Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2XFI4

Protein Details
Accession A0A0C2XFI4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
57-89YGGPAPRRARCHRTIRYSQRKTAQRTSRKTCAHHydrophilic
583-606WVAPTNRLAKWRKRLFPELSKGERHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 6, pero 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13812  PPR_3  
Amino Acid Sequences MTACHIDAESVLIGLQYPICRHLYPSTRTCGVFEFTTLKNKMYFQGICAFQQRCSKYGGPAPRRARCHRTIRYSQRKTAQRTSRKTCAHAVRNPETQSQQWRHFGHSSFRGGTVWPCSRCSARPNTSASRRESYSLISCWTASIPLCGDLDVKNIRNELLRVLETTNSATTAWNVYTKLSHIIPDGHCSPNKPFIPFVHLHRVSRLLSRNRPQTHIQFLRIFSVLDVLRSSGGRIHAYEWNTLIDHTARGWRKARVEDWELALSLYNDMVLGRPPGATFEGDVQASKGDENHIVKPDIYTYCSLLNVAVSTRQSQAVRRAIALLNASKIPPNRITFLTLLKHYSTTRHMSGVRSTVLKMREQGFELGLDGINACLWTYGWNGRLDIVTTIYRLLRHNASPEQEGTKDVILTLRRQLEEEEYICISDDIRPDGTTFATVIQLMAHYGDLLTTLSVFVDMLYILPSQPATSNGPNLRMTPPLNTIFRAIFLGFSQNGIPPCQDKNQLPSHIRISNPPDRPHWTLKNLQAMFDAFLSLPAEIRAGRSTVYWIMNAFDVTSGQNEDVLREVWGKLEARLGAGFVVHWVAPTNRLAKWRKRLFPELSKGERGDDETEDDASIP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.1
3 0.1
4 0.11
5 0.15
6 0.18
7 0.19
8 0.23
9 0.31
10 0.37
11 0.42
12 0.47
13 0.5
14 0.52
15 0.52
16 0.5
17 0.45
18 0.4
19 0.33
20 0.3
21 0.28
22 0.25
23 0.34
24 0.34
25 0.32
26 0.31
27 0.32
28 0.32
29 0.35
30 0.33
31 0.27
32 0.33
33 0.34
34 0.35
35 0.41
36 0.39
37 0.36
38 0.44
39 0.43
40 0.37
41 0.41
42 0.4
43 0.38
44 0.45
45 0.51
46 0.51
47 0.58
48 0.67
49 0.68
50 0.75
51 0.77
52 0.77
53 0.76
54 0.79
55 0.78
56 0.78
57 0.81
58 0.84
59 0.87
60 0.87
61 0.86
62 0.84
63 0.84
64 0.82
65 0.82
66 0.81
67 0.8
68 0.82
69 0.82
70 0.82
71 0.79
72 0.75
73 0.73
74 0.73
75 0.72
76 0.67
77 0.68
78 0.65
79 0.67
80 0.66
81 0.61
82 0.54
83 0.5
84 0.55
85 0.52
86 0.52
87 0.53
88 0.52
89 0.52
90 0.54
91 0.52
92 0.5
93 0.5
94 0.49
95 0.42
96 0.41
97 0.36
98 0.32
99 0.32
100 0.32
101 0.32
102 0.29
103 0.3
104 0.32
105 0.35
106 0.37
107 0.42
108 0.44
109 0.44
110 0.48
111 0.52
112 0.59
113 0.64
114 0.67
115 0.65
116 0.6
117 0.55
118 0.51
119 0.46
120 0.41
121 0.36
122 0.31
123 0.28
124 0.24
125 0.22
126 0.2
127 0.19
128 0.17
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.11
137 0.16
138 0.19
139 0.2
140 0.2
141 0.21
142 0.21
143 0.22
144 0.22
145 0.2
146 0.19
147 0.17
148 0.17
149 0.17
150 0.18
151 0.16
152 0.17
153 0.15
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.16
166 0.14
167 0.15
168 0.14
169 0.19
170 0.2
171 0.24
172 0.26
173 0.26
174 0.27
175 0.28
176 0.3
177 0.33
178 0.35
179 0.31
180 0.3
181 0.28
182 0.34
183 0.34
184 0.37
185 0.38
186 0.39
187 0.38
188 0.37
189 0.39
190 0.34
191 0.37
192 0.4
193 0.37
194 0.43
195 0.5
196 0.58
197 0.57
198 0.6
199 0.59
200 0.56
201 0.58
202 0.54
203 0.51
204 0.46
205 0.44
206 0.42
207 0.37
208 0.31
209 0.21
210 0.21
211 0.16
212 0.13
213 0.12
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.09
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.14
223 0.17
224 0.19
225 0.2
226 0.18
227 0.17
228 0.16
229 0.16
230 0.14
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.15
235 0.16
236 0.2
237 0.24
238 0.27
239 0.3
240 0.34
241 0.35
242 0.34
243 0.37
244 0.34
245 0.33
246 0.3
247 0.26
248 0.22
249 0.2
250 0.14
251 0.1
252 0.08
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.06
275 0.06
276 0.1
277 0.12
278 0.14
279 0.16
280 0.17
281 0.17
282 0.17
283 0.18
284 0.15
285 0.14
286 0.13
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.09
292 0.08
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.09
299 0.12
300 0.12
301 0.15
302 0.22
303 0.25
304 0.25
305 0.23
306 0.25
307 0.22
308 0.23
309 0.22
310 0.16
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.14
317 0.17
318 0.18
319 0.2
320 0.2
321 0.23
322 0.22
323 0.25
324 0.24
325 0.21
326 0.21
327 0.19
328 0.2
329 0.17
330 0.19
331 0.19
332 0.21
333 0.21
334 0.22
335 0.24
336 0.24
337 0.26
338 0.25
339 0.23
340 0.19
341 0.19
342 0.2
343 0.2
344 0.2
345 0.21
346 0.21
347 0.21
348 0.21
349 0.22
350 0.18
351 0.16
352 0.15
353 0.12
354 0.09
355 0.07
356 0.06
357 0.05
358 0.04
359 0.04
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.04
364 0.06
365 0.09
366 0.12
367 0.13
368 0.13
369 0.14
370 0.14
371 0.14
372 0.12
373 0.12
374 0.1
375 0.09
376 0.11
377 0.11
378 0.12
379 0.13
380 0.16
381 0.16
382 0.17
383 0.22
384 0.24
385 0.26
386 0.26
387 0.26
388 0.26
389 0.23
390 0.23
391 0.2
392 0.17
393 0.14
394 0.12
395 0.14
396 0.13
397 0.14
398 0.18
399 0.21
400 0.2
401 0.21
402 0.22
403 0.22
404 0.24
405 0.23
406 0.21
407 0.17
408 0.17
409 0.16
410 0.15
411 0.12
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.12
416 0.12
417 0.12
418 0.13
419 0.13
420 0.11
421 0.1
422 0.09
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.1
454 0.14
455 0.16
456 0.23
457 0.25
458 0.29
459 0.3
460 0.31
461 0.3
462 0.3
463 0.29
464 0.25
465 0.28
466 0.3
467 0.3
468 0.29
469 0.29
470 0.25
471 0.25
472 0.23
473 0.18
474 0.13
475 0.12
476 0.15
477 0.13
478 0.14
479 0.14
480 0.15
481 0.16
482 0.16
483 0.17
484 0.16
485 0.19
486 0.23
487 0.28
488 0.28
489 0.33
490 0.4
491 0.47
492 0.47
493 0.49
494 0.5
495 0.49
496 0.47
497 0.47
498 0.48
499 0.48
500 0.53
501 0.52
502 0.51
503 0.53
504 0.58
505 0.6
506 0.59
507 0.57
508 0.58
509 0.6
510 0.65
511 0.59
512 0.53
513 0.47
514 0.41
515 0.35
516 0.28
517 0.22
518 0.12
519 0.13
520 0.12
521 0.1
522 0.09
523 0.08
524 0.09
525 0.08
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.12
531 0.15
532 0.19
533 0.2
534 0.19
535 0.18
536 0.19
537 0.19
538 0.19
539 0.15
540 0.11
541 0.1
542 0.1
543 0.11
544 0.12
545 0.11
546 0.14
547 0.13
548 0.14
549 0.15
550 0.14
551 0.14
552 0.14
553 0.14
554 0.13
555 0.17
556 0.18
557 0.17
558 0.21
559 0.19
560 0.2
561 0.2
562 0.19
563 0.14
564 0.13
565 0.12
566 0.09
567 0.1
568 0.08
569 0.08
570 0.1
571 0.11
572 0.14
573 0.18
574 0.21
575 0.22
576 0.32
577 0.4
578 0.48
579 0.58
580 0.65
581 0.69
582 0.74
583 0.8
584 0.81
585 0.83
586 0.83
587 0.82
588 0.78
589 0.76
590 0.68
591 0.62
592 0.55
593 0.48
594 0.42
595 0.34
596 0.32
597 0.27
598 0.27