Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2WVR3

Protein Details
Accession A0A0C2WVR3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-166SFFPPSPPAHRRRQRRRSLTDSQIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
153-157RRRQR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MATVSQHPLRRTARHPPEDTDAGITRPYLSRLTRDVGDDSLSDKRPVIDRQERIVVVHKVSPKDSLPGVSLRYGIPLAELRQINQLWASDPIHLRDVLYIPVDKVTRTLSSPDPLQHEDGPSISRLDLPPSATIQRIPSSQLSFFPPSPPAHRRRQRRRSLTDSQIPRSQPATLSRSHTRNHSHHSTSLSSLLTALPTAASTRNSIVPRLSFDSISSSFDDRSRSQSDNEENHELEEVVSRDYPTVAKVPRNDVYDPRPSACIPRHRARRILPLSPPSSYIPSAPLSVIRTVQMEPSPTMQIPKKMNSTLIHDQEGKTESLISRSKVYASAHNLMETDAMSKRLLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.69
3 0.66
4 0.67
5 0.64
6 0.58
7 0.53
8 0.43
9 0.35
10 0.32
11 0.27
12 0.21
13 0.2
14 0.21
15 0.21
16 0.22
17 0.25
18 0.28
19 0.32
20 0.32
21 0.33
22 0.33
23 0.29
24 0.28
25 0.24
26 0.23
27 0.25
28 0.25
29 0.23
30 0.22
31 0.23
32 0.26
33 0.3
34 0.37
35 0.4
36 0.43
37 0.47
38 0.52
39 0.5
40 0.47
41 0.5
42 0.43
43 0.36
44 0.37
45 0.37
46 0.33
47 0.34
48 0.36
49 0.3
50 0.3
51 0.28
52 0.25
53 0.22
54 0.23
55 0.23
56 0.21
57 0.21
58 0.17
59 0.18
60 0.16
61 0.14
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.19
66 0.19
67 0.18
68 0.24
69 0.24
70 0.23
71 0.22
72 0.2
73 0.15
74 0.19
75 0.18
76 0.17
77 0.18
78 0.19
79 0.2
80 0.2
81 0.18
82 0.17
83 0.17
84 0.14
85 0.14
86 0.13
87 0.11
88 0.15
89 0.15
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.18
96 0.17
97 0.19
98 0.22
99 0.23
100 0.26
101 0.27
102 0.28
103 0.26
104 0.25
105 0.22
106 0.21
107 0.19
108 0.15
109 0.13
110 0.1
111 0.11
112 0.1
113 0.12
114 0.13
115 0.14
116 0.14
117 0.15
118 0.17
119 0.15
120 0.16
121 0.16
122 0.16
123 0.15
124 0.17
125 0.17
126 0.18
127 0.19
128 0.19
129 0.21
130 0.23
131 0.22
132 0.22
133 0.22
134 0.22
135 0.28
136 0.33
137 0.35
138 0.42
139 0.5
140 0.59
141 0.67
142 0.76
143 0.8
144 0.83
145 0.85
146 0.82
147 0.83
148 0.79
149 0.76
150 0.71
151 0.64
152 0.59
153 0.51
154 0.45
155 0.37
156 0.3
157 0.24
158 0.24
159 0.22
160 0.2
161 0.25
162 0.28
163 0.3
164 0.31
165 0.34
166 0.36
167 0.38
168 0.42
169 0.43
170 0.4
171 0.4
172 0.42
173 0.38
174 0.32
175 0.3
176 0.23
177 0.17
178 0.15
179 0.13
180 0.09
181 0.07
182 0.06
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.15
191 0.16
192 0.17
193 0.17
194 0.17
195 0.19
196 0.22
197 0.22
198 0.17
199 0.17
200 0.21
201 0.2
202 0.21
203 0.2
204 0.17
205 0.17
206 0.18
207 0.22
208 0.18
209 0.22
210 0.24
211 0.24
212 0.25
213 0.3
214 0.36
215 0.37
216 0.41
217 0.39
218 0.35
219 0.34
220 0.32
221 0.26
222 0.19
223 0.17
224 0.13
225 0.1
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.1
232 0.15
233 0.17
234 0.21
235 0.24
236 0.3
237 0.34
238 0.38
239 0.38
240 0.38
241 0.4
242 0.44
243 0.44
244 0.39
245 0.37
246 0.33
247 0.38
248 0.4
249 0.44
250 0.43
251 0.51
252 0.6
253 0.62
254 0.69
255 0.67
256 0.71
257 0.68
258 0.67
259 0.64
260 0.61
261 0.59
262 0.53
263 0.51
264 0.43
265 0.4
266 0.34
267 0.28
268 0.23
269 0.21
270 0.21
271 0.19
272 0.19
273 0.18
274 0.19
275 0.19
276 0.17
277 0.18
278 0.17
279 0.2
280 0.19
281 0.19
282 0.19
283 0.21
284 0.23
285 0.22
286 0.27
287 0.28
288 0.33
289 0.36
290 0.41
291 0.44
292 0.42
293 0.48
294 0.44
295 0.49
296 0.51
297 0.5
298 0.49
299 0.46
300 0.44
301 0.43
302 0.42
303 0.34
304 0.25
305 0.24
306 0.2
307 0.24
308 0.28
309 0.25
310 0.27
311 0.27
312 0.28
313 0.3
314 0.32
315 0.33
316 0.36
317 0.4
318 0.38
319 0.38
320 0.37
321 0.32
322 0.3
323 0.23
324 0.19
325 0.14
326 0.15