Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8QXY7

Protein Details
Accession A0A0J8QXY7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
410-440RTAAPRQKISHSTKKNLKSNKLKPKRLMRRKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
325-347GDRGRGRGRGRGDRGGFSGQRRG
413-440APRQKISHSTKKNLKSNKLKPKRLMRRK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13.5, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002483  PWI_dom  
IPR036483  PWI_dom_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR045137  RBM26/27  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01480  PWI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MHFTEEQAVEVKTWVIKRLEDISDADADVLADYVLALIRSDAPDEEIRKVSVENLEDFLKENTVKFVDEIFERYNPKSESAPTASVPPPALPTPAGTVPFNQSGSPSQTAQFITTPAGSSGSPGRGGFQGNAPGFGGRKRSFNDVAQGGAEHDSHHRSYDRPFKTMRGKRGGRGDRLAGGWDSQRPAPTAQLFAPNPQAGFRGIPPTAQPGFPPFDPNDPMAAMLALQSMGFPQLPGMPNLAQVPPLGQNQPGSPPAKVAQRCNNYDTQGFCVLGSTCPYQHGSDHLIAPPKDDEYDPTKSNILTDRPLSANGTNGQSLGLSRGGDRGRGRGRGRGDRGGFSGQRRGRAEFSHAGPNEDQSITTIVVEQIPEDKFNEQTVRDFFSEFAQRLSSTIDLSRYTGTSLEGVKRTAAPRQKISHSTKKNLKSNKLKPKRLMRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.24
4 0.27
5 0.33
6 0.34
7 0.32
8 0.33
9 0.29
10 0.28
11 0.27
12 0.23
13 0.17
14 0.14
15 0.12
16 0.09
17 0.06
18 0.04
19 0.04
20 0.04
21 0.05
22 0.05
23 0.04
24 0.05
25 0.08
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.14
30 0.19
31 0.22
32 0.25
33 0.25
34 0.25
35 0.25
36 0.25
37 0.24
38 0.24
39 0.24
40 0.22
41 0.22
42 0.23
43 0.22
44 0.24
45 0.21
46 0.19
47 0.18
48 0.16
49 0.17
50 0.18
51 0.18
52 0.17
53 0.17
54 0.16
55 0.17
56 0.2
57 0.2
58 0.23
59 0.26
60 0.27
61 0.32
62 0.31
63 0.32
64 0.3
65 0.3
66 0.33
67 0.34
68 0.35
69 0.29
70 0.34
71 0.32
72 0.32
73 0.3
74 0.24
75 0.22
76 0.2
77 0.21
78 0.16
79 0.16
80 0.18
81 0.19
82 0.21
83 0.18
84 0.19
85 0.22
86 0.24
87 0.24
88 0.2
89 0.19
90 0.2
91 0.25
92 0.25
93 0.22
94 0.2
95 0.23
96 0.23
97 0.23
98 0.2
99 0.16
100 0.15
101 0.14
102 0.14
103 0.12
104 0.12
105 0.1
106 0.11
107 0.13
108 0.13
109 0.14
110 0.13
111 0.15
112 0.15
113 0.16
114 0.16
115 0.15
116 0.21
117 0.19
118 0.2
119 0.19
120 0.18
121 0.18
122 0.19
123 0.24
124 0.18
125 0.22
126 0.24
127 0.3
128 0.32
129 0.34
130 0.37
131 0.3
132 0.3
133 0.26
134 0.24
135 0.18
136 0.16
137 0.14
138 0.09
139 0.11
140 0.13
141 0.13
142 0.15
143 0.15
144 0.15
145 0.22
146 0.31
147 0.31
148 0.32
149 0.33
150 0.38
151 0.48
152 0.53
153 0.55
154 0.55
155 0.55
156 0.57
157 0.66
158 0.66
159 0.6
160 0.56
161 0.49
162 0.41
163 0.38
164 0.34
165 0.24
166 0.19
167 0.16
168 0.14
169 0.14
170 0.13
171 0.14
172 0.13
173 0.14
174 0.16
175 0.16
176 0.16
177 0.15
178 0.21
179 0.2
180 0.21
181 0.23
182 0.21
183 0.2
184 0.18
185 0.18
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.17
194 0.17
195 0.16
196 0.16
197 0.14
198 0.17
199 0.17
200 0.19
201 0.15
202 0.17
203 0.18
204 0.19
205 0.17
206 0.14
207 0.14
208 0.11
209 0.1
210 0.07
211 0.05
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.03
220 0.04
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.11
225 0.1
226 0.11
227 0.13
228 0.13
229 0.1
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.15
239 0.18
240 0.17
241 0.15
242 0.16
243 0.18
244 0.25
245 0.27
246 0.3
247 0.35
248 0.4
249 0.43
250 0.45
251 0.45
252 0.4
253 0.4
254 0.35
255 0.3
256 0.25
257 0.22
258 0.19
259 0.17
260 0.15
261 0.13
262 0.15
263 0.12
264 0.11
265 0.12
266 0.14
267 0.14
268 0.13
269 0.16
270 0.17
271 0.18
272 0.19
273 0.2
274 0.24
275 0.23
276 0.25
277 0.23
278 0.2
279 0.19
280 0.17
281 0.19
282 0.18
283 0.23
284 0.22
285 0.23
286 0.24
287 0.22
288 0.24
289 0.25
290 0.22
291 0.21
292 0.21
293 0.22
294 0.22
295 0.23
296 0.24
297 0.2
298 0.2
299 0.2
300 0.21
301 0.18
302 0.16
303 0.15
304 0.13
305 0.13
306 0.11
307 0.1
308 0.08
309 0.09
310 0.14
311 0.14
312 0.2
313 0.2
314 0.27
315 0.3
316 0.38
317 0.4
318 0.41
319 0.48
320 0.52
321 0.57
322 0.58
323 0.55
324 0.5
325 0.51
326 0.51
327 0.48
328 0.41
329 0.45
330 0.39
331 0.43
332 0.44
333 0.44
334 0.4
335 0.39
336 0.43
337 0.39
338 0.4
339 0.42
340 0.39
341 0.39
342 0.37
343 0.36
344 0.32
345 0.27
346 0.23
347 0.15
348 0.17
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.1
356 0.13
357 0.13
358 0.15
359 0.15
360 0.16
361 0.16
362 0.2
363 0.24
364 0.2
365 0.25
366 0.26
367 0.29
368 0.29
369 0.28
370 0.25
371 0.27
372 0.32
373 0.27
374 0.26
375 0.23
376 0.22
377 0.22
378 0.24
379 0.2
380 0.16
381 0.18
382 0.19
383 0.18
384 0.2
385 0.21
386 0.18
387 0.18
388 0.17
389 0.16
390 0.16
391 0.19
392 0.24
393 0.24
394 0.24
395 0.25
396 0.29
397 0.31
398 0.36
399 0.41
400 0.42
401 0.49
402 0.55
403 0.6
404 0.65
405 0.72
406 0.74
407 0.75
408 0.78
409 0.79
410 0.82
411 0.84
412 0.84
413 0.85
414 0.86
415 0.87
416 0.89
417 0.9
418 0.9
419 0.9
420 0.92