Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2XQ06

Protein Details
Accession A0A0C2XQ06    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
57-79EAARALRKKLKHGQPQQQYRALVHydrophilic
170-199NAKEDKKKAKEETKKRQKTEREEQRRKEEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-212EDKKKAKEETKKRQKTEREEQRRKEEEEKRNKATRARRVP
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR044103  GAT_LSB5  
IPR038425  GAT_sf  
IPR045007  LSB5  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50179  VHS  
CDD cd14232  GAT_LSB5  
cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MSALNFAKLAFGIDNKPHSSVTEWVEILTSNKIEDEAYEGVPELVDAIDLQASGPAEAARALRKKLKHGQPQQQYRALVLIKALVENAGPKFHAAFSEGQLVDAFKQVSSDSTTDKRVKKKLQSVLASWRDQYRSEPSMTLFANLHKQCKGGTRPLNGPVDVSQVHGHDNAKEDKKKAKEETKKRQKTEREEQRRKEEEEKRNKATRARRVPFNLEKERPKVLSTIAEASQASSNFANALMLVNIETDSVHANDRVQECLIKAEVAKKSIVRYIQLVEDEDLIGALIETNDRINAALGTYEAMSTVSTEDSPGGTSDVTHRLSNVRISSPADETEEQASSSPTSAHGHPDLQDISFGPLGASSGKLPAPIKPSQLSDNEIEPRRGSLSDFSDYISSDEETHNARAGSSRRNYVDVSENSEDDAGYMHIKESRAGLAPTPGDDPFADPFADEAAVPTH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.32
4 0.3
5 0.3
6 0.31
7 0.31
8 0.3
9 0.31
10 0.29
11 0.27
12 0.27
13 0.26
14 0.24
15 0.23
16 0.18
17 0.13
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.12
22 0.16
23 0.14
24 0.14
25 0.14
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.08
31 0.05
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.05
37 0.06
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.07
43 0.07
44 0.09
45 0.11
46 0.16
47 0.2
48 0.25
49 0.31
50 0.35
51 0.44
52 0.52
53 0.61
54 0.64
55 0.71
56 0.77
57 0.81
58 0.88
59 0.86
60 0.82
61 0.73
62 0.62
63 0.57
64 0.47
65 0.37
66 0.27
67 0.23
68 0.16
69 0.16
70 0.15
71 0.1
72 0.1
73 0.12
74 0.13
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.14
83 0.14
84 0.22
85 0.22
86 0.21
87 0.21
88 0.21
89 0.19
90 0.19
91 0.17
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.13
97 0.14
98 0.16
99 0.19
100 0.26
101 0.33
102 0.39
103 0.46
104 0.51
105 0.59
106 0.64
107 0.7
108 0.72
109 0.73
110 0.71
111 0.68
112 0.69
113 0.67
114 0.59
115 0.51
116 0.47
117 0.4
118 0.36
119 0.35
120 0.31
121 0.28
122 0.28
123 0.28
124 0.25
125 0.28
126 0.27
127 0.25
128 0.19
129 0.18
130 0.25
131 0.26
132 0.27
133 0.24
134 0.24
135 0.24
136 0.3
137 0.33
138 0.34
139 0.39
140 0.41
141 0.44
142 0.5
143 0.51
144 0.44
145 0.4
146 0.31
147 0.28
148 0.23
149 0.21
150 0.16
151 0.13
152 0.15
153 0.16
154 0.15
155 0.13
156 0.17
157 0.22
158 0.27
159 0.3
160 0.32
161 0.37
162 0.42
163 0.48
164 0.52
165 0.56
166 0.59
167 0.67
168 0.76
169 0.8
170 0.83
171 0.81
172 0.83
173 0.81
174 0.8
175 0.8
176 0.8
177 0.8
178 0.81
179 0.83
180 0.84
181 0.8
182 0.74
183 0.73
184 0.72
185 0.71
186 0.72
187 0.73
188 0.69
189 0.71
190 0.69
191 0.67
192 0.66
193 0.66
194 0.66
195 0.63
196 0.63
197 0.61
198 0.66
199 0.66
200 0.65
201 0.63
202 0.58
203 0.58
204 0.54
205 0.53
206 0.46
207 0.39
208 0.31
209 0.25
210 0.21
211 0.18
212 0.18
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.14
217 0.15
218 0.12
219 0.12
220 0.09
221 0.09
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.11
241 0.12
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.09
249 0.09
250 0.14
251 0.16
252 0.16
253 0.18
254 0.17
255 0.18
256 0.21
257 0.22
258 0.17
259 0.17
260 0.17
261 0.18
262 0.17
263 0.17
264 0.14
265 0.14
266 0.12
267 0.1
268 0.09
269 0.06
270 0.05
271 0.04
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.07
303 0.1
304 0.15
305 0.17
306 0.16
307 0.17
308 0.18
309 0.2
310 0.24
311 0.23
312 0.19
313 0.19
314 0.22
315 0.23
316 0.23
317 0.23
318 0.23
319 0.21
320 0.21
321 0.21
322 0.19
323 0.17
324 0.15
325 0.15
326 0.11
327 0.11
328 0.1
329 0.09
330 0.12
331 0.13
332 0.17
333 0.18
334 0.19
335 0.19
336 0.23
337 0.22
338 0.19
339 0.19
340 0.16
341 0.16
342 0.15
343 0.14
344 0.1
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.07
350 0.09
351 0.09
352 0.13
353 0.14
354 0.17
355 0.22
356 0.24
357 0.29
358 0.29
359 0.32
360 0.33
361 0.36
362 0.35
363 0.32
364 0.35
365 0.38
366 0.38
367 0.37
368 0.33
369 0.31
370 0.29
371 0.28
372 0.24
373 0.22
374 0.24
375 0.25
376 0.25
377 0.24
378 0.23
379 0.23
380 0.22
381 0.19
382 0.15
383 0.13
384 0.14
385 0.15
386 0.17
387 0.18
388 0.2
389 0.18
390 0.17
391 0.21
392 0.25
393 0.32
394 0.33
395 0.4
396 0.39
397 0.42
398 0.43
399 0.41
400 0.46
401 0.39
402 0.42
403 0.38
404 0.36
405 0.34
406 0.33
407 0.29
408 0.19
409 0.18
410 0.11
411 0.09
412 0.1
413 0.1
414 0.14
415 0.14
416 0.16
417 0.17
418 0.19
419 0.21
420 0.22
421 0.22
422 0.24
423 0.25
424 0.25
425 0.26
426 0.23
427 0.21
428 0.21
429 0.22
430 0.19
431 0.19
432 0.17
433 0.15
434 0.15
435 0.14
436 0.14
437 0.11