Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B2W0M4

Protein Details
Accession B2W0M4    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MSDNERPRDRYRERDNRREPREAREBasic
28-51GTPTERRNRSRSPRERGGRRDAPRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-122RDRYRERDNRREPREARERGGTPTERRNRSRSPRERGGRRDAPRYRSRSPFRRDDHESGGRGSDRSRGGHDRGRGRDDRRGGRDDRANAGDRSPQPPKGPRGGIRGPFGGAAKPP
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSDNERPRDRYRERDNRREPREARERGGTPTERRNRSRSPRERGGRRDAPRYRSRSPFRRDDHESGGRGSDRSRGGHDRGRGRDDRRGGRDDRANAGDRSPQPPKGPRGGIRGPFGGAAKPPTGPRASVDAPAKEETPDVEMKDERQKPEDMDDDMWEMLKVMGFGGFKSTKNTKVPGNDKNFGVRKDKQLQARQYMNRQGGFNRPLSPSRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.88
3 0.88
4 0.88
5 0.88
6 0.8
7 0.79
8 0.8
9 0.74
10 0.68
11 0.65
12 0.6
13 0.55
14 0.6
15 0.56
16 0.51
17 0.56
18 0.6
19 0.61
20 0.63
21 0.65
22 0.67
23 0.72
24 0.78
25 0.78
26 0.77
27 0.8
28 0.85
29 0.87
30 0.84
31 0.84
32 0.82
33 0.77
34 0.78
35 0.75
36 0.73
37 0.73
38 0.73
39 0.69
40 0.7
41 0.73
42 0.72
43 0.72
44 0.74
45 0.7
46 0.7
47 0.72
48 0.67
49 0.66
50 0.62
51 0.57
52 0.48
53 0.45
54 0.38
55 0.3
56 0.26
57 0.23
58 0.19
59 0.19
60 0.23
61 0.25
62 0.29
63 0.33
64 0.39
65 0.41
66 0.43
67 0.48
68 0.48
69 0.47
70 0.5
71 0.52
72 0.53
73 0.5
74 0.51
75 0.47
76 0.47
77 0.49
78 0.44
79 0.41
80 0.37
81 0.35
82 0.3
83 0.29
84 0.29
85 0.25
86 0.28
87 0.26
88 0.26
89 0.27
90 0.32
91 0.34
92 0.34
93 0.36
94 0.35
95 0.39
96 0.42
97 0.42
98 0.39
99 0.36
100 0.31
101 0.28
102 0.24
103 0.18
104 0.13
105 0.12
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.14
113 0.18
114 0.18
115 0.23
116 0.25
117 0.23
118 0.25
119 0.26
120 0.25
121 0.19
122 0.18
123 0.14
124 0.14
125 0.14
126 0.12
127 0.14
128 0.14
129 0.16
130 0.26
131 0.3
132 0.29
133 0.3
134 0.31
135 0.3
136 0.34
137 0.34
138 0.28
139 0.25
140 0.24
141 0.23
142 0.21
143 0.2
144 0.15
145 0.12
146 0.09
147 0.08
148 0.06
149 0.05
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.13
154 0.15
155 0.15
156 0.21
157 0.25
158 0.29
159 0.33
160 0.36
161 0.37
162 0.44
163 0.52
164 0.55
165 0.6
166 0.58
167 0.55
168 0.61
169 0.61
170 0.55
171 0.55
172 0.5
173 0.51
174 0.56
175 0.6
176 0.61
177 0.65
178 0.69
179 0.7
180 0.74
181 0.72
182 0.72
183 0.75
184 0.71
185 0.66
186 0.6
187 0.54
188 0.54
189 0.52
190 0.46
191 0.42
192 0.4