Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2SHB2

Protein Details
Accession A0A0C2SHB2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-200EEDRERHKRLRERRWVQPISBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR042326  Ctk3  
IPR024637  Ctk3_C  
IPR024638  Ctk3_N  
IPR008942  ENTH_VHS  
Gene Ontology GO:0070692  C:CTDK-1 complex  
GO:0032786  P:positive regulation of DNA-templated transcription, elongation  
Pfam View protein in Pfam  
PF12243  CTK3  
PF12350  CTK3_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
Amino Acid Sequences MDPFEVRMQFLALLRRLNASQQSIQKVVGFAVKYFPPCGEDLWDCIVEECQKGSINSRINILYFLDSLCEACLLVKSRSNSLSADSSGKTTPGLYVDYLAKDLARIVDSVVPEGRQGLPNLISTKQILENWRSKRVVEPQKIDEIIGSLSERNDAFEAQQQQAQNAHSTSLSRNEVFKRIEEDRERHKRLRERRWVQPISHNISSHLSSTLASFLPLVDAPEGQEELPIDIEFENEWEATSDWNEDDDEAVAEESELCFPAEGEGPMDLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.27
4 0.3
5 0.32
6 0.31
7 0.34
8 0.39
9 0.43
10 0.41
11 0.42
12 0.38
13 0.33
14 0.29
15 0.27
16 0.21
17 0.17
18 0.19
19 0.21
20 0.21
21 0.22
22 0.21
23 0.19
24 0.19
25 0.2
26 0.21
27 0.19
28 0.21
29 0.23
30 0.23
31 0.21
32 0.2
33 0.21
34 0.18
35 0.17
36 0.15
37 0.13
38 0.14
39 0.15
40 0.19
41 0.24
42 0.28
43 0.28
44 0.31
45 0.3
46 0.28
47 0.29
48 0.25
49 0.2
50 0.14
51 0.13
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.09
60 0.11
61 0.13
62 0.17
63 0.18
64 0.22
65 0.23
66 0.24
67 0.22
68 0.22
69 0.22
70 0.2
71 0.21
72 0.18
73 0.19
74 0.18
75 0.17
76 0.14
77 0.12
78 0.11
79 0.1
80 0.11
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.1
88 0.08
89 0.09
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.09
95 0.09
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.11
106 0.13
107 0.15
108 0.14
109 0.14
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.15
114 0.15
115 0.18
116 0.25
117 0.28
118 0.34
119 0.33
120 0.31
121 0.34
122 0.41
123 0.46
124 0.45
125 0.45
126 0.42
127 0.45
128 0.45
129 0.4
130 0.3
131 0.21
132 0.15
133 0.11
134 0.09
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.12
144 0.15
145 0.15
146 0.18
147 0.17
148 0.17
149 0.19
150 0.19
151 0.16
152 0.14
153 0.13
154 0.11
155 0.12
156 0.13
157 0.16
158 0.18
159 0.17
160 0.2
161 0.22
162 0.27
163 0.27
164 0.27
165 0.27
166 0.28
167 0.34
168 0.37
169 0.39
170 0.44
171 0.53
172 0.58
173 0.58
174 0.63
175 0.65
176 0.69
177 0.75
178 0.76
179 0.73
180 0.76
181 0.82
182 0.79
183 0.73
184 0.71
185 0.69
186 0.65
187 0.63
188 0.53
189 0.45
190 0.43
191 0.41
192 0.33
193 0.25
194 0.18
195 0.13
196 0.14
197 0.14
198 0.11
199 0.1
200 0.09
201 0.07
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.1
216 0.09
217 0.08
218 0.09
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.08
247 0.1
248 0.12
249 0.11
250 0.12