Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3JCH8

Protein Details
Accession G3JCH8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
318-337PPAPTATSTKRKNNERFSRIHydrophilic
367-389VTKGKGFTKAKNKMKKGSFRGGMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
375-382KAKNKMKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.833, cyto 5.5, cyto_mito 4.832
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG cmt:CCM_02910  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSSPPSWLFSSNRTTTVTAAQKPTPDRSTTMGKKTSSAAAASAVPALLMDAVERFLNDHASSATHKAFREHRKAKGLASSKDAAAAAPVLVDIFAAWQQATTKSDEEDKNEESSDSSDSSDSSDDDDSSSEEEKTEVPVKQEPAKSLKRKAPESDTSDSDESDSDSESSDSDDEEEDKPQSKKQKTNEAAKEDSSSSDEMDVDSDSDSDSDSGSSSSSSGSDSDSDSDSDSDSESNSESDSDSDRDSVSSEVKKAAAVALPDSDSDSSSSDSDSDSDSSSNSSASGKSKPKKESSIKKDSSDSSVTLDRASPAEPPLPPAPTATSTKRKNNERFSRIAKDVKVEARFASNEWVPMDYSQRAHEDLIVTKGKGFTKAKNKMKKGSFRGGMIDITEKKSIYFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.36
3 0.41
4 0.43
5 0.41
6 0.43
7 0.42
8 0.45
9 0.49
10 0.54
11 0.5
12 0.45
13 0.42
14 0.42
15 0.5
16 0.51
17 0.55
18 0.54
19 0.51
20 0.5
21 0.5
22 0.49
23 0.41
24 0.34
25 0.26
26 0.21
27 0.21
28 0.2
29 0.17
30 0.12
31 0.09
32 0.08
33 0.08
34 0.06
35 0.05
36 0.04
37 0.04
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.07
42 0.08
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.11
47 0.13
48 0.16
49 0.19
50 0.23
51 0.23
52 0.24
53 0.28
54 0.37
55 0.45
56 0.54
57 0.56
58 0.6
59 0.65
60 0.67
61 0.64
62 0.65
63 0.63
64 0.55
65 0.54
66 0.48
67 0.39
68 0.39
69 0.35
70 0.26
71 0.18
72 0.16
73 0.1
74 0.07
75 0.07
76 0.05
77 0.04
78 0.04
79 0.03
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.07
86 0.1
87 0.12
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.23
92 0.24
93 0.28
94 0.3
95 0.31
96 0.3
97 0.29
98 0.28
99 0.22
100 0.21
101 0.18
102 0.14
103 0.13
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.12
117 0.1
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.13
122 0.16
123 0.15
124 0.17
125 0.21
126 0.24
127 0.3
128 0.31
129 0.31
130 0.35
131 0.43
132 0.47
133 0.5
134 0.52
135 0.53
136 0.55
137 0.57
138 0.57
139 0.55
140 0.55
141 0.52
142 0.49
143 0.46
144 0.42
145 0.37
146 0.3
147 0.22
148 0.16
149 0.13
150 0.11
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.14
165 0.15
166 0.18
167 0.27
168 0.31
169 0.37
170 0.42
171 0.52
172 0.54
173 0.64
174 0.67
175 0.64
176 0.6
177 0.54
178 0.5
179 0.39
180 0.33
181 0.25
182 0.18
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.13
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.13
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.13
272 0.2
273 0.28
274 0.35
275 0.42
276 0.49
277 0.54
278 0.62
279 0.69
280 0.72
281 0.73
282 0.77
283 0.74
284 0.71
285 0.69
286 0.61
287 0.57
288 0.48
289 0.4
290 0.33
291 0.31
292 0.28
293 0.24
294 0.23
295 0.18
296 0.17
297 0.16
298 0.14
299 0.13
300 0.17
301 0.16
302 0.2
303 0.22
304 0.23
305 0.23
306 0.23
307 0.23
308 0.23
309 0.29
310 0.32
311 0.38
312 0.44
313 0.53
314 0.6
315 0.67
316 0.73
317 0.79
318 0.82
319 0.79
320 0.79
321 0.77
322 0.76
323 0.72
324 0.69
325 0.6
326 0.54
327 0.54
328 0.53
329 0.49
330 0.42
331 0.37
332 0.35
333 0.34
334 0.3
335 0.3
336 0.24
337 0.24
338 0.24
339 0.24
340 0.2
341 0.21
342 0.24
343 0.21
344 0.22
345 0.22
346 0.24
347 0.25
348 0.24
349 0.25
350 0.23
351 0.23
352 0.28
353 0.28
354 0.25
355 0.26
356 0.3
357 0.29
358 0.34
359 0.36
360 0.38
361 0.46
362 0.57
363 0.65
364 0.71
365 0.77
366 0.78
367 0.85
368 0.86
369 0.84
370 0.83
371 0.79
372 0.71
373 0.68
374 0.61
375 0.52
376 0.44
377 0.43
378 0.36
379 0.34
380 0.34
381 0.29
382 0.27