Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2SWH3

Protein Details
Accession A0A0C2SWH3    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-31DAQTAREKKKQKVAFARTIAHydrophilic
117-145AEMGTVKKPSKPRKPQRGKANRPTREETLHydrophilic
553-577EKEERERWTRKPPAKRVNYRKLGIRBasic
783-807SNNYRRDKATKVKPIVKIRDKQGHLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-141HLRRRAASHDVRKVPTRLREKARAEMGTVKKPSKPRKPQRGKANRPTR
554-573KEERERWTRKPPAKRVNYRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
IPR027266  TrmE/GcvT_dom1  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MAPKRKDDTTNDAQTAREKKKQKVAFARTIAVQDSPSASAGPSTFASSLGRIPSAIDVEKFAEARAFEIGAMEDAMKNASASSTHRVWQTLPRHLRRRAASHDVRKVPTRLREKARAEMGTVKKPSKPRKPQRGKANRPTREETLLKRQRDKLWLESHLWHAKRMKMENMWGYRLAVHPTEKAYRSSHRASVHGSIIHDASYCSIIEVTGAQRIIESMLKLVCDPQAEHPAAKRNTIGSRVIHTHLYKPDTYPFDLLMPVTILWQPMCAQETDPEEGGQPHQDPKDVVRHVWLICHPASYDDAFALIQQATSLALAAAKRQQATANTEYEMEIADLRGHFNIFEIMGPKSNQVLKGALKPVSQDAPESFTQFWSALNKLPCSGSLPRNMVVGFTVIDPRLDFPPKNARVGSETTCNLVTVPSDHLAQSEIWDEPVRLNLRKPRYKKSELDHRRSMNDVPGTRLQPQRLDDRVPVLLIQHSLESSLADSQALHGWRLIFPAGWSMAFLNSLVYTGSRVGGQRERQTQAYEAGTAYYPRDYPFTQAYATYAREREKEERERWTRKPPAKRVNYRKLGIRSPFRPDWEVVLGLPELLENPDADAEFVSTQRDDSMGVSQDDNPVQPWLLQGPLTQLIFSNASDMFNRSAGLLAEVNTLRRNFNLDPLASSISGADLLKGALVLVAINMCNRGTPEDLDSIHIMDDEETTRWITIMRKNRNRTMILEPEDRSSEELELAGKKPLPASIIGYVTTGHYSLSRSKGYAIGVVSLSRMLELKAQITRLDSNNYRRDKATKVKPIVKIRDKQGHLSRVAFVSILGRDIIERRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.57
3 0.56
4 0.54
5 0.53
6 0.58
7 0.67
8 0.73
9 0.76
10 0.77
11 0.79
12 0.8
13 0.77
14 0.72
15 0.64
16 0.6
17 0.51
18 0.41
19 0.32
20 0.24
21 0.21
22 0.19
23 0.17
24 0.15
25 0.13
26 0.14
27 0.13
28 0.15
29 0.13
30 0.15
31 0.14
32 0.15
33 0.17
34 0.16
35 0.19
36 0.18
37 0.18
38 0.15
39 0.16
40 0.17
41 0.2
42 0.2
43 0.18
44 0.18
45 0.19
46 0.22
47 0.21
48 0.18
49 0.17
50 0.15
51 0.16
52 0.15
53 0.13
54 0.11
55 0.11
56 0.12
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.12
69 0.17
70 0.19
71 0.23
72 0.25
73 0.26
74 0.28
75 0.36
76 0.4
77 0.45
78 0.53
79 0.59
80 0.66
81 0.71
82 0.77
83 0.75
84 0.75
85 0.73
86 0.73
87 0.73
88 0.74
89 0.77
90 0.76
91 0.73
92 0.71
93 0.69
94 0.65
95 0.65
96 0.64
97 0.63
98 0.65
99 0.7
100 0.69
101 0.72
102 0.72
103 0.64
104 0.57
105 0.58
106 0.55
107 0.54
108 0.54
109 0.49
110 0.47
111 0.56
112 0.63
113 0.65
114 0.7
115 0.73
116 0.79
117 0.87
118 0.91
119 0.93
120 0.94
121 0.94
122 0.93
123 0.93
124 0.9
125 0.86
126 0.84
127 0.77
128 0.73
129 0.67
130 0.63
131 0.63
132 0.64
133 0.62
134 0.63
135 0.65
136 0.64
137 0.66
138 0.64
139 0.62
140 0.61
141 0.59
142 0.56
143 0.52
144 0.54
145 0.54
146 0.5
147 0.47
148 0.44
149 0.44
150 0.47
151 0.48
152 0.47
153 0.42
154 0.48
155 0.51
156 0.51
157 0.49
158 0.43
159 0.39
160 0.34
161 0.32
162 0.28
163 0.23
164 0.2
165 0.2
166 0.23
167 0.28
168 0.28
169 0.3
170 0.31
171 0.35
172 0.39
173 0.42
174 0.44
175 0.41
176 0.41
177 0.42
178 0.42
179 0.39
180 0.35
181 0.31
182 0.26
183 0.24
184 0.21
185 0.18
186 0.13
187 0.11
188 0.1
189 0.09
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.13
212 0.15
213 0.22
214 0.23
215 0.24
216 0.26
217 0.34
218 0.34
219 0.34
220 0.31
221 0.27
222 0.29
223 0.32
224 0.33
225 0.25
226 0.29
227 0.3
228 0.31
229 0.32
230 0.3
231 0.31
232 0.32
233 0.34
234 0.31
235 0.29
236 0.34
237 0.32
238 0.33
239 0.29
240 0.25
241 0.22
242 0.22
243 0.2
244 0.14
245 0.11
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.13
258 0.16
259 0.17
260 0.17
261 0.16
262 0.15
263 0.16
264 0.16
265 0.15
266 0.13
267 0.15
268 0.15
269 0.16
270 0.16
271 0.18
272 0.26
273 0.25
274 0.24
275 0.23
276 0.26
277 0.25
278 0.27
279 0.25
280 0.2
281 0.19
282 0.2
283 0.17
284 0.14
285 0.16
286 0.14
287 0.13
288 0.09
289 0.09
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.03
301 0.04
302 0.05
303 0.06
304 0.1
305 0.12
306 0.12
307 0.13
308 0.15
309 0.16
310 0.23
311 0.24
312 0.22
313 0.21
314 0.21
315 0.21
316 0.19
317 0.16
318 0.1
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.07
332 0.08
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.16
341 0.16
342 0.2
343 0.23
344 0.22
345 0.21
346 0.21
347 0.21
348 0.21
349 0.19
350 0.16
351 0.13
352 0.15
353 0.15
354 0.17
355 0.15
356 0.13
357 0.14
358 0.13
359 0.13
360 0.11
361 0.12
362 0.14
363 0.16
364 0.16
365 0.15
366 0.16
367 0.15
368 0.17
369 0.2
370 0.2
371 0.23
372 0.25
373 0.25
374 0.26
375 0.25
376 0.21
377 0.17
378 0.14
379 0.09
380 0.07
381 0.08
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.08
386 0.1
387 0.12
388 0.12
389 0.14
390 0.24
391 0.26
392 0.29
393 0.27
394 0.26
395 0.26
396 0.3
397 0.28
398 0.22
399 0.2
400 0.19
401 0.19
402 0.18
403 0.15
404 0.11
405 0.1
406 0.07
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.1
413 0.09
414 0.09
415 0.08
416 0.07
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.07
421 0.12
422 0.14
423 0.13
424 0.17
425 0.23
426 0.32
427 0.4
428 0.45
429 0.5
430 0.56
431 0.62
432 0.64
433 0.65
434 0.67
435 0.69
436 0.72
437 0.7
438 0.64
439 0.59
440 0.55
441 0.49
442 0.42
443 0.38
444 0.3
445 0.27
446 0.28
447 0.28
448 0.31
449 0.33
450 0.29
451 0.28
452 0.3
453 0.32
454 0.31
455 0.31
456 0.27
457 0.26
458 0.25
459 0.22
460 0.19
461 0.14
462 0.12
463 0.1
464 0.1
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.06
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.08
485 0.07
486 0.09
487 0.09
488 0.08
489 0.08
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.06
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.07
503 0.08
504 0.11
505 0.17
506 0.21
507 0.27
508 0.32
509 0.34
510 0.35
511 0.36
512 0.33
513 0.31
514 0.28
515 0.22
516 0.16
517 0.15
518 0.14
519 0.13
520 0.12
521 0.1
522 0.09
523 0.09
524 0.12
525 0.12
526 0.15
527 0.17
528 0.18
529 0.17
530 0.17
531 0.18
532 0.18
533 0.2
534 0.2
535 0.2
536 0.21
537 0.23
538 0.27
539 0.32
540 0.38
541 0.44
542 0.46
543 0.53
544 0.6
545 0.65
546 0.65
547 0.69
548 0.7
549 0.7
550 0.76
551 0.76
552 0.78
553 0.81
554 0.87
555 0.87
556 0.88
557 0.88
558 0.8
559 0.78
560 0.73
561 0.7
562 0.66
563 0.63
564 0.56
565 0.56
566 0.57
567 0.52
568 0.49
569 0.43
570 0.39
571 0.33
572 0.3
573 0.22
574 0.2
575 0.16
576 0.13
577 0.12
578 0.08
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.05
583 0.05
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.07
589 0.07
590 0.07
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.09
598 0.12
599 0.13
600 0.14
601 0.15
602 0.16
603 0.19
604 0.19
605 0.18
606 0.15
607 0.14
608 0.13
609 0.12
610 0.12
611 0.1
612 0.1
613 0.1
614 0.1
615 0.13
616 0.16
617 0.15
618 0.15
619 0.14
620 0.15
621 0.16
622 0.15
623 0.14
624 0.11
625 0.12
626 0.13
627 0.15
628 0.14
629 0.13
630 0.13
631 0.11
632 0.12
633 0.11
634 0.12
635 0.11
636 0.1
637 0.14
638 0.14
639 0.15
640 0.18
641 0.19
642 0.17
643 0.17
644 0.22
645 0.19
646 0.25
647 0.29
648 0.26
649 0.27
650 0.29
651 0.31
652 0.25
653 0.24
654 0.17
655 0.12
656 0.14
657 0.11
658 0.09
659 0.07
660 0.07
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.04
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.05
669 0.05
670 0.06
671 0.07
672 0.07
673 0.07
674 0.08
675 0.11
676 0.12
677 0.14
678 0.17
679 0.2
680 0.21
681 0.23
682 0.22
683 0.2
684 0.18
685 0.16
686 0.13
687 0.1
688 0.11
689 0.1
690 0.1
691 0.1
692 0.11
693 0.11
694 0.11
695 0.12
696 0.16
697 0.23
698 0.33
699 0.43
700 0.52
701 0.6
702 0.68
703 0.73
704 0.71
705 0.67
706 0.65
707 0.64
708 0.6
709 0.59
710 0.52
711 0.49
712 0.47
713 0.43
714 0.36
715 0.28
716 0.23
717 0.17
718 0.16
719 0.15
720 0.16
721 0.17
722 0.19
723 0.18
724 0.18
725 0.19
726 0.2
727 0.19
728 0.18
729 0.21
730 0.22
731 0.22
732 0.22
733 0.21
734 0.2
735 0.19
736 0.19
737 0.14
738 0.1
739 0.1
740 0.13
741 0.18
742 0.23
743 0.24
744 0.24
745 0.26
746 0.28
747 0.28
748 0.29
749 0.24
750 0.21
751 0.2
752 0.2
753 0.18
754 0.16
755 0.14
756 0.11
757 0.11
758 0.09
759 0.12
760 0.14
761 0.18
762 0.2
763 0.22
764 0.22
765 0.26
766 0.3
767 0.29
768 0.36
769 0.39
770 0.45
771 0.52
772 0.57
773 0.57
774 0.56
775 0.57
776 0.57
777 0.61
778 0.62
779 0.64
780 0.68
781 0.73
782 0.78
783 0.84
784 0.86
785 0.86
786 0.83
787 0.82
788 0.82
789 0.77
790 0.78
791 0.77
792 0.74
793 0.69
794 0.63
795 0.57
796 0.48
797 0.45
798 0.35
799 0.26
800 0.23
801 0.19
802 0.17
803 0.14
804 0.12
805 0.13