Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2XDP9

Protein Details
Accession A0A0C2XDP9    Localization Confidence High Confidence Score 25.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-115GNADDTRKWLKKNKKREKELAKKRQEELEQBasic
170-189AESEKDKKNKELKIKRRDYTBasic
286-310LVLILLKTKKKRPSRRKPADTDEQPHydrophilic
694-722DIQPLAKGKTEKQKKKKESKNAAQKAAESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-109RKWLKKNKKREKELAKKR
292-303KTKKKRPSRRKP
623-645HKFHGKGSGKMKTEKRLKKIAEE
700-714KGKTEKQKKKKESKN
795-796RK
803-809GSPAKKR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MSMEESISLEETNKIRISLGLKPLTEDKAPEDDKEKQAEQNFAKYKERETKDRETNDAYTSPFSRVRNRRELNASLKGATLGEADGNADDTRKWLKKNKKREKELAKKRQEELEQMDKAFEQEYTERDLEGLKVSHDFDELNEGEARVLTLKDSRILDNEEDELQNVEMAESEKDKKNKELKIKRRDYTGYDDEEFTEGNQGMKRAVLSKYDDFLEGPREMGFRLGSSVVSTKTKKEEELHQAAAAVNKSLLSIDYAKNLESSDYLREGDIGFKKPKVRAHRADELVLILLKTKKKRPSRRKPADTDEQPVESNGNEMEVDQKPIVPVERERQLDANFVDDDELQAALARSRRIKLQRAKKMTPEQLAQRIAEQRAREETETVHSMISTSVNVEEEYKEDEDESGLTFDDTSEFVRSVGLNPVAVKPEPEMAVTQEDIKRRSMSRDASMAPGDEAVEELEAGEVTVKDEDDEMAMLNDIENAIKATEAEEVAAKQRGENDTATSTEQTYGTGMAATLNILRKQGILATPSSDQKDREKIQLQRDFWLAEQRRKVARRELEKLQSRGGNKDQAQREYDNRLREQQEARDNLEAFKNYKPDINIVYYDEFGRELTPKEAWKALSHKFHGKGSGKMKTEKRLKKIAEEKKQLAMASGDTPLSMNRAFQQRQEKTGQAHFVLSVGNRGAVPQDGDFIDIQPLAKGKTEKQKKKKESKNAAQKAAESVGIMPLGGMTTVQMQSLSNGASPAPRDSASASPAPRPGFSRISSALGAETPASQGGTPVGDRERSRVAFGLKRKAGDEPVGSPAKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.23
4 0.26
5 0.28
6 0.36
7 0.37
8 0.36
9 0.39
10 0.43
11 0.43
12 0.4
13 0.35
14 0.3
15 0.34
16 0.35
17 0.35
18 0.37
19 0.4
20 0.44
21 0.48
22 0.47
23 0.44
24 0.47
25 0.53
26 0.51
27 0.54
28 0.55
29 0.54
30 0.59
31 0.54
32 0.58
33 0.6
34 0.63
35 0.62
36 0.63
37 0.68
38 0.7
39 0.73
40 0.71
41 0.66
42 0.63
43 0.58
44 0.52
45 0.44
46 0.39
47 0.35
48 0.34
49 0.33
50 0.34
51 0.4
52 0.47
53 0.54
54 0.61
55 0.63
56 0.66
57 0.68
58 0.72
59 0.7
60 0.69
61 0.63
62 0.53
63 0.49
64 0.41
65 0.34
66 0.27
67 0.2
68 0.11
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.11
78 0.2
79 0.24
80 0.3
81 0.38
82 0.49
83 0.58
84 0.7
85 0.78
86 0.81
87 0.86
88 0.91
89 0.93
90 0.93
91 0.94
92 0.94
93 0.93
94 0.89
95 0.82
96 0.8
97 0.72
98 0.68
99 0.65
100 0.63
101 0.55
102 0.49
103 0.46
104 0.38
105 0.34
106 0.28
107 0.2
108 0.14
109 0.13
110 0.15
111 0.2
112 0.21
113 0.2
114 0.19
115 0.2
116 0.17
117 0.19
118 0.17
119 0.12
120 0.14
121 0.15
122 0.16
123 0.15
124 0.14
125 0.11
126 0.18
127 0.17
128 0.17
129 0.17
130 0.16
131 0.16
132 0.15
133 0.15
134 0.1
135 0.09
136 0.08
137 0.11
138 0.12
139 0.17
140 0.19
141 0.2
142 0.22
143 0.25
144 0.25
145 0.24
146 0.25
147 0.22
148 0.21
149 0.2
150 0.18
151 0.14
152 0.13
153 0.11
154 0.09
155 0.07
156 0.08
157 0.09
158 0.11
159 0.16
160 0.22
161 0.26
162 0.29
163 0.37
164 0.44
165 0.51
166 0.59
167 0.65
168 0.69
169 0.76
170 0.83
171 0.77
172 0.77
173 0.73
174 0.67
175 0.65
176 0.6
177 0.55
178 0.47
179 0.44
180 0.38
181 0.34
182 0.29
183 0.2
184 0.18
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.13
189 0.12
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.15
194 0.17
195 0.21
196 0.23
197 0.25
198 0.25
199 0.25
200 0.22
201 0.21
202 0.22
203 0.16
204 0.15
205 0.14
206 0.13
207 0.12
208 0.13
209 0.12
210 0.08
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.1
215 0.12
216 0.12
217 0.18
218 0.19
219 0.2
220 0.25
221 0.27
222 0.29
223 0.31
224 0.37
225 0.41
226 0.45
227 0.44
228 0.38
229 0.37
230 0.35
231 0.34
232 0.26
233 0.17
234 0.11
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.1
241 0.11
242 0.14
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.16
247 0.14
248 0.11
249 0.12
250 0.11
251 0.12
252 0.13
253 0.12
254 0.13
255 0.12
256 0.17
257 0.19
258 0.22
259 0.22
260 0.25
261 0.3
262 0.33
263 0.4
264 0.44
265 0.5
266 0.54
267 0.59
268 0.64
269 0.63
270 0.6
271 0.53
272 0.44
273 0.35
274 0.26
275 0.18
276 0.12
277 0.13
278 0.16
279 0.21
280 0.27
281 0.36
282 0.46
283 0.57
284 0.66
285 0.74
286 0.81
287 0.88
288 0.91
289 0.9
290 0.87
291 0.87
292 0.79
293 0.73
294 0.64
295 0.55
296 0.45
297 0.37
298 0.3
299 0.19
300 0.15
301 0.1
302 0.07
303 0.06
304 0.05
305 0.1
306 0.1
307 0.12
308 0.11
309 0.12
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.11
314 0.13
315 0.16
316 0.22
317 0.23
318 0.24
319 0.26
320 0.26
321 0.27
322 0.25
323 0.22
324 0.16
325 0.15
326 0.14
327 0.11
328 0.1
329 0.07
330 0.07
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.08
336 0.1
337 0.11
338 0.13
339 0.19
340 0.24
341 0.33
342 0.41
343 0.5
344 0.57
345 0.64
346 0.66
347 0.68
348 0.71
349 0.68
350 0.62
351 0.56
352 0.5
353 0.48
354 0.47
355 0.39
356 0.33
357 0.31
358 0.29
359 0.28
360 0.24
361 0.19
362 0.21
363 0.23
364 0.2
365 0.17
366 0.16
367 0.17
368 0.18
369 0.17
370 0.13
371 0.11
372 0.11
373 0.1
374 0.1
375 0.07
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.06
382 0.07
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.1
406 0.09
407 0.09
408 0.1
409 0.11
410 0.12
411 0.12
412 0.11
413 0.09
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.09
419 0.1
420 0.1
421 0.13
422 0.14
423 0.16
424 0.17
425 0.18
426 0.19
427 0.19
428 0.23
429 0.25
430 0.26
431 0.26
432 0.28
433 0.28
434 0.28
435 0.27
436 0.23
437 0.17
438 0.14
439 0.11
440 0.07
441 0.07
442 0.04
443 0.04
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.03
467 0.03
468 0.04
469 0.03
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.05
474 0.05
475 0.06
476 0.06
477 0.07
478 0.09
479 0.12
480 0.11
481 0.1
482 0.14
483 0.15
484 0.17
485 0.17
486 0.17
487 0.16
488 0.17
489 0.18
490 0.15
491 0.14
492 0.13
493 0.13
494 0.11
495 0.1
496 0.09
497 0.07
498 0.07
499 0.06
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.07
504 0.09
505 0.09
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.1
510 0.12
511 0.12
512 0.11
513 0.11
514 0.13
515 0.15
516 0.18
517 0.21
518 0.2
519 0.21
520 0.24
521 0.32
522 0.32
523 0.37
524 0.41
525 0.45
526 0.53
527 0.59
528 0.56
529 0.5
530 0.5
531 0.43
532 0.36
533 0.4
534 0.35
535 0.33
536 0.36
537 0.38
538 0.44
539 0.47
540 0.5
541 0.49
542 0.53
543 0.54
544 0.56
545 0.59
546 0.61
547 0.65
548 0.63
549 0.59
550 0.55
551 0.49
552 0.48
553 0.45
554 0.43
555 0.39
556 0.45
557 0.46
558 0.46
559 0.48
560 0.45
561 0.45
562 0.46
563 0.47
564 0.45
565 0.42
566 0.45
567 0.43
568 0.45
569 0.46
570 0.44
571 0.47
572 0.45
573 0.45
574 0.43
575 0.41
576 0.37
577 0.37
578 0.31
579 0.26
580 0.26
581 0.26
582 0.22
583 0.25
584 0.24
585 0.24
586 0.25
587 0.26
588 0.24
589 0.24
590 0.25
591 0.22
592 0.21
593 0.18
594 0.15
595 0.12
596 0.12
597 0.11
598 0.11
599 0.13
600 0.16
601 0.17
602 0.19
603 0.22
604 0.22
605 0.25
606 0.29
607 0.34
608 0.4
609 0.42
610 0.48
611 0.48
612 0.49
613 0.53
614 0.5
615 0.51
616 0.51
617 0.55
618 0.51
619 0.56
620 0.59
621 0.6
622 0.67
623 0.68
624 0.67
625 0.68
626 0.66
627 0.68
628 0.73
629 0.74
630 0.74
631 0.75
632 0.71
633 0.66
634 0.67
635 0.56
636 0.47
637 0.38
638 0.29
639 0.22
640 0.2
641 0.15
642 0.12
643 0.13
644 0.11
645 0.13
646 0.11
647 0.11
648 0.14
649 0.23
650 0.24
651 0.31
652 0.41
653 0.42
654 0.47
655 0.51
656 0.5
657 0.46
658 0.51
659 0.49
660 0.39
661 0.36
662 0.31
663 0.27
664 0.24
665 0.2
666 0.17
667 0.13
668 0.13
669 0.11
670 0.12
671 0.12
672 0.11
673 0.13
674 0.1
675 0.12
676 0.12
677 0.14
678 0.14
679 0.13
680 0.14
681 0.13
682 0.13
683 0.11
684 0.13
685 0.12
686 0.16
687 0.18
688 0.23
689 0.34
690 0.45
691 0.54
692 0.64
693 0.74
694 0.8
695 0.89
696 0.92
697 0.93
698 0.93
699 0.93
700 0.94
701 0.92
702 0.89
703 0.81
704 0.72
705 0.65
706 0.55
707 0.45
708 0.34
709 0.25
710 0.18
711 0.16
712 0.14
713 0.09
714 0.07
715 0.07
716 0.06
717 0.05
718 0.04
719 0.08
720 0.08
721 0.09
722 0.09
723 0.09
724 0.1
725 0.12
726 0.13
727 0.1
728 0.1
729 0.1
730 0.13
731 0.14
732 0.16
733 0.18
734 0.17
735 0.18
736 0.21
737 0.24
738 0.26
739 0.29
740 0.29
741 0.3
742 0.35
743 0.36
744 0.34
745 0.35
746 0.36
747 0.36
748 0.36
749 0.39
750 0.36
751 0.38
752 0.36
753 0.33
754 0.28
755 0.23
756 0.22
757 0.16
758 0.14
759 0.1
760 0.11
761 0.11
762 0.09
763 0.09
764 0.1
765 0.12
766 0.11
767 0.14
768 0.17
769 0.23
770 0.24
771 0.28
772 0.35
773 0.34
774 0.37
775 0.38
776 0.41
777 0.43
778 0.5
779 0.56
780 0.52
781 0.53
782 0.51
783 0.51
784 0.5
785 0.48
786 0.44
787 0.37
788 0.4
789 0.45