Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8TXH5

Protein Details
Accession A0A0J8TXH5    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-93QDEEEAKKKRQARNEAIKRARDAHydrophilic
111-139NLDTKSWLMQHKKKQKKIEKERARRLAEEHydrophilic
285-310DISEIKVKKPKKKKAKSTRRKAVDEEBasic
367-392LAAQRRAAFKKRKKMRPEDIARQLREHydrophilic
527-547NSLQRDRQKFLLKKRQREAEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-91KKKRQARNEAIKRAR
122-135KKKQKKIEKERARR
290-305KVKKPKKKKAKSTRRK
371-382RRAAFKKRKKMR
538-562LKKRQREAEAERRARAQRERDRASG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.666, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MADALSIEQNNKIRVALGLKPLPVPGASNEYDGPVFKPSKGDEGSSSAEDEPGSTLESRIAQGYDNWKTLQDEEEAKKKRQARNEAIKRARDAAQRMAKLEGKGLGEVDDNLDTKSWLMQHKKKQKKIEKERARRLAEELAERERMAEYTSKDLAGVKVAHEIGQFDEEGEHILTLKDTTIDENEEEGDELENVNLRDVEKTKERLDLKKKRTAYDPTDYDGSGSILAQYDEEIEGKKRRHFTLDAKDITPEEREAKRQDVTSKLKTGMVNLDVVQDTMPSDYLDISEIKVKKPKKKKAKSTRRKAVDEEEIFPLPDTTETSTAGQSNGDQMDVDRAEGEGSSAPAVQKRPREDISFADDEDLQASLAAQRRAAFKKRKKMRPEDIARQLREESEQAANGMDIDTNEDDQPGLVIDETSEFVANLQRPTIPERRHRPTSESAGEEVRAESPPINVKEELEDMDIDRSYGDIEDEEELKERLLREGSQPNITTTGLEEESTLDQGLGATLAMLRQRGLVKESEASGLNSLQRDRQKFLLKKRQREAEAERRARAQRERDRASGKLDRMSARDREEYARWENKQRDQQESRSMAEIFNREYKPDVQLKYVDEHGRLMNQKEAFKHLSHQFHGKGSGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.26
4 0.31
5 0.33
6 0.34
7 0.35
8 0.34
9 0.32
10 0.28
11 0.24
12 0.19
13 0.22
14 0.22
15 0.23
16 0.23
17 0.24
18 0.25
19 0.23
20 0.22
21 0.22
22 0.22
23 0.2
24 0.25
25 0.25
26 0.32
27 0.33
28 0.34
29 0.3
30 0.34
31 0.37
32 0.33
33 0.34
34 0.26
35 0.24
36 0.22
37 0.19
38 0.15
39 0.12
40 0.13
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.14
45 0.14
46 0.15
47 0.15
48 0.13
49 0.18
50 0.26
51 0.28
52 0.29
53 0.29
54 0.29
55 0.3
56 0.31
57 0.29
58 0.25
59 0.28
60 0.31
61 0.4
62 0.43
63 0.45
64 0.51
65 0.56
66 0.59
67 0.61
68 0.66
69 0.67
70 0.73
71 0.81
72 0.85
73 0.85
74 0.83
75 0.76
76 0.7
77 0.65
78 0.6
79 0.54
80 0.53
81 0.54
82 0.51
83 0.5
84 0.5
85 0.48
86 0.42
87 0.4
88 0.33
89 0.26
90 0.24
91 0.23
92 0.19
93 0.16
94 0.16
95 0.15
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.11
101 0.1
102 0.12
103 0.14
104 0.2
105 0.29
106 0.37
107 0.48
108 0.59
109 0.69
110 0.75
111 0.82
112 0.85
113 0.87
114 0.9
115 0.91
116 0.91
117 0.91
118 0.94
119 0.93
120 0.87
121 0.77
122 0.7
123 0.65
124 0.58
125 0.52
126 0.45
127 0.39
128 0.36
129 0.34
130 0.3
131 0.24
132 0.21
133 0.17
134 0.17
135 0.15
136 0.19
137 0.2
138 0.19
139 0.19
140 0.2
141 0.19
142 0.19
143 0.17
144 0.13
145 0.16
146 0.16
147 0.17
148 0.16
149 0.16
150 0.13
151 0.14
152 0.13
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.09
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.08
167 0.09
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.11
185 0.12
186 0.17
187 0.2
188 0.24
189 0.25
190 0.32
191 0.36
192 0.42
193 0.52
194 0.58
195 0.59
196 0.64
197 0.66
198 0.62
199 0.64
200 0.63
201 0.59
202 0.58
203 0.53
204 0.47
205 0.46
206 0.42
207 0.36
208 0.28
209 0.22
210 0.13
211 0.1
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.1
222 0.15
223 0.18
224 0.23
225 0.27
226 0.28
227 0.32
228 0.37
229 0.42
230 0.47
231 0.53
232 0.51
233 0.47
234 0.47
235 0.42
236 0.38
237 0.3
238 0.22
239 0.18
240 0.17
241 0.21
242 0.23
243 0.25
244 0.26
245 0.27
246 0.29
247 0.32
248 0.37
249 0.38
250 0.38
251 0.36
252 0.38
253 0.35
254 0.34
255 0.28
256 0.22
257 0.19
258 0.16
259 0.16
260 0.13
261 0.12
262 0.11
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.12
275 0.13
276 0.14
277 0.21
278 0.26
279 0.34
280 0.45
281 0.54
282 0.6
283 0.7
284 0.79
285 0.84
286 0.9
287 0.92
288 0.93
289 0.93
290 0.9
291 0.83
292 0.75
293 0.69
294 0.67
295 0.58
296 0.49
297 0.41
298 0.33
299 0.3
300 0.26
301 0.2
302 0.11
303 0.09
304 0.08
305 0.07
306 0.08
307 0.09
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.1
313 0.08
314 0.09
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.08
333 0.11
334 0.14
335 0.19
336 0.22
337 0.27
338 0.3
339 0.32
340 0.32
341 0.32
342 0.35
343 0.31
344 0.27
345 0.23
346 0.2
347 0.17
348 0.16
349 0.13
350 0.06
351 0.05
352 0.05
353 0.07
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.12
358 0.18
359 0.23
360 0.31
361 0.39
362 0.44
363 0.54
364 0.64
365 0.71
366 0.76
367 0.81
368 0.82
369 0.83
370 0.84
371 0.83
372 0.83
373 0.82
374 0.73
375 0.65
376 0.56
377 0.46
378 0.38
379 0.29
380 0.22
381 0.15
382 0.15
383 0.13
384 0.12
385 0.11
386 0.09
387 0.09
388 0.06
389 0.05
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.07
397 0.07
398 0.05
399 0.05
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.06
407 0.05
408 0.06
409 0.1
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.12
414 0.13
415 0.2
416 0.27
417 0.29
418 0.37
419 0.46
420 0.53
421 0.6
422 0.61
423 0.61
424 0.6
425 0.62
426 0.58
427 0.51
428 0.45
429 0.39
430 0.36
431 0.31
432 0.25
433 0.18
434 0.13
435 0.12
436 0.1
437 0.11
438 0.17
439 0.19
440 0.22
441 0.21
442 0.21
443 0.22
444 0.23
445 0.22
446 0.17
447 0.15
448 0.12
449 0.14
450 0.13
451 0.11
452 0.09
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.06
457 0.05
458 0.06
459 0.08
460 0.09
461 0.09
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.12
466 0.11
467 0.13
468 0.14
469 0.15
470 0.2
471 0.27
472 0.3
473 0.33
474 0.34
475 0.32
476 0.33
477 0.31
478 0.25
479 0.19
480 0.19
481 0.15
482 0.14
483 0.13
484 0.12
485 0.13
486 0.14
487 0.12
488 0.08
489 0.08
490 0.07
491 0.07
492 0.05
493 0.04
494 0.03
495 0.04
496 0.05
497 0.06
498 0.07
499 0.07
500 0.1
501 0.13
502 0.14
503 0.17
504 0.17
505 0.18
506 0.2
507 0.21
508 0.2
509 0.2
510 0.19
511 0.18
512 0.18
513 0.19
514 0.19
515 0.19
516 0.23
517 0.3
518 0.33
519 0.34
520 0.4
521 0.48
522 0.53
523 0.63
524 0.68
525 0.7
526 0.76
527 0.81
528 0.83
529 0.77
530 0.78
531 0.77
532 0.76
533 0.78
534 0.74
535 0.68
536 0.65
537 0.66
538 0.64
539 0.62
540 0.62
541 0.61
542 0.66
543 0.69
544 0.7
545 0.7
546 0.66
547 0.66
548 0.63
549 0.57
550 0.52
551 0.51
552 0.47
553 0.47
554 0.5
555 0.47
556 0.44
557 0.45
558 0.42
559 0.43
560 0.43
561 0.45
562 0.47
563 0.5
564 0.49
565 0.55
566 0.59
567 0.63
568 0.69
569 0.68
570 0.69
571 0.68
572 0.7
573 0.71
574 0.68
575 0.61
576 0.55
577 0.51
578 0.42
579 0.41
580 0.38
581 0.32
582 0.36
583 0.34
584 0.32
585 0.35
586 0.36
587 0.38
588 0.42
589 0.4
590 0.36
591 0.4
592 0.41
593 0.41
594 0.46
595 0.43
596 0.36
597 0.36
598 0.34
599 0.37
600 0.39
601 0.38
602 0.38
603 0.38
604 0.41
605 0.41
606 0.45
607 0.42
608 0.39
609 0.44
610 0.46
611 0.49
612 0.49
613 0.55
614 0.51
615 0.51