Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0C2SCB4

Protein Details
Accession A0A0C2SCB4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
623-648APKSATKRKSDLPSNKNAKRRKSVGNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
628-645TKRKSDLPSNKNAKRRKS
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017970  Homeobox_CS  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00027  HOMEOBOX_1  
Amino Acid Sequences MAPRSWATEDQLKFLRGQLDDFFAAQKAGKLVAFWPKVQKIWYQEWPEPGMEEGQPARSDLVASIQVRNKQLQNWFYNHRENNRNRGMQLAPIILNVKQKRTLSAVQLYSAEKYTGAIKSDVMSEIQENSIPKNKTLQVVLRQTAEKFRAEPPEVQMHYKEKSEKLKQQRLEEKKAATKSVGDPTPASEIKNLTPAIDALLLDLHKRTGWSFLVLAGGPDPVSGKIRTLSFNEGQNMAGHTFAKCHPAFENDYIKPFLSFLKQTYSPAIREARRLIAGDGNSTPALSDEPTITFPGATGSEVYTSLESGMEIGSANEPQPALHNVNQVQVSRETEHEGTHTSTRGNKESATGGDDESTRGGDDESRRGDDRDDETATGEANHDWLDPSLRSSTIVIGAAFPNQNTPISGPCEDENSPPPFPERPLMPDVPCANDNLGQSEGADNVQTDTNTTSRSQRTRRAAAPKVPVTLGDKHSEWLQGSYSCLLYDNCDTIWSETVEAWLQFEKDLPLVNISSGRLPAIKYRPTELSKWLMTRNFTSPPPISDVSAYAESMKTWWTNMKTPTNKTQSSGALHHLRNGGPNGIVTLLFGLRWWQLNLNQDAAQWDVVLKEIHGMLKEFAGTAPKSATKRKSDLPSNKNAKRRKSVGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.29
4 0.31
5 0.28
6 0.28
7 0.28
8 0.28
9 0.26
10 0.2
11 0.2
12 0.18
13 0.17
14 0.14
15 0.15
16 0.14
17 0.13
18 0.17
19 0.26
20 0.28
21 0.3
22 0.37
23 0.39
24 0.41
25 0.43
26 0.45
27 0.42
28 0.47
29 0.53
30 0.52
31 0.52
32 0.54
33 0.55
34 0.49
35 0.43
36 0.36
37 0.3
38 0.23
39 0.23
40 0.2
41 0.2
42 0.2
43 0.2
44 0.19
45 0.16
46 0.17
47 0.13
48 0.15
49 0.18
50 0.19
51 0.25
52 0.29
53 0.34
54 0.37
55 0.41
56 0.41
57 0.4
58 0.47
59 0.48
60 0.5
61 0.51
62 0.55
63 0.56
64 0.63
65 0.63
66 0.64
67 0.66
68 0.67
69 0.71
70 0.73
71 0.7
72 0.61
73 0.6
74 0.52
75 0.46
76 0.43
77 0.36
78 0.27
79 0.25
80 0.26
81 0.23
82 0.31
83 0.3
84 0.3
85 0.33
86 0.33
87 0.35
88 0.39
89 0.42
90 0.4
91 0.45
92 0.42
93 0.38
94 0.4
95 0.38
96 0.34
97 0.3
98 0.23
99 0.15
100 0.14
101 0.16
102 0.16
103 0.17
104 0.16
105 0.15
106 0.16
107 0.18
108 0.18
109 0.14
110 0.13
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.14
115 0.13
116 0.16
117 0.23
118 0.23
119 0.23
120 0.28
121 0.3
122 0.31
123 0.35
124 0.39
125 0.4
126 0.46
127 0.48
128 0.44
129 0.43
130 0.42
131 0.43
132 0.39
133 0.32
134 0.27
135 0.29
136 0.34
137 0.35
138 0.37
139 0.35
140 0.41
141 0.41
142 0.41
143 0.41
144 0.37
145 0.36
146 0.37
147 0.37
148 0.34
149 0.42
150 0.48
151 0.54
152 0.61
153 0.67
154 0.69
155 0.74
156 0.78
157 0.77
158 0.77
159 0.74
160 0.68
161 0.66
162 0.63
163 0.55
164 0.46
165 0.41
166 0.36
167 0.38
168 0.34
169 0.29
170 0.26
171 0.26
172 0.31
173 0.29
174 0.25
175 0.2
176 0.2
177 0.2
178 0.24
179 0.22
180 0.16
181 0.16
182 0.15
183 0.14
184 0.13
185 0.12
186 0.07
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.11
196 0.11
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.14
201 0.13
202 0.13
203 0.09
204 0.09
205 0.07
206 0.06
207 0.07
208 0.06
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.12
213 0.13
214 0.16
215 0.18
216 0.23
217 0.23
218 0.26
219 0.27
220 0.25
221 0.24
222 0.23
223 0.21
224 0.16
225 0.14
226 0.1
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.17
231 0.16
232 0.17
233 0.17
234 0.21
235 0.25
236 0.28
237 0.34
238 0.28
239 0.3
240 0.3
241 0.29
242 0.25
243 0.22
244 0.18
245 0.14
246 0.15
247 0.13
248 0.18
249 0.18
250 0.19
251 0.23
252 0.24
253 0.22
254 0.25
255 0.3
256 0.26
257 0.28
258 0.29
259 0.27
260 0.26
261 0.26
262 0.22
263 0.2
264 0.19
265 0.17
266 0.15
267 0.14
268 0.13
269 0.12
270 0.11
271 0.07
272 0.08
273 0.06
274 0.07
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.08
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.03
298 0.03
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.07
307 0.09
308 0.12
309 0.14
310 0.17
311 0.17
312 0.2
313 0.22
314 0.2
315 0.19
316 0.17
317 0.17
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.14
322 0.14
323 0.13
324 0.14
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.12
329 0.15
330 0.18
331 0.2
332 0.19
333 0.17
334 0.17
335 0.18
336 0.18
337 0.16
338 0.14
339 0.12
340 0.12
341 0.12
342 0.11
343 0.09
344 0.08
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.08
349 0.1
350 0.14
351 0.16
352 0.18
353 0.19
354 0.19
355 0.2
356 0.21
357 0.22
358 0.21
359 0.2
360 0.18
361 0.18
362 0.18
363 0.17
364 0.13
365 0.11
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.08
373 0.07
374 0.09
375 0.1
376 0.09
377 0.1
378 0.1
379 0.11
380 0.1
381 0.11
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.11
386 0.11
387 0.1
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.09
392 0.1
393 0.1
394 0.14
395 0.15
396 0.16
397 0.15
398 0.19
399 0.2
400 0.21
401 0.24
402 0.24
403 0.24
404 0.22
405 0.25
406 0.22
407 0.23
408 0.24
409 0.2
410 0.21
411 0.26
412 0.29
413 0.27
414 0.31
415 0.3
416 0.3
417 0.29
418 0.25
419 0.2
420 0.21
421 0.2
422 0.17
423 0.16
424 0.13
425 0.13
426 0.12
427 0.12
428 0.08
429 0.08
430 0.06
431 0.07
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.09
436 0.1
437 0.12
438 0.13
439 0.18
440 0.23
441 0.32
442 0.37
443 0.44
444 0.51
445 0.56
446 0.62
447 0.66
448 0.67
449 0.66
450 0.69
451 0.63
452 0.57
453 0.51
454 0.45
455 0.39
456 0.38
457 0.33
458 0.28
459 0.25
460 0.24
461 0.25
462 0.26
463 0.22
464 0.18
465 0.17
466 0.14
467 0.16
468 0.16
469 0.15
470 0.13
471 0.13
472 0.12
473 0.13
474 0.14
475 0.14
476 0.12
477 0.13
478 0.14
479 0.14
480 0.16
481 0.13
482 0.13
483 0.11
484 0.13
485 0.14
486 0.13
487 0.12
488 0.11
489 0.11
490 0.1
491 0.11
492 0.11
493 0.1
494 0.12
495 0.11
496 0.12
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.13
501 0.14
502 0.13
503 0.13
504 0.12
505 0.13
506 0.2
507 0.25
508 0.3
509 0.31
510 0.34
511 0.41
512 0.43
513 0.45
514 0.43
515 0.42
516 0.41
517 0.42
518 0.44
519 0.41
520 0.4
521 0.41
522 0.4
523 0.38
524 0.35
525 0.38
526 0.34
527 0.33
528 0.36
529 0.33
530 0.3
531 0.27
532 0.27
533 0.25
534 0.24
535 0.22
536 0.17
537 0.16
538 0.15
539 0.14
540 0.15
541 0.11
542 0.12
543 0.18
544 0.21
545 0.28
546 0.35
547 0.45
548 0.5
549 0.56
550 0.64
551 0.66
552 0.63
553 0.59
554 0.57
555 0.53
556 0.5
557 0.47
558 0.45
559 0.45
560 0.44
561 0.46
562 0.44
563 0.39
564 0.39
565 0.38
566 0.32
567 0.24
568 0.24
569 0.2
570 0.18
571 0.17
572 0.12
573 0.11
574 0.09
575 0.08
576 0.08
577 0.1
578 0.11
579 0.13
580 0.15
581 0.17
582 0.21
583 0.29
584 0.32
585 0.33
586 0.32
587 0.3
588 0.3
589 0.28
590 0.24
591 0.16
592 0.14
593 0.1
594 0.12
595 0.11
596 0.09
597 0.1
598 0.12
599 0.14
600 0.15
601 0.16
602 0.15
603 0.16
604 0.17
605 0.15
606 0.14
607 0.18
608 0.17
609 0.17
610 0.2
611 0.25
612 0.3
613 0.38
614 0.46
615 0.48
616 0.54
617 0.6
618 0.66
619 0.71
620 0.77
621 0.76
622 0.79
623 0.82
624 0.84
625 0.84
626 0.83
627 0.82
628 0.81