0.47
322 0.45
323 0.43
324 0.37
325 0.34
326 0.29
327 0.2
328 0.16
329 0.12
330 0.12
331 0.13
332 0.16
333 0.16
334 0.16
335 0.18
336 0.17
337 0.15
338 0.16
339 0.18
340 0.23