FuNGI

A0A0J8QL67

Protein Details

Accession

A0A0J8QL67

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
580-604	LLSPSNWKLKRSRNKKVYRHLTTGD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015699 DNA-dir_RNA_pol1_lsu_N IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3
CDD	cd01435 RNAP_I_RPA1_N

Amino Acid Sequences

MASFTRPVSSTISGVDFEVLSDNEIKSVSVKRIHNTPTLDSFNNPVPGGLYDPALGAWGDHVCTTCRLNAWSCAGHSGHIELPVQVYNVTFFDQLFRLLKAQCIYCHRFRMSKIQINTYVCKLRLLQYGLVEEASTIGTMELRKGKHNKEDGESDSSEDEDEEDLIDRRNAYVQKCISGLASYKTRQNYMKMAKNPAAAEMRRNLVRDFLKDVASVKKCASCSGISPPYRRDRYSKIFRKSLPQKAKAAMVAAGFQIPNPLVLMEEANRLSKKHKTIQKEDSVNGIIDDGNISVITETHGAEQQVSMGNAVLAAVEDTGSSEIGGQLDDSQQYIPSSEVYASVRFLFEKEQEILDLVYDSRPGSGRRSHVNADMFFIKNLLVPPNKYRPAAQQGPGQIMEAQQNTSFTRILKLCDQINQISRERQGDNGESISRIRSYRDLLHAIVQLQDAVNSLIDRDRNPAQGAAGIQNEDGIKQRLEKKDGLFRKNMMGKRVNFAARSVISPDPNIETNEIGIPLVFAKKLTYPEPVTNHNYWELKQAVINGPDIYPGAAAVENELGQVVNLKFKSVDERIAIANMLLSPSNWKLKRSRNKKVYRHLTTGDVVLMNRQPTLHKPSIMGHRARVLTGERTIRMHYANCNTYNADFDGDEMNLHFPQNEIARAEAMQLADTDHQYLVATSGKPLRGLIQDHISMGTWFTSRDSLFDEEDYHQLLYSCLRPENSHTVSEKIELMPPTILKPKPRWTGKQIISTILKNITPENRAGLNLIGKSSTPGDRWEIGSEEGKVIVKDGELLCGSCKCAPLLVAWMIFG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.21
3	0.15
4	0.13
5	0.15
6	0.12
7	0.12
8	0.14
9	0.14
10	0.13
11	0.14
12	0.14
13	0.14
14	0.19
15	0.23
16	0.29
17	0.33
18	0.36
19	0.44
20	0.49
21	0.52
22	0.52
23	0.51
24	0.51
25	0.52
26	0.5
27	0.43
28	0.42
29	0.41
30	0.4
31	0.35
32	0.27
33	0.23
34	0.22
35	0.24
36	0.21
37	0.17
38	0.13
39	0.13
40	0.13
41	0.12
42	0.11
43	0.07
44	0.08
45	0.08
46	0.09
47	0.09
48	0.11
49	0.11
50	0.14
51	0.16
52	0.17
53	0.18
54	0.21
55	0.24
56	0.28
57	0.31
58	0.31
59	0.3
60	0.33
61	0.3
62	0.28
63	0.26
64	0.24
65	0.21
66	0.21
67	0.2
68	0.16
69	0.17
70	0.17
71	0.17
72	0.14
73	0.12
74	0.11
75	0.12
76	0.13
77	0.12
78	0.11
79	0.13
80	0.14
81	0.17
82	0.17
83	0.18
84	0.2
85	0.2
86	0.24
87	0.25
88	0.27
89	0.28
90	0.35
91	0.4
92	0.43
93	0.5
94	0.5
95	0.51
96	0.52
97	0.57
98	0.58
99	0.61
100	0.59
101	0.59
102	0.62
103	0.62
104	0.62
105	0.57
106	0.53
107	0.45
108	0.43
109	0.37
110	0.35
111	0.38
112	0.38
113	0.35
114	0.32
115	0.33
116	0.32
117	0.3
118	0.24
119	0.17
120	0.13
121	0.11
122	0.07
123	0.06
124	0.05
125	0.07
126	0.07
127	0.11
128	0.16
129	0.17
130	0.25
131	0.33
132	0.39
133	0.47
134	0.54
135	0.55
136	0.55
137	0.6
138	0.56
139	0.55
140	0.49
141	0.42
142	0.35
143	0.3
144	0.25
145	0.19
146	0.15
147	0.09
148	0.09
149	0.07
150	0.08
151	0.09
152	0.1
153	0.11
154	0.1
155	0.1
156	0.16
157	0.19
158	0.2
159	0.27
160	0.27
161	0.28
162	0.28
163	0.28
164	0.24
165	0.22
166	0.22
167	0.19
168	0.23
169	0.23
170	0.28
171	0.29
172	0.33
173	0.35
174	0.37
175	0.42
176	0.45
177	0.52
178	0.52
179	0.57
180	0.56
181	0.56
182	0.52
183	0.48
184	0.46
185	0.38
186	0.37
187	0.33
188	0.33
189	0.32
190	0.33
191	0.29
192	0.29
193	0.3
194	0.29
195	0.31
196	0.28
197	0.27
198	0.26
199	0.28
200	0.3
201	0.3
202	0.29
203	0.26
204	0.28
205	0.27
206	0.27
207	0.28
208	0.21
209	0.21
210	0.28
211	0.35
212	0.35
213	0.38
214	0.44
215	0.5
216	0.54
217	0.53
218	0.5
219	0.51
220	0.56
221	0.64
222	0.67
223	0.65
224	0.68
225	0.67
226	0.72
227	0.73
228	0.74
229	0.73
230	0.69
231	0.66
232	0.61
233	0.61
234	0.52
235	0.43
236	0.34
237	0.25
238	0.2
239	0.15
240	0.14
241	0.11
242	0.1
243	0.1
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.06
248	0.05
249	0.06
250	0.07
251	0.07
252	0.1
253	0.1
254	0.13
255	0.14
256	0.15
257	0.18
258	0.23
259	0.28
260	0.34
261	0.4
262	0.45
263	0.54
264	0.62
265	0.68
266	0.66
267	0.61
268	0.56
269	0.51
270	0.42
271	0.33
272	0.25
273	0.15
274	0.11
275	0.1
276	0.06
277	0.05
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.05
283	0.05
284	0.06
285	0.07
286	0.08
287	0.08
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.08
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.04
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.05
312	0.04
313	0.05
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.07
324	0.07
325	0.08
326	0.09
327	0.09
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.09
332	0.1
333	0.1
334	0.1
335	0.12
336	0.13
337	0.12
338	0.12
339	0.12
340	0.12
341	0.1
342	0.09
343	0.06
344	0.05
345	0.06
346	0.05
347	0.06
348	0.07
349	0.08
350	0.12
351	0.16
352	0.19
353	0.22
354	0.26
355	0.27
356	0.31
357	0.33
358	0.3
359	0.28
360	0.28
361	0.24
362	0.2
363	0.19
364	0.14
365	0.11
366	0.12
367	0.13
368	0.12
369	0.14
370	0.18
371	0.26
372	0.28
373	0.28
374	0.29
375	0.3
376	0.37
377	0.39
378	0.37
379	0.34
380	0.32
381	0.34
382	0.32
383	0.27
384	0.19
385	0.16
386	0.16
387	0.12
388	0.12
389	0.1
390	0.11
391	0.11
392	0.12
393	0.11
394	0.09
395	0.12
396	0.13
397	0.15
398	0.16
399	0.18
400	0.18
401	0.21
402	0.23
403	0.22
404	0.25
405	0.27
406	0.26
407	0.26
408	0.27
409	0.26
410	0.24
411	0.24
412	0.22
413	0.2
414	0.19
415	0.18
416	0.17
417	0.14
418	0.14
419	0.13
420	0.12
421	0.11
422	0.11
423	0.12
424	0.14
425	0.17
426	0.2
427	0.22
428	0.21
429	0.23
430	0.23
431	0.21
432	0.19
433	0.16
434	0.12
435	0.1
436	0.09
437	0.07
438	0.06
439	0.06
440	0.04
441	0.05
442	0.06
443	0.07
444	0.08
445	0.11
446	0.13
447	0.15
448	0.15
449	0.15
450	0.14
451	0.14
452	0.15
453	0.13
454	0.12
455	0.1
456	0.09
457	0.1
458	0.1
459	0.09
460	0.1
461	0.09
462	0.09
463	0.13
464	0.2
465	0.23
466	0.27
467	0.3
468	0.32
469	0.4
470	0.47
471	0.48
472	0.43
473	0.41
474	0.44
475	0.48
476	0.47
477	0.44
478	0.43
479	0.4
480	0.41
481	0.44
482	0.39
483	0.33
484	0.31
485	0.29
486	0.22
487	0.22
488	0.22
489	0.2
490	0.18
491	0.18
492	0.18
493	0.16
494	0.17
495	0.17
496	0.14
497	0.12
498	0.12
499	0.12
500	0.11
501	0.09
502	0.07
503	0.06
504	0.06
505	0.07
506	0.06
507	0.05
508	0.06
509	0.09
510	0.12
511	0.13
512	0.18
513	0.2
514	0.26
515	0.29
516	0.33
517	0.37
518	0.35
519	0.35
520	0.35
521	0.33
522	0.28
523	0.31
524	0.26
525	0.21
526	0.21
527	0.22
528	0.21
529	0.21
530	0.21
531	0.16
532	0.15
533	0.15
534	0.14
535	0.11
536	0.07
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.05
541	0.06
542	0.06
543	0.06
544	0.06
545	0.06
546	0.05
547	0.04
548	0.09
549	0.08
550	0.13
551	0.12
552	0.13
553	0.13
554	0.14
555	0.21
556	0.19
557	0.22
558	0.19
559	0.21
560	0.21
561	0.21
562	0.21
563	0.14
564	0.13
565	0.09
566	0.08
567	0.06
568	0.06
569	0.09
570	0.12
571	0.21
572	0.21
573	0.25
574	0.32
575	0.43
576	0.54
577	0.6
578	0.69
579	0.71
580	0.8
581	0.86
582	0.9
583	0.9
584	0.87
585	0.83
586	0.74
587	0.67
588	0.58
589	0.49
590	0.4
591	0.3
592	0.22
593	0.19
594	0.19
595	0.15
596	0.14
597	0.14
598	0.14
599	0.18
600	0.27
601	0.28
602	0.27
603	0.28
604	0.34
605	0.43
606	0.48
607	0.45
608	0.39
609	0.41
610	0.41
611	0.39
612	0.35
613	0.29
614	0.25
615	0.28
616	0.3
617	0.25
618	0.27
619	0.28
620	0.28
621	0.27
622	0.26
623	0.27
624	0.31
625	0.34
626	0.34
627	0.35
628	0.34
629	0.32
630	0.33
631	0.27
632	0.21
633	0.16
634	0.15
635	0.15
636	0.13
637	0.13
638	0.11
639	0.12
640	0.11
641	0.11
642	0.1
643	0.09
644	0.12
645	0.14
646	0.16
647	0.15
648	0.15
649	0.16
650	0.16
651	0.17
652	0.15
653	0.13
654	0.11
655	0.1
656	0.11
657	0.12
658	0.12
659	0.13
660	0.1
661	0.1
662	0.1
663	0.1
664	0.1
665	0.12
666	0.12
667	0.13
668	0.19
669	0.19
670	0.2
671	0.2
672	0.23
673	0.23
674	0.26
675	0.28
676	0.28
677	0.28
678	0.28
679	0.28
680	0.25
681	0.2
682	0.18
683	0.15
684	0.1
685	0.1
686	0.11
687	0.14
688	0.13
689	0.14
690	0.18
691	0.19
692	0.21
693	0.21
694	0.23
695	0.21
696	0.23
697	0.24
698	0.2
699	0.17
700	0.16
701	0.15
702	0.15
703	0.17
704	0.18
705	0.19
706	0.21
707	0.22
708	0.28
709	0.37
710	0.37
711	0.39
712	0.38
713	0.38
714	0.38
715	0.39
716	0.34
717	0.26
718	0.28
719	0.23
720	0.23
721	0.23
722	0.22
723	0.24
724	0.3
725	0.32
726	0.34
727	0.41
728	0.49
729	0.56
730	0.64
731	0.68
732	0.68
733	0.76
734	0.76
735	0.78
736	0.7
737	0.67
738	0.63
739	0.57
740	0.53
741	0.46
742	0.39
743	0.31
744	0.34
745	0.32
746	0.3
747	0.3
748	0.3
749	0.28
750	0.28
751	0.28
752	0.26
753	0.25
754	0.24
755	0.23
756	0.2
757	0.18
758	0.2
759	0.22
760	0.23
761	0.19
762	0.22
763	0.26
764	0.28
765	0.3
766	0.31
767	0.3
768	0.29
769	0.31
770	0.29
771	0.25
772	0.24
773	0.23
774	0.2
775	0.19
776	0.16
777	0.13
778	0.17
779	0.16
780	0.18
781	0.18
782	0.19
783	0.2
784	0.21
785	0.24
786	0.2
787	0.22
788	0.18
789	0.19
790	0.19
791	0.18
792	0.23
793	0.24

A0A0J8QL67

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer