Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2T4A2

Protein Details
Accession A0A0C2T4A2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-118LSPYSKSHARRQKRKAKEEIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-114ARRQKRKAK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MPKVSRKRTELHTSSAKLQKRQFSVQDNAVEHVNIGEASDVSVSRRHTTFLPIPDDLTKGNDILHALSTPKTHAPVVTKKERQQLKREAFLQKLSAELSPYSKSHARRQKRKAKEEIAGGLNDLKVVITELEPDNQPDEDGTSTNPKTSLKPGKIGEGKHLPLSAGQRKRALKLEQMRQPLVLSNPAFASNPFQAIRTHAQNTLVKHEVQNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.66
3 0.63
4 0.6
5 0.62
6 0.62
7 0.6
8 0.63
9 0.62
10 0.61
11 0.62
12 0.6
13 0.6
14 0.54
15 0.49
16 0.42
17 0.35
18 0.27
19 0.21
20 0.15
21 0.08
22 0.07
23 0.06
24 0.05
25 0.05
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.11
30 0.13
31 0.15
32 0.16
33 0.17
34 0.18
35 0.25
36 0.29
37 0.32
38 0.35
39 0.32
40 0.33
41 0.33
42 0.33
43 0.26
44 0.23
45 0.18
46 0.13
47 0.13
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.1
56 0.11
57 0.12
58 0.13
59 0.13
60 0.14
61 0.19
62 0.26
63 0.33
64 0.4
65 0.44
66 0.48
67 0.55
68 0.61
69 0.6
70 0.61
71 0.64
72 0.6
73 0.61
74 0.61
75 0.57
76 0.52
77 0.48
78 0.41
79 0.31
80 0.26
81 0.21
82 0.16
83 0.13
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.14
89 0.17
90 0.2
91 0.28
92 0.38
93 0.45
94 0.54
95 0.64
96 0.71
97 0.77
98 0.82
99 0.82
100 0.78
101 0.73
102 0.66
103 0.6
104 0.51
105 0.41
106 0.33
107 0.25
108 0.19
109 0.14
110 0.1
111 0.06
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.06
117 0.07
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.08
125 0.09
126 0.08
127 0.09
128 0.1
129 0.15
130 0.15
131 0.16
132 0.17
133 0.17
134 0.18
135 0.27
136 0.35
137 0.31
138 0.38
139 0.39
140 0.46
141 0.5
142 0.48
143 0.47
144 0.44
145 0.43
146 0.38
147 0.37
148 0.29
149 0.27
150 0.35
151 0.36
152 0.35
153 0.38
154 0.43
155 0.45
156 0.49
157 0.53
158 0.49
159 0.49
160 0.52
161 0.58
162 0.58
163 0.62
164 0.59
165 0.53
166 0.49
167 0.43
168 0.36
169 0.34
170 0.27
171 0.22
172 0.22
173 0.23
174 0.22
175 0.2
176 0.23
177 0.17
178 0.21
179 0.2
180 0.2
181 0.2
182 0.25
183 0.3
184 0.31
185 0.33
186 0.31
187 0.38
188 0.4
189 0.43
190 0.45
191 0.41
192 0.37