Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8U3Y1

Protein Details
Accession A0A0J8U3Y1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-51AAPEPPSKKALRKAKKKSTAKVDDAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-43PSKKALRKAKKKS
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 13.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGDRPDSSPNASRKRKLDPDIEIDLAAPEPPSKKALRKAKKKSTAKVDDAQAITSKSETQPPPQEPTNKRSGFGIWIGNLPFSVAQDDLRNFLTTKGPFTPDEITRIHLPQGEKRNGKQLNKGFAYIDFSTSGAVQRAIALSEQLLAGRAVLIKDANNFAGRPDKPRDDGGTSMGSKTSANPPSKKIFVGNLAFDITKEMLEEHYRPCGGISHVHIATFEDSGKCKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.73
3 0.72
4 0.71
5 0.67
6 0.66
7 0.64
8 0.6
9 0.5
10 0.4
11 0.34
12 0.26
13 0.2
14 0.13
15 0.1
16 0.11
17 0.12
18 0.16
19 0.2
20 0.27
21 0.36
22 0.47
23 0.55
24 0.65
25 0.74
26 0.81
27 0.87
28 0.89
29 0.89
30 0.89
31 0.87
32 0.82
33 0.78
34 0.7
35 0.66
36 0.57
37 0.49
38 0.4
39 0.32
40 0.26
41 0.2
42 0.18
43 0.13
44 0.2
45 0.21
46 0.26
47 0.33
48 0.36
49 0.4
50 0.44
51 0.52
52 0.49
53 0.52
54 0.56
55 0.49
56 0.46
57 0.42
58 0.38
59 0.31
60 0.29
61 0.27
62 0.17
63 0.18
64 0.18
65 0.17
66 0.15
67 0.13
68 0.1
69 0.08
70 0.08
71 0.06
72 0.07
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.12
77 0.13
78 0.12
79 0.13
80 0.17
81 0.15
82 0.18
83 0.18
84 0.19
85 0.18
86 0.21
87 0.23
88 0.19
89 0.22
90 0.2
91 0.2
92 0.19
93 0.2
94 0.18
95 0.17
96 0.18
97 0.2
98 0.28
99 0.33
100 0.34
101 0.34
102 0.42
103 0.45
104 0.46
105 0.48
106 0.45
107 0.45
108 0.44
109 0.44
110 0.35
111 0.3
112 0.33
113 0.25
114 0.21
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.05
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.19
148 0.2
149 0.24
150 0.29
151 0.31
152 0.33
153 0.37
154 0.39
155 0.35
156 0.36
157 0.33
158 0.32
159 0.29
160 0.27
161 0.23
162 0.2
163 0.16
164 0.17
165 0.23
166 0.25
167 0.31
168 0.34
169 0.38
170 0.44
171 0.46
172 0.45
173 0.4
174 0.36
175 0.37
176 0.38
177 0.35
178 0.3
179 0.29
180 0.28
181 0.25
182 0.24
183 0.17
184 0.13
185 0.11
186 0.1
187 0.12
188 0.16
189 0.19
190 0.18
191 0.23
192 0.24
193 0.23
194 0.23
195 0.23
196 0.21
197 0.25
198 0.27
199 0.29
200 0.3
201 0.3
202 0.29
203 0.28
204 0.28
205 0.23
206 0.2
207 0.15