FuNGI

A0A0C2SYQ4

Protein Details

Accession

A0A0C2SYQ4

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
266-301	REINKKTKSGEKKFHKQLKSARKKARPKTSAKQANF	Hydrophilic
698-729	SSDTVRRKKKASLRDKQRKLRAHVEKMKKGAH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
264-295	HRREINKKTKSGEKKFHKQLKSARKKARPKTS
643-649	KRKKAKA
661-678	GREGRAKFGSRRGKDKEV
703-729	RRKKKASLRDKQRKLRAHVEKMKKGAH

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito_nucl 13.833, mito 9.5, cyto_nucl 9.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MVRGALLTANLPQLQNLIKRDPAAYREEFLQQWNHYNSARHLFKLNPDDQAGNFKELVTFISQVASCYPTETADFPSQLFSLLTDNYPSLSQEIKKSLLQNLVMLRKKEVISSIDLLKYLFPLLPRTSSASLRLFIRHTILSDIVSANARHKNHRLNRAMQAMLFNMIERGMEYRVTRDMDKSSSDRTADSNSEAMWAVIVAKELWKKSVWTDSKTVAIIALGCTHPNLKVQSASMHFFIGEESDEGADDTEADTGIDVRALHHRREINKKTKSGEKKFHKQLKSARKKARPKTSAKQANFPALELLRDPQSFADKVFNLLNHHDTRFTLDHKILVMQLLSRVMSVHKVCILNFYSYAMKFLHYRQPRIPSILVALAQSVNDMTPPDAIEPVIRKLAQEFVHPGVSSEVIAAGLNSIREISARQPWAMDSSLLEDLIEYRKSKDKGVITAARGLLQLYREINPSMLKKRERGKEASMSVSRAPLPFGQSNKVAVDIEGLTLLEDHFNKLHEEEGAANDTEWDGWTVNSDSSSASDSEGWINVEDEEGDIAISGSDDDLEPTDPQAEATASSRVSTLATTKILTPADFALLNDLRIQAATRTVQMSGGSASKRKLASLEANRSHTESNLLDKNVFVTEEHILGKRKKAKADYAERLASIQSGREGRAKFGSRRGKDKEVPSSSTNREKVKNKPIMMILSSDTVRRKKKASLRDKQRKLRAHVEKMKKGAH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.27
3	0.3
4	0.3
5	0.31
6	0.33
7	0.36
8	0.38
9	0.37
10	0.38
11	0.36
12	0.34
13	0.34
14	0.37
15	0.35
16	0.34
17	0.36
18	0.32
19	0.37
20	0.38
21	0.39
22	0.38
23	0.4
24	0.42
25	0.45
26	0.46
27	0.4
28	0.41
29	0.4
30	0.45
31	0.51
32	0.48
33	0.43
34	0.43
35	0.43
36	0.4
37	0.46
38	0.39
39	0.33
40	0.31
41	0.26
42	0.24
43	0.22
44	0.23
45	0.17
46	0.16
47	0.13
48	0.16
49	0.16
50	0.16
51	0.18
52	0.18
53	0.15
54	0.15
55	0.16
56	0.13
57	0.15
58	0.16
59	0.2
60	0.22
61	0.23
62	0.22
63	0.23
64	0.22
65	0.21
66	0.19
67	0.15
68	0.13
69	0.13
70	0.14
71	0.13
72	0.13
73	0.13
74	0.14
75	0.14
76	0.13
77	0.16
78	0.18
79	0.22
80	0.26
81	0.28
82	0.31
83	0.34
84	0.37
85	0.38
86	0.36
87	0.35
88	0.38
89	0.44
90	0.45
91	0.43
92	0.4
93	0.39
94	0.39
95	0.36
96	0.33
97	0.27
98	0.27
99	0.29
100	0.3
101	0.26
102	0.26
103	0.25
104	0.21
105	0.19
106	0.16
107	0.14
108	0.11
109	0.15
110	0.17
111	0.19
112	0.21
113	0.25
114	0.27
115	0.28
116	0.32
117	0.3
118	0.3
119	0.3
120	0.31
121	0.27
122	0.25
123	0.27
124	0.22
125	0.21
126	0.21
127	0.2
128	0.17
129	0.17
130	0.16
131	0.14
132	0.16
133	0.15
134	0.17
135	0.23
136	0.24
137	0.29
138	0.35
139	0.44
140	0.5
141	0.6
142	0.62
143	0.62
144	0.67
145	0.67
146	0.62
147	0.52
148	0.45
149	0.36
150	0.31
151	0.24
152	0.17
153	0.11
154	0.1
155	0.09
156	0.08
157	0.09
158	0.08
159	0.1
160	0.11
161	0.13
162	0.17
163	0.19
164	0.2
165	0.21
166	0.23
167	0.23
168	0.26
169	0.27
170	0.27
171	0.28
172	0.28
173	0.26
174	0.25
175	0.27
176	0.25
177	0.24
178	0.21
179	0.17
180	0.18
181	0.17
182	0.14
183	0.1
184	0.08
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.05
189	0.09
190	0.12
191	0.13
192	0.15
193	0.15
194	0.16
195	0.18
196	0.28
197	0.29
198	0.3
199	0.34
200	0.34
201	0.35
202	0.34
203	0.32
204	0.22
205	0.17
206	0.13
207	0.1
208	0.11
209	0.08
210	0.08
211	0.09
212	0.09
213	0.1
214	0.13
215	0.14
216	0.13
217	0.14
218	0.15
219	0.19
220	0.21
221	0.23
222	0.2
223	0.18
224	0.17
225	0.15
226	0.15
227	0.1
228	0.08
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.05
245	0.05
246	0.06
247	0.15
248	0.17
249	0.18
250	0.23
251	0.28
252	0.34
253	0.44
254	0.53
255	0.54
256	0.59
257	0.62
258	0.62
259	0.67
260	0.71
261	0.69
262	0.7
263	0.69
264	0.72
265	0.78
266	0.83
267	0.77
268	0.74
269	0.75
270	0.76
271	0.78
272	0.77
273	0.77
274	0.78
275	0.84
276	0.86
277	0.88
278	0.85
279	0.82
280	0.81
281	0.83
282	0.83
283	0.74
284	0.72
285	0.64
286	0.62
287	0.54
288	0.45
289	0.36
290	0.26
291	0.25
292	0.18
293	0.17
294	0.12
295	0.12
296	0.12
297	0.1
298	0.13
299	0.13
300	0.13
301	0.16
302	0.13
303	0.15
304	0.16
305	0.17
306	0.16
307	0.17
308	0.21
309	0.19
310	0.2
311	0.18
312	0.17
313	0.21
314	0.2
315	0.2
316	0.19
317	0.17
318	0.18
319	0.17
320	0.18
321	0.13
322	0.12
323	0.1
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.1
332	0.1
333	0.1
334	0.13
335	0.13
336	0.13
337	0.17
338	0.19
339	0.15
340	0.15
341	0.16
342	0.15
343	0.14
344	0.16
345	0.12
346	0.11
347	0.12
348	0.14
349	0.22
350	0.23
351	0.27
352	0.29
353	0.35
354	0.36
355	0.38
356	0.36
357	0.27
358	0.25
359	0.23
360	0.19
361	0.13
362	0.12
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.05
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.06
376	0.07
377	0.08
378	0.09
379	0.11
380	0.11
381	0.1
382	0.11
383	0.16
384	0.15
385	0.16
386	0.17
387	0.17
388	0.18
389	0.18
390	0.18
391	0.13
392	0.13
393	0.11
394	0.08
395	0.06
396	0.05
397	0.05
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.05
407	0.07
408	0.13
409	0.14
410	0.14
411	0.15
412	0.15
413	0.17
414	0.17
415	0.15
416	0.09
417	0.11
418	0.11
419	0.11
420	0.1
421	0.07
422	0.08
423	0.1
424	0.12
425	0.1
426	0.11
427	0.18
428	0.2
429	0.21
430	0.26
431	0.27
432	0.29
433	0.36
434	0.39
435	0.34
436	0.37
437	0.36
438	0.31
439	0.28
440	0.24
441	0.18
442	0.13
443	0.14
444	0.11
445	0.12
446	0.13
447	0.13
448	0.14
449	0.16
450	0.2
451	0.24
452	0.3
453	0.31
454	0.36
455	0.44
456	0.51
457	0.53
458	0.54
459	0.53
460	0.54
461	0.54
462	0.55
463	0.48
464	0.43
465	0.38
466	0.34
467	0.3
468	0.22
469	0.21
470	0.15
471	0.19
472	0.2
473	0.21
474	0.23
475	0.23
476	0.25
477	0.23
478	0.23
479	0.18
480	0.14
481	0.14
482	0.11
483	0.1
484	0.08
485	0.08
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.07
490	0.07
491	0.08
492	0.09
493	0.1
494	0.11
495	0.11
496	0.12
497	0.1
498	0.1
499	0.1
500	0.12
501	0.13
502	0.12
503	0.11
504	0.11
505	0.11
506	0.1
507	0.09
508	0.08
509	0.06
510	0.06
511	0.08
512	0.09
513	0.09
514	0.09
515	0.1
516	0.09
517	0.09
518	0.11
519	0.09
520	0.1
521	0.09
522	0.1
523	0.11
524	0.11
525	0.11
526	0.1
527	0.1
528	0.09
529	0.09
530	0.08
531	0.07
532	0.06
533	0.05
534	0.05
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.03
540	0.03
541	0.04
542	0.04
543	0.04
544	0.05
545	0.07
546	0.07
547	0.08
548	0.09
549	0.08
550	0.09
551	0.09
552	0.08
553	0.08
554	0.1
555	0.12
556	0.11
557	0.12
558	0.12
559	0.11
560	0.11
561	0.11
562	0.11
563	0.12
564	0.13
565	0.14
566	0.14
567	0.18
568	0.19
569	0.18
570	0.17
571	0.15
572	0.15
573	0.15
574	0.14
575	0.17
576	0.16
577	0.17
578	0.16
579	0.16
580	0.14
581	0.14
582	0.15
583	0.09
584	0.12
585	0.13
586	0.14
587	0.15
588	0.15
589	0.16
590	0.15
591	0.16
592	0.13
593	0.16
594	0.17
595	0.18
596	0.19
597	0.23
598	0.24
599	0.23
600	0.23
601	0.25
602	0.33
603	0.4
604	0.49
605	0.5
606	0.53
607	0.54
608	0.55
609	0.5
610	0.4
611	0.35
612	0.26
613	0.27
614	0.28
615	0.28
616	0.26
617	0.26
618	0.27
619	0.23
620	0.22
621	0.15
622	0.13
623	0.13
624	0.15
625	0.17
626	0.19
627	0.25
628	0.27
629	0.36
630	0.42
631	0.46
632	0.51
633	0.55
634	0.61
635	0.65
636	0.73
637	0.73
638	0.71
639	0.69
640	0.61
641	0.56
642	0.46
643	0.38
644	0.28
645	0.21
646	0.19
647	0.19
648	0.21
649	0.26
650	0.27
651	0.28
652	0.36
653	0.41
654	0.41
655	0.48
656	0.57
657	0.56
658	0.65
659	0.69
660	0.7
661	0.71
662	0.75
663	0.75
664	0.71
665	0.71
666	0.66
667	0.66
668	0.64
669	0.66
670	0.63
671	0.59
672	0.62
673	0.63
674	0.68
675	0.71
676	0.73
677	0.66
678	0.66
679	0.64
680	0.61
681	0.56
682	0.49
683	0.4
684	0.35
685	0.33
686	0.31
687	0.33
688	0.36
689	0.42
690	0.44
691	0.47
692	0.52
693	0.61
694	0.67
695	0.71
696	0.74
697	0.79
698	0.85
699	0.91
700	0.92
701	0.93
702	0.91
703	0.88
704	0.88
705	0.87
706	0.87
707	0.87
708	0.87
709	0.85

A0A0C2SYQ4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer