Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B2VTK1

Protein Details
Accession B2VTK1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-55ETDNYDQRDRSPRRRSRSPRRSRRSYSPRSRSRSREDYRRTERRSRSPNSGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-49RSPRRRSRSPRRSRRSYSPRSRSRSREDYRRTERRSR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSYETDNYDQRDRSPRRRSRSPRRSRRSYSPRSRSRSREDYRRTERRSRSPNSGAQAAAGGYQSYGAGRGGSSRPVENKGEMMQSIRDSSQQDRRVYVGNLSYDVKWHHLKDFMRQAGEVLFADVLLLPNGMSKAQNAVASLSNQNLMGRLVYVREDREAEPRFSAPGGGGRGDFGGGMGPRGGYGGGFGGHPAAGGAGAGRQVYVANLPYNVGWQDLKDLFRQAANNGQVLRADVHTAPDGRPKGSGIVAFETPEDARNAITQFNGYDWQGRNLEVREDRFAGAQGGFGGRGGFAGGRGGFGGGFGRGGFGARGGFGGGFGGRGGYGGGAGYGGGAPGGPAFDPNAAPAAPNPFTDYATAGGEPSNTIYVRNLPWSTSNEDLVELFTTIGKVERAEIQYEPNGRSRGTGVVEFEKAADAETSIAKFTGYQYGGRPLGLAYVKYTNLGNGDAMEGTEHTGGLTQDQIM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.7
3 0.73
4 0.83
5 0.88
6 0.89
7 0.91
8 0.92
9 0.92
10 0.93
11 0.95
12 0.92
13 0.92
14 0.92
15 0.92
16 0.92
17 0.91
18 0.91
19 0.89
20 0.9
21 0.87
22 0.86
23 0.85
24 0.83
25 0.83
26 0.82
27 0.85
28 0.86
29 0.88
30 0.86
31 0.85
32 0.86
33 0.85
34 0.86
35 0.82
36 0.81
37 0.78
38 0.77
39 0.72
40 0.66
41 0.55
42 0.46
43 0.4
44 0.3
45 0.24
46 0.17
47 0.12
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.1
57 0.12
58 0.16
59 0.19
60 0.22
61 0.25
62 0.3
63 0.33
64 0.3
65 0.31
66 0.29
67 0.3
68 0.26
69 0.25
70 0.22
71 0.21
72 0.22
73 0.2
74 0.2
75 0.21
76 0.26
77 0.33
78 0.38
79 0.39
80 0.38
81 0.39
82 0.4
83 0.38
84 0.36
85 0.32
86 0.25
87 0.26
88 0.26
89 0.24
90 0.22
91 0.23
92 0.23
93 0.24
94 0.24
95 0.24
96 0.29
97 0.3
98 0.36
99 0.45
100 0.44
101 0.4
102 0.39
103 0.37
104 0.31
105 0.31
106 0.22
107 0.14
108 0.1
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.06
120 0.07
121 0.09
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.13
126 0.14
127 0.16
128 0.17
129 0.15
130 0.13
131 0.13
132 0.12
133 0.11
134 0.1
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.11
141 0.12
142 0.13
143 0.16
144 0.16
145 0.24
146 0.27
147 0.26
148 0.26
149 0.25
150 0.24
151 0.21
152 0.2
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.03
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.03
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.1
204 0.11
205 0.13
206 0.13
207 0.14
208 0.13
209 0.14
210 0.15
211 0.12
212 0.17
213 0.16
214 0.17
215 0.17
216 0.16
217 0.15
218 0.15
219 0.15
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.11
226 0.1
227 0.15
228 0.16
229 0.15
230 0.15
231 0.14
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.11
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.1
254 0.08
255 0.13
256 0.13
257 0.17
258 0.17
259 0.17
260 0.19
261 0.18
262 0.23
263 0.21
264 0.22
265 0.21
266 0.22
267 0.21
268 0.19
269 0.19
270 0.16
271 0.13
272 0.11
273 0.09
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.04
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.02
323 0.02
324 0.02
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.04
329 0.05
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.09
334 0.08
335 0.09
336 0.1
337 0.15
338 0.15
339 0.15
340 0.18
341 0.18
342 0.19
343 0.19
344 0.19
345 0.15
346 0.15
347 0.15
348 0.11
349 0.11
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.09
355 0.1
356 0.11
357 0.15
358 0.16
359 0.22
360 0.21
361 0.2
362 0.24
363 0.27
364 0.31
365 0.29
366 0.29
367 0.24
368 0.24
369 0.23
370 0.2
371 0.17
372 0.12
373 0.1
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.15
382 0.17
383 0.19
384 0.2
385 0.23
386 0.28
387 0.32
388 0.32
389 0.32
390 0.32
391 0.3
392 0.3
393 0.28
394 0.27
395 0.26
396 0.27
397 0.25
398 0.27
399 0.28
400 0.26
401 0.25
402 0.21
403 0.18
404 0.16
405 0.12
406 0.09
407 0.09
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.11
414 0.12
415 0.19
416 0.18
417 0.2
418 0.22
419 0.3
420 0.31
421 0.3
422 0.29
423 0.2
424 0.25
425 0.25
426 0.23
427 0.19
428 0.22
429 0.22
430 0.23
431 0.24
432 0.19
433 0.19
434 0.2
435 0.16
436 0.13
437 0.14
438 0.13
439 0.12
440 0.11
441 0.1
442 0.11
443 0.1
444 0.1
445 0.08
446 0.1
447 0.1
448 0.11