Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8QTX2

Protein Details
Accession A0A0J8QTX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
417-436IEARKAKDREWWARLRRVRQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
421-450KAKDREWWARLRRVRQALQVKGPKKSKGAA
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 6.5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013909  NIPA/Rsm1_C  
IPR012935  Znf_C3HC-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08600  Rsm1  
PF07967  zf-C3HC  
Amino Acid Sequences MSYALASKKRKFHRVLESLSNNSNAPKPPPPKPIPKDPTVATPKSIDPTIKRVRLTPGSEPDDTVIRPSKSSLPSRSSTTSLRPNFVPWDRDRFLERLETFRRVDRWSPKPEAINEVQWAKRGWSCVDVMRVECVGGCGHSVVVKLPDDIEELEEYDSEKIEERKQVRTALVEKYVKLIVEGHGERCPWRRAGCDDSIHRLLLGKPENALKGLKERYTNLHSLAKKLPCIERIVLPQNMDMNELLKMIPPETFSTSDSESKIADAEREIPQRTSGESEETPNGGTHKDINKSVLALALFGWDLCGDKRAGLASCNACFRRLGLWMYNPKEDGSSSIYPTLDVVVEHLDYCPWVNAKTQSGSEKQPSQRSPVGSALAGWEVLERVIRNVHRRKTWSADSEAASAGNNDEISDFGEIDIEARKAKDREWWARLRRVRQALQVKGPKKSKGAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.77
3 0.78
4 0.76
5 0.72
6 0.68
7 0.6
8 0.5
9 0.43
10 0.41
11 0.34
12 0.33
13 0.37
14 0.41
15 0.47
16 0.57
17 0.63
18 0.69
19 0.72
20 0.78
21 0.76
22 0.74
23 0.72
24 0.64
25 0.66
26 0.63
27 0.58
28 0.5
29 0.46
30 0.43
31 0.41
32 0.42
33 0.37
34 0.32
35 0.4
36 0.47
37 0.49
38 0.48
39 0.47
40 0.52
41 0.55
42 0.56
43 0.55
44 0.54
45 0.54
46 0.53
47 0.51
48 0.44
49 0.39
50 0.34
51 0.31
52 0.29
53 0.24
54 0.24
55 0.26
56 0.32
57 0.36
58 0.43
59 0.45
60 0.44
61 0.46
62 0.52
63 0.53
64 0.49
65 0.46
66 0.45
67 0.48
68 0.46
69 0.46
70 0.41
71 0.4
72 0.44
73 0.45
74 0.45
75 0.39
76 0.45
77 0.43
78 0.44
79 0.45
80 0.39
81 0.36
82 0.38
83 0.35
84 0.34
85 0.37
86 0.4
87 0.38
88 0.41
89 0.43
90 0.38
91 0.45
92 0.46
93 0.5
94 0.53
95 0.57
96 0.57
97 0.58
98 0.56
99 0.55
100 0.49
101 0.44
102 0.4
103 0.38
104 0.35
105 0.32
106 0.31
107 0.26
108 0.25
109 0.23
110 0.21
111 0.19
112 0.2
113 0.21
114 0.25
115 0.24
116 0.23
117 0.22
118 0.21
119 0.18
120 0.16
121 0.14
122 0.09
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.09
147 0.1
148 0.14
149 0.2
150 0.22
151 0.27
152 0.3
153 0.33
154 0.32
155 0.34
156 0.34
157 0.31
158 0.36
159 0.32
160 0.3
161 0.29
162 0.28
163 0.24
164 0.21
165 0.18
166 0.11
167 0.16
168 0.17
169 0.17
170 0.17
171 0.18
172 0.2
173 0.23
174 0.24
175 0.2
176 0.21
177 0.22
178 0.25
179 0.3
180 0.33
181 0.34
182 0.34
183 0.37
184 0.37
185 0.34
186 0.29
187 0.25
188 0.21
189 0.22
190 0.22
191 0.16
192 0.16
193 0.18
194 0.19
195 0.19
196 0.18
197 0.13
198 0.16
199 0.19
200 0.2
201 0.2
202 0.21
203 0.24
204 0.28
205 0.29
206 0.26
207 0.3
208 0.28
209 0.3
210 0.34
211 0.31
212 0.28
213 0.29
214 0.29
215 0.24
216 0.26
217 0.24
218 0.21
219 0.24
220 0.28
221 0.26
222 0.25
223 0.24
224 0.22
225 0.22
226 0.2
227 0.15
228 0.11
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.1
238 0.12
239 0.14
240 0.13
241 0.15
242 0.18
243 0.19
244 0.19
245 0.18
246 0.15
247 0.13
248 0.13
249 0.11
250 0.09
251 0.08
252 0.11
253 0.15
254 0.18
255 0.19
256 0.19
257 0.2
258 0.2
259 0.2
260 0.2
261 0.16
262 0.17
263 0.16
264 0.18
265 0.18
266 0.18
267 0.18
268 0.15
269 0.15
270 0.11
271 0.11
272 0.14
273 0.17
274 0.2
275 0.21
276 0.22
277 0.22
278 0.22
279 0.22
280 0.19
281 0.14
282 0.11
283 0.1
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.04
289 0.05
290 0.05
291 0.07
292 0.06
293 0.07
294 0.08
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.16
299 0.17
300 0.19
301 0.25
302 0.25
303 0.24
304 0.23
305 0.24
306 0.21
307 0.21
308 0.22
309 0.2
310 0.27
311 0.35
312 0.39
313 0.4
314 0.38
315 0.34
316 0.32
317 0.28
318 0.23
319 0.21
320 0.2
321 0.2
322 0.22
323 0.22
324 0.21
325 0.2
326 0.18
327 0.12
328 0.1
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.1
338 0.09
339 0.1
340 0.13
341 0.17
342 0.21
343 0.24
344 0.26
345 0.29
346 0.32
347 0.37
348 0.39
349 0.44
350 0.47
351 0.53
352 0.51
353 0.53
354 0.54
355 0.52
356 0.5
357 0.45
358 0.41
359 0.32
360 0.3
361 0.25
362 0.2
363 0.17
364 0.13
365 0.1
366 0.08
367 0.08
368 0.1
369 0.08
370 0.09
371 0.15
372 0.21
373 0.3
374 0.39
375 0.47
376 0.53
377 0.58
378 0.63
379 0.65
380 0.69
381 0.65
382 0.62
383 0.6
384 0.54
385 0.51
386 0.45
387 0.36
388 0.28
389 0.22
390 0.17
391 0.13
392 0.1
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.1
398 0.09
399 0.08
400 0.09
401 0.08
402 0.09
403 0.11
404 0.11
405 0.12
406 0.13
407 0.2
408 0.21
409 0.22
410 0.31
411 0.38
412 0.47
413 0.53
414 0.62
415 0.64
416 0.73
417 0.81
418 0.8
419 0.8
420 0.79
421 0.76
422 0.76
423 0.78
424 0.75
425 0.77
426 0.79
427 0.75
428 0.75
429 0.76
430 0.71