FuNGI

A0A0C2WHY2

Protein Details

Accession

A0A0C2WHY2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
297-316	YAEPKRQRKKATTHLLEKKV	Hydrophilic
1023-1048	ERSTYPRRVTRTWNRKGRKLGKDDDG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1037-1040	RKGR

Subcellular Location(s)

nucl 8, pero 8, cyto 7, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3

Amino Acid Sequences

MQFFEHQLKLLGHILDDNGIRMDPHKVDNVLNWKTPTNKDLLASFLGAVGYLADNCEGIRIPMGVLTPLSGARREWRWGHTEQRAFDEIKTIVSKWRENRRVSLNYSPGAEPIWLTTDASLTGASGYVSQGNDWRTARIVVFWSGKFNSAQQNYPVHEQELLAIVESLKRFRGLLHGASFSIKTDHRTLEHFMTQKSLSARQHRWLDVLNEFSFKVYYVPGEANVVADALSRIYSDEPTGIVRAESEYVGKDDEDSDNENLLRTSRPIYTGAAAIIPDGTVRRSARLAEASAEQRVYAEPKRQRKKATTHLLEKKVGTSSRIPERVKAKVAVATKASPVLRTASGIGIDIPDCFRAKYGEDPFFAKILAKPTEYADFREEDGLILKRVGDVEALCIPDITISGRNVREIIIGHVHSLLAHLGYKKTLQVLREETWWQTMVADVEEFCRTCMTCNTSKPNNQRPMGLLKTLEVPRRPWQHIGVDFVGPLPESKNRNGSYDMICVIIDQLTSMIHLTPTKQTYGARQVAEVIFDSVYKLHGLPERIISDRDSLFTSTFWRKLHELLGVEIKLSTAYHPQTDGATERANRTMTQMLRQCVVPDQRNWAEKLPAIEFAMNAARSETTGFSPFFLNYGRQPRTMIWDSKSGYPGIVEFASQMKSALMLAHDAIIDARVKQTTHANRSRRKADFDEGDLVYLSTKNLQLPKGHARKLCPKYIGPFRITRIASPGSSYELELPRELKARGLHPVFHASLLRKHYPNDDRRFPGRQLHQLPGLGQEPKEWHIDRILSHSGRGRDALFEVQWSTGDVTWVPYIELKELAVLDEYLEAMGVTHPKELGTGTTEPAIGVAYARLGGKSYRRSFDTDTTQMSRWGPSRQGVLPYPCRSLKGNETIGRTSKHIPSSALAKVMHPHRDSRHTGPRYPTGPRYSGYGGSRDERRELVISDRAFDAMVGQQNKMFQLVHTLLRNTTRPTMGQSTYHATPNAGPRQPNTNPRRAFGRENLPRAPLKDRIGGFTHPDRGGERSTYPRRVTRTWNRKGRKLGKDDDGLKEGEQQGVTAEEVDSVGVGNHEVMDNYEQDDELMDLDAEGETDPEAEEFRSGWADEQDYDAIAPVPDN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.2
3	0.2
4	0.18
5	0.14
6	0.14
7	0.14
8	0.14
9	0.19
10	0.18
11	0.21
12	0.25
13	0.26
14	0.28
15	0.35
16	0.43
17	0.42
18	0.44
19	0.43
20	0.42
21	0.46
22	0.49
23	0.45
24	0.4
25	0.38
26	0.35
27	0.34
28	0.34
29	0.3
30	0.27
31	0.23
32	0.19
33	0.16
34	0.14
35	0.12
36	0.09
37	0.07
38	0.07
39	0.07
40	0.07
41	0.07
42	0.07
43	0.09
44	0.08
45	0.08
46	0.09
47	0.09
48	0.09
49	0.11
50	0.12
51	0.11
52	0.11
53	0.11
54	0.11
55	0.13
56	0.15
57	0.14
58	0.15
59	0.2
60	0.24
61	0.3
62	0.33
63	0.35
64	0.39
65	0.44
66	0.52
67	0.56
68	0.58
69	0.54
70	0.56
71	0.55
72	0.51
73	0.45
74	0.42
75	0.32
76	0.3
77	0.3
78	0.24
79	0.27
80	0.31
81	0.38
82	0.41
83	0.52
84	0.57
85	0.59
86	0.66
87	0.68
88	0.7
89	0.69
90	0.7
91	0.64
92	0.58
93	0.57
94	0.5
95	0.41
96	0.35
97	0.28
98	0.19
99	0.15
100	0.16
101	0.13
102	0.13
103	0.13
104	0.12
105	0.12
106	0.13
107	0.11
108	0.07
109	0.07
110	0.07
111	0.06
112	0.06
113	0.07
114	0.09
115	0.1
116	0.1
117	0.14
118	0.16
119	0.22
120	0.22
121	0.23
122	0.21
123	0.24
124	0.23
125	0.22
126	0.23
127	0.23
128	0.27
129	0.26
130	0.3
131	0.29
132	0.3
133	0.28
134	0.29
135	0.33
136	0.31
137	0.34
138	0.34
139	0.39
140	0.4
141	0.44
142	0.42
143	0.34
144	0.31
145	0.28
146	0.24
147	0.22
148	0.19
149	0.14
150	0.12
151	0.11
152	0.14
153	0.14
154	0.15
155	0.12
156	0.13
157	0.13
158	0.13
159	0.2
160	0.22
161	0.27
162	0.29
163	0.29
164	0.29
165	0.31
166	0.31
167	0.24
168	0.23
169	0.19
170	0.19
171	0.21
172	0.24
173	0.24
174	0.27
175	0.31
176	0.33
177	0.38
178	0.37
179	0.33
180	0.34
181	0.33
182	0.33
183	0.32
184	0.34
185	0.35
186	0.41
187	0.45
188	0.49
189	0.55
190	0.53
191	0.52
192	0.48
193	0.46
194	0.4
195	0.41
196	0.34
197	0.29
198	0.27
199	0.25
200	0.22
201	0.18
202	0.15
203	0.1
204	0.09
205	0.1
206	0.11
207	0.11
208	0.13
209	0.13
210	0.12
211	0.11
212	0.1
213	0.08
214	0.07
215	0.07
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.06
220	0.07
221	0.08
222	0.08
223	0.09
224	0.09
225	0.1
226	0.11
227	0.11
228	0.09
229	0.09
230	0.1
231	0.1
232	0.1
233	0.1
234	0.1
235	0.11
236	0.12
237	0.11
238	0.1
239	0.11
240	0.12
241	0.13
242	0.16
243	0.16
244	0.17
245	0.18
246	0.17
247	0.16
248	0.15
249	0.14
250	0.12
251	0.14
252	0.13
253	0.15
254	0.17
255	0.18
256	0.18
257	0.18
258	0.17
259	0.15
260	0.13
261	0.11
262	0.09
263	0.07
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.11
268	0.11
269	0.13
270	0.15
271	0.16
272	0.19
273	0.21
274	0.22
275	0.19
276	0.23
277	0.23
278	0.23
279	0.22
280	0.18
281	0.16
282	0.16
283	0.18
284	0.18
285	0.24
286	0.31
287	0.42
288	0.52
289	0.58
290	0.64
291	0.68
292	0.74
293	0.75
294	0.78
295	0.76
296	0.77
297	0.8
298	0.79
299	0.74
300	0.65
301	0.56
302	0.5
303	0.42
304	0.35
305	0.3
306	0.3
307	0.36
308	0.43
309	0.42
310	0.43
311	0.47
312	0.48
313	0.47
314	0.43
315	0.36
316	0.34
317	0.35
318	0.32
319	0.3
320	0.26
321	0.24
322	0.26
323	0.25
324	0.2
325	0.18
326	0.18
327	0.16
328	0.16
329	0.16
330	0.12
331	0.12
332	0.12
333	0.11
334	0.09
335	0.08
336	0.08
337	0.07
338	0.08
339	0.09
340	0.08
341	0.09
342	0.1
343	0.11
344	0.19
345	0.25
346	0.28
347	0.28
348	0.31
349	0.31
350	0.3
351	0.29
352	0.22
353	0.17
354	0.19
355	0.2
356	0.18
357	0.17
358	0.19
359	0.25
360	0.25
361	0.26
362	0.22
363	0.21
364	0.21
365	0.21
366	0.19
367	0.13
368	0.15
369	0.14
370	0.12
371	0.11
372	0.1
373	0.1
374	0.1
375	0.1
376	0.08
377	0.06
378	0.08
379	0.1
380	0.11
381	0.1
382	0.1
383	0.09
384	0.08
385	0.09
386	0.08
387	0.09
388	0.09
389	0.14
390	0.14
391	0.15
392	0.15
393	0.15
394	0.15
395	0.13
396	0.14
397	0.14
398	0.14
399	0.14
400	0.13
401	0.13
402	0.11
403	0.11
404	0.09
405	0.05
406	0.07
407	0.07
408	0.07
409	0.08
410	0.09
411	0.09
412	0.14
413	0.15
414	0.15
415	0.19
416	0.24
417	0.25
418	0.27
419	0.28
420	0.24
421	0.24
422	0.24
423	0.18
424	0.13
425	0.12
426	0.1
427	0.09
428	0.08
429	0.06
430	0.07
431	0.09
432	0.09
433	0.08
434	0.08
435	0.08
436	0.09
437	0.12
438	0.16
439	0.2
440	0.25
441	0.32
442	0.38
443	0.45
444	0.53
445	0.59
446	0.62
447	0.58
448	0.55
449	0.5
450	0.51
451	0.46
452	0.38
453	0.29
454	0.21
455	0.26
456	0.28
457	0.29
458	0.24
459	0.25
460	0.31
461	0.38
462	0.4
463	0.36
464	0.36
465	0.38
466	0.38
467	0.39
468	0.33
469	0.26
470	0.24
471	0.21
472	0.18
473	0.12
474	0.1
475	0.07
476	0.11
477	0.13
478	0.15
479	0.22
480	0.23
481	0.26
482	0.28
483	0.29
484	0.27
485	0.26
486	0.24
487	0.18
488	0.16
489	0.14
490	0.12
491	0.09
492	0.06
493	0.04
494	0.04
495	0.03
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.05
501	0.06
502	0.1
503	0.11
504	0.11
505	0.13
506	0.13
507	0.17
508	0.25
509	0.28
510	0.25
511	0.23
512	0.25
513	0.24
514	0.24
515	0.19
516	0.12
517	0.08
518	0.07
519	0.08
520	0.05
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.07
525	0.1
526	0.11
527	0.12
528	0.14
529	0.16
530	0.16
531	0.17
532	0.16
533	0.16
534	0.15
535	0.15
536	0.13
537	0.12
538	0.12
539	0.11
540	0.15
541	0.15
542	0.18
543	0.18
544	0.19
545	0.19
546	0.2
547	0.22
548	0.2
549	0.18
550	0.16
551	0.19
552	0.16
553	0.15
554	0.14
555	0.12
556	0.09
557	0.08
558	0.07
559	0.08
560	0.09
561	0.1
562	0.1
563	0.11
564	0.11
565	0.12
566	0.12
567	0.1
568	0.11
569	0.12
570	0.13
571	0.15
572	0.15
573	0.15
574	0.16
575	0.19
576	0.18
577	0.23
578	0.26
579	0.25
580	0.25
581	0.25
582	0.23
583	0.22
584	0.27
585	0.24
586	0.21
587	0.27
588	0.29
589	0.31
590	0.33
591	0.29
592	0.25
593	0.24
594	0.25
595	0.19
596	0.16
597	0.15
598	0.14
599	0.12
600	0.12
601	0.12
602	0.1
603	0.09
604	0.08
605	0.07
606	0.07
607	0.09
608	0.08
609	0.07
610	0.1
611	0.1
612	0.1
613	0.11
614	0.11
615	0.11
616	0.11
617	0.11
618	0.14
619	0.22
620	0.23
621	0.23
622	0.25
623	0.24
624	0.31
625	0.34
626	0.33
627	0.27
628	0.31
629	0.32
630	0.33
631	0.34
632	0.26
633	0.22
634	0.18
635	0.16
636	0.12
637	0.1
638	0.07
639	0.07
640	0.08
641	0.09
642	0.09
643	0.09
644	0.07
645	0.07
646	0.07
647	0.07
648	0.06
649	0.05
650	0.06
651	0.06
652	0.06
653	0.06
654	0.05
655	0.06
656	0.06
657	0.05
658	0.06
659	0.07
660	0.07
661	0.09
662	0.17
663	0.24
664	0.32
665	0.4
666	0.48
667	0.54
668	0.61
669	0.68
670	0.63
671	0.61
672	0.57
673	0.55
674	0.5
675	0.46
676	0.44
677	0.36
678	0.33
679	0.27
680	0.23
681	0.16
682	0.13
683	0.1
684	0.07
685	0.08
686	0.1
687	0.13
688	0.15
689	0.17
690	0.22
691	0.32
692	0.38
693	0.42
694	0.42
695	0.45
696	0.53
697	0.57
698	0.57
699	0.51
700	0.46
701	0.48
702	0.55
703	0.55
704	0.47
705	0.46
706	0.42
707	0.46
708	0.44
709	0.38
710	0.33
711	0.3
712	0.26
713	0.24
714	0.22
715	0.18
716	0.18
717	0.18
718	0.18
719	0.18
720	0.19
721	0.19
722	0.19
723	0.17
724	0.2
725	0.19
726	0.18
727	0.18
728	0.19
729	0.26
730	0.26
731	0.26
732	0.26
733	0.3
734	0.27
735	0.26
736	0.26
737	0.21
738	0.25
739	0.28
740	0.31
741	0.28
742	0.29
743	0.36
744	0.43
745	0.51
746	0.54
747	0.55
748	0.56
749	0.6
750	0.63
751	0.57
752	0.56
753	0.53
754	0.54
755	0.51
756	0.49
757	0.47
758	0.43
759	0.41
760	0.36
761	0.32
762	0.25
763	0.2
764	0.19
765	0.18
766	0.19
767	0.24
768	0.22
769	0.2
770	0.21
771	0.23
772	0.22
773	0.25
774	0.3
775	0.25
776	0.27
777	0.3
778	0.29
779	0.28
780	0.28
781	0.23
782	0.18
783	0.19
784	0.19
785	0.15
786	0.14
787	0.14
788	0.13
789	0.12
790	0.12
791	0.11
792	0.09
793	0.09
794	0.08
795	0.1
796	0.1
797	0.1
798	0.09
799	0.1
800	0.11
801	0.11
802	0.12
803	0.09
804	0.1
805	0.1
806	0.1
807	0.08
808	0.07
809	0.07
810	0.06
811	0.06
812	0.05
813	0.05
814	0.04
815	0.04
816	0.05
817	0.07
818	0.07
819	0.08
820	0.08
821	0.08
822	0.09
823	0.09
824	0.09
825	0.12
826	0.12
827	0.13
828	0.14
829	0.14
830	0.13
831	0.13
832	0.12
833	0.07
834	0.06
835	0.05
836	0.04
837	0.06
838	0.06
839	0.06
840	0.07
841	0.1
842	0.16
843	0.25
844	0.3
845	0.33
846	0.35
847	0.4
848	0.44
849	0.48
850	0.5
851	0.45
852	0.45
853	0.44
854	0.43
855	0.41
856	0.37
857	0.34
858	0.29
859	0.29
860	0.27
861	0.26
862	0.3
863	0.29
864	0.34
865	0.35
866	0.4
867	0.44
868	0.44
869	0.47
870	0.43
871	0.43
872	0.4
873	0.4
874	0.4
875	0.4
876	0.45
877	0.44
878	0.48
879	0.5
880	0.51
881	0.48
882	0.44
883	0.4
884	0.38
885	0.37
886	0.34
887	0.32
888	0.3
889	0.33
890	0.32
891	0.32
892	0.27
893	0.24
894	0.29
895	0.33
896	0.38
897	0.35
898	0.39
899	0.4
900	0.47
901	0.52
902	0.54
903	0.59
904	0.57
905	0.61
906	0.61
907	0.63
908	0.6
909	0.6
910	0.59
911	0.54
912	0.52
913	0.46
914	0.45
915	0.41
916	0.43
917	0.38
918	0.36
919	0.33
920	0.35
921	0.4
922	0.37
923	0.36
924	0.31
925	0.32
926	0.3
927	0.28
928	0.29
929	0.3
930	0.28
931	0.27
932	0.26
933	0.24
934	0.21
935	0.19
936	0.16
937	0.13
938	0.19
939	0.19
940	0.19
941	0.2
942	0.21
943	0.22
944	0.22
945	0.18
946	0.12
947	0.18
948	0.2
949	0.24
950	0.26
951	0.27
952	0.28
953	0.33
954	0.36
955	0.32
956	0.34
957	0.31
958	0.29
959	0.33
960	0.37
961	0.35
962	0.35
963	0.34
964	0.36
965	0.36
966	0.38
967	0.33
968	0.27
969	0.29
970	0.35
971	0.4
972	0.38
973	0.38
974	0.37
975	0.45
976	0.51
977	0.58
978	0.56
979	0.58
980	0.56
981	0.57
982	0.63
983	0.59
984	0.59
985	0.57
986	0.6
987	0.59
988	0.63
989	0.63
990	0.6
991	0.58
992	0.54
993	0.52
994	0.48
995	0.43
996	0.44
997	0.42
998	0.42
999	0.42
1000	0.42
1001	0.43
1002	0.41
1003	0.44
1004	0.37
1005	0.38
1006	0.35
1007	0.34
1008	0.35
1009	0.32
1010	0.31
1011	0.35
1012	0.43
1013	0.49
1014	0.53
1015	0.56
1016	0.59
1017	0.61
1018	0.67
1019	0.68
1020	0.71
1021	0.73
1022	0.78
1023	0.8
1024	0.82
1025	0.88
1026	0.88
1027	0.87
1028	0.84
1029	0.82
1030	0.79
1031	0.8
1032	0.77
1033	0.71
1034	0.64
1035	0.55
1036	0.47
1037	0.45
1038	0.38
1039	0.33
1040	0.27
1041	0.21
1042	0.19
1043	0.19
1044	0.19
1045	0.13
1046	0.12
1047	0.08
1048	0.08
1049	0.08
1050	0.07
1051	0.06
1052	0.06
1053	0.05
1054	0.05
1055	0.05
1056	0.06
1057	0.06
1058	0.07
1059	0.09
1060	0.11
1061	0.12
1062	0.13
1063	0.13
1064	0.13
1065	0.12
1066	0.13
1067	0.11
1068	0.09
1069	0.09
1070	0.07
1071	0.06
1072	0.07
1073	0.07
1074	0.07
1075	0.06
1076	0.06
1077	0.05
1078	0.06
1079	0.06
1080	0.06
1081	0.07
1082	0.08
1083	0.08
1084	0.08
1085	0.1
1086	0.12
1087	0.12
1088	0.14
1089	0.16
1090	0.18
1091	0.18
1092	0.21
1093	0.2
1094	0.18
1095	0.18
1096	0.16
1097	0.14

A0A0C2WHY2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer