Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2X0D8

Protein Details
Accession A0A0C2X0D8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
389-414APVGSSMRRKPARRKNHGRRPSYGHEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
394-408SMRRKPARRKNHGRR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14, nucl 12.5, cyto 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000270  PB1_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF00564  PB1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51745  PB1  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSLKAELETWAAALKAYDEQDFEKALELFSAIADSSKILTNMGLIYATMGEHKLAIEKFQEATRLDQYLAIAYFQWGVSNFLLNNFQRAFDNFDDALHHLRGNQDINYEQLGLKFRLYAAEVVFNKGICQIYRGRVQDGLDTMDIASQIKVTEEHAVIDEAIRDRGDGYTVFSVPAGVIYRPSEKKLKNVVTKDYLGKAKLVAASDPSDIYTEFSGAARLRDGITPTGIYLEDSNPLSRSATVPSANSPTPREFDLVPKAASVAESSKRKLPNGPTDYRGRTPTNVADPPVPTRSKGASSSVSPTRTGKSRGLGNLSRGPSTKRAVPGVLNIPVDAALAPEQRVSDFYDNYLDPYGGIDPGQVCPPNSSSAPRSNAAQRDAVKSPLRSAPVGSSMRRKPARRKNHGRRPSYGHEEEEGYGSGEFEEIMYEMSKIRIKIHYRGEVRGMTLMADTTFAEFMEKVTFKFDKPLTGLGIKFMDEDGVQVSLRDESDFELAIETARETTRGRSEGKLEIWCTDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.12
3 0.14
4 0.15
5 0.16
6 0.18
7 0.2
8 0.21
9 0.2
10 0.19
11 0.18
12 0.17
13 0.15
14 0.13
15 0.11
16 0.1
17 0.1
18 0.06
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.1
24 0.11
25 0.1
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.11
30 0.1
31 0.07
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.13
41 0.13
42 0.15
43 0.16
44 0.18
45 0.19
46 0.2
47 0.25
48 0.21
49 0.26
50 0.27
51 0.27
52 0.25
53 0.25
54 0.24
55 0.22
56 0.21
57 0.16
58 0.13
59 0.12
60 0.13
61 0.11
62 0.12
63 0.1
64 0.13
65 0.13
66 0.15
67 0.14
68 0.15
69 0.22
70 0.21
71 0.26
72 0.23
73 0.23
74 0.22
75 0.24
76 0.28
77 0.23
78 0.28
79 0.23
80 0.23
81 0.24
82 0.24
83 0.26
84 0.21
85 0.2
86 0.15
87 0.17
88 0.2
89 0.21
90 0.2
91 0.18
92 0.18
93 0.2
94 0.2
95 0.19
96 0.16
97 0.16
98 0.19
99 0.18
100 0.17
101 0.16
102 0.15
103 0.15
104 0.16
105 0.16
106 0.13
107 0.2
108 0.2
109 0.23
110 0.24
111 0.22
112 0.21
113 0.21
114 0.22
115 0.14
116 0.16
117 0.17
118 0.21
119 0.29
120 0.3
121 0.29
122 0.3
123 0.31
124 0.31
125 0.28
126 0.26
127 0.19
128 0.17
129 0.15
130 0.13
131 0.13
132 0.1
133 0.09
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.09
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.08
155 0.1
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.09
162 0.1
163 0.09
164 0.07
165 0.08
166 0.1
167 0.16
168 0.18
169 0.21
170 0.28
171 0.28
172 0.36
173 0.44
174 0.5
175 0.52
176 0.55
177 0.57
178 0.54
179 0.56
180 0.51
181 0.46
182 0.4
183 0.32
184 0.29
185 0.23
186 0.21
187 0.2
188 0.18
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.13
194 0.12
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.12
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.14
232 0.17
233 0.17
234 0.18
235 0.18
236 0.17
237 0.18
238 0.18
239 0.18
240 0.15
241 0.18
242 0.22
243 0.21
244 0.2
245 0.18
246 0.17
247 0.16
248 0.15
249 0.12
250 0.1
251 0.13
252 0.16
253 0.17
254 0.22
255 0.24
256 0.25
257 0.29
258 0.32
259 0.37
260 0.42
261 0.44
262 0.42
263 0.47
264 0.49
265 0.47
266 0.44
267 0.36
268 0.3
269 0.3
270 0.29
271 0.29
272 0.27
273 0.26
274 0.24
275 0.23
276 0.25
277 0.27
278 0.24
279 0.19
280 0.2
281 0.2
282 0.21
283 0.21
284 0.22
285 0.19
286 0.2
287 0.25
288 0.27
289 0.26
290 0.25
291 0.25
292 0.24
293 0.26
294 0.28
295 0.26
296 0.25
297 0.28
298 0.3
299 0.35
300 0.34
301 0.35
302 0.37
303 0.36
304 0.34
305 0.3
306 0.3
307 0.28
308 0.29
309 0.28
310 0.25
311 0.25
312 0.25
313 0.25
314 0.27
315 0.27
316 0.28
317 0.24
318 0.21
319 0.19
320 0.17
321 0.16
322 0.12
323 0.08
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.13
332 0.14
333 0.14
334 0.15
335 0.17
336 0.17
337 0.19
338 0.18
339 0.13
340 0.1
341 0.11
342 0.11
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.09
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.13
352 0.15
353 0.17
354 0.17
355 0.2
356 0.22
357 0.28
358 0.31
359 0.3
360 0.32
361 0.35
362 0.39
363 0.38
364 0.39
365 0.34
366 0.36
367 0.37
368 0.4
369 0.37
370 0.33
371 0.34
372 0.33
373 0.33
374 0.28
375 0.28
376 0.25
377 0.28
378 0.31
379 0.31
380 0.35
381 0.36
382 0.45
383 0.51
384 0.56
385 0.59
386 0.66
387 0.74
388 0.77
389 0.85
390 0.86
391 0.9
392 0.93
393 0.89
394 0.85
395 0.82
396 0.79
397 0.77
398 0.69
399 0.61
400 0.53
401 0.49
402 0.43
403 0.36
404 0.28
405 0.19
406 0.15
407 0.13
408 0.11
409 0.08
410 0.07
411 0.05
412 0.05
413 0.04
414 0.05
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.1
419 0.13
420 0.14
421 0.18
422 0.25
423 0.29
424 0.37
425 0.45
426 0.52
427 0.52
428 0.55
429 0.56
430 0.5
431 0.47
432 0.41
433 0.32
434 0.23
435 0.2
436 0.17
437 0.12
438 0.11
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.08
443 0.09
444 0.08
445 0.09
446 0.15
447 0.16
448 0.15
449 0.21
450 0.23
451 0.22
452 0.3
453 0.31
454 0.3
455 0.32
456 0.35
457 0.34
458 0.37
459 0.36
460 0.32
461 0.32
462 0.26
463 0.24
464 0.2
465 0.17
466 0.12
467 0.13
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.11
473 0.11
474 0.12
475 0.11
476 0.11
477 0.11
478 0.14
479 0.14
480 0.13
481 0.13
482 0.12
483 0.12
484 0.12
485 0.1
486 0.11
487 0.11
488 0.13
489 0.13
490 0.19
491 0.25
492 0.29
493 0.32
494 0.34
495 0.38
496 0.43
497 0.46
498 0.48
499 0.42