Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2XAT2

Protein Details
Accession A0A0C2XAT2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-37IAPLAQNRKGKQKSKEKEKKSDSTLQSHydrophilic
523-561GEDKAEKKRLKEKRKMRGRNKSLKRYLRRQRANVIDPRTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-30RKGKQKSKEKEKK
527-580AEKKRLKEKRKMRGRNKSLKRYLRRQRANVIDPRTVAIRAKLEKQQEEKRKARL
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_mito 11.5, mito 7.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012952  BING4_C_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR040315  WDR46/Utp7  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08149  BING4CT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MDSLIAKADAIAPLAQNRKGKQKSKEKEKKSDSTLQSVAKRTSVPRSLQNLPVPDNVPKHSHIANRKLRTLLHRQSEHNARSKTLLDDADMLLMDEAGKIEVEGEMERTWRTTQADITAAAGQEAARGRKEFKLDGGPYQCRYTRNGRHLAIVGRKGHVATFDWQTGTLHSELQLQETCRDITFLHDHSFYAVAQKKHVFIYDRDGVEIHKLKAHIEPTRLEFLPYHWLLASIGNAGYLKYQDTSTGELLVEHRTKLGACNAMTQNVHNAVIYLGHQNGCVTLWTPNLPHPAVQLLAHLGPVVDVSVDPSNGGRYMATAGRDGTVKVWDCRNWKGAVRDWTVRGTGVTELEWSARGFLATANGGQVNIYTPPTVHTTVNTRAPPALYITHPIPHRPLSSIRFAPFQDVLTIGHAAGLSSILVPGAGQPNYDSTEADPFENKKARREREVRGLLDKVKPDMITLDPEFVGSLAPPSKLTTETTFDGKPSVETPFARLPRLERLKVSGHADETEEMDEDDAADDGEDKAEKKRLKEKRKMRGRNKSLKRYLRRQRANVIDPRTVAIRAKLEKQQEEKRKARLAKEGEDDGAQQPSALDRFRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.3
3 0.34
4 0.37
5 0.46
6 0.55
7 0.62
8 0.66
9 0.72
10 0.77
11 0.83
12 0.9
13 0.89
14 0.9
15 0.91
16 0.9
17 0.86
18 0.86
19 0.79
20 0.76
21 0.72
22 0.68
23 0.65
24 0.62
25 0.56
26 0.48
27 0.47
28 0.43
29 0.46
30 0.46
31 0.44
32 0.47
33 0.52
34 0.55
35 0.58
36 0.6
37 0.56
38 0.52
39 0.53
40 0.47
41 0.46
42 0.45
43 0.41
44 0.39
45 0.36
46 0.37
47 0.37
48 0.42
49 0.46
50 0.52
51 0.59
52 0.61
53 0.63
54 0.62
55 0.62
56 0.61
57 0.63
58 0.61
59 0.61
60 0.6
61 0.59
62 0.64
63 0.7
64 0.68
65 0.67
66 0.59
67 0.51
68 0.49
69 0.48
70 0.42
71 0.37
72 0.31
73 0.24
74 0.24
75 0.23
76 0.21
77 0.18
78 0.16
79 0.11
80 0.1
81 0.08
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.06
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.12
96 0.13
97 0.16
98 0.18
99 0.18
100 0.19
101 0.22
102 0.23
103 0.22
104 0.23
105 0.21
106 0.18
107 0.16
108 0.14
109 0.1
110 0.12
111 0.15
112 0.14
113 0.15
114 0.17
115 0.19
116 0.23
117 0.27
118 0.26
119 0.26
120 0.34
121 0.34
122 0.4
123 0.44
124 0.45
125 0.43
126 0.46
127 0.45
128 0.38
129 0.4
130 0.43
131 0.45
132 0.49
133 0.55
134 0.52
135 0.52
136 0.54
137 0.55
138 0.52
139 0.49
140 0.43
141 0.35
142 0.35
143 0.32
144 0.29
145 0.24
146 0.2
147 0.17
148 0.18
149 0.19
150 0.18
151 0.18
152 0.18
153 0.17
154 0.18
155 0.15
156 0.11
157 0.11
158 0.15
159 0.15
160 0.17
161 0.19
162 0.17
163 0.18
164 0.19
165 0.19
166 0.15
167 0.15
168 0.13
169 0.15
170 0.18
171 0.19
172 0.2
173 0.2
174 0.2
175 0.2
176 0.21
177 0.16
178 0.19
179 0.22
180 0.2
181 0.23
182 0.25
183 0.25
184 0.25
185 0.28
186 0.24
187 0.2
188 0.27
189 0.29
190 0.28
191 0.27
192 0.26
193 0.24
194 0.27
195 0.29
196 0.23
197 0.19
198 0.19
199 0.2
200 0.23
201 0.27
202 0.25
203 0.24
204 0.26
205 0.27
206 0.32
207 0.31
208 0.28
209 0.23
210 0.21
211 0.26
212 0.24
213 0.21
214 0.16
215 0.16
216 0.15
217 0.16
218 0.14
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.12
237 0.16
238 0.15
239 0.12
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.13
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.2
248 0.21
249 0.23
250 0.23
251 0.22
252 0.21
253 0.18
254 0.18
255 0.12
256 0.11
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.09
273 0.11
274 0.15
275 0.15
276 0.14
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.12
281 0.1
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.03
291 0.02
292 0.04
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.05
301 0.05
302 0.07
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.11
312 0.12
313 0.13
314 0.15
315 0.18
316 0.22
317 0.25
318 0.27
319 0.26
320 0.28
321 0.3
322 0.34
323 0.37
324 0.38
325 0.38
326 0.36
327 0.35
328 0.32
329 0.28
330 0.22
331 0.16
332 0.13
333 0.1
334 0.09
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.08
359 0.12
360 0.14
361 0.13
362 0.14
363 0.19
364 0.23
365 0.29
366 0.28
367 0.25
368 0.24
369 0.24
370 0.23
371 0.2
372 0.18
373 0.13
374 0.15
375 0.16
376 0.2
377 0.2
378 0.21
379 0.22
380 0.23
381 0.23
382 0.22
383 0.27
384 0.26
385 0.33
386 0.35
387 0.33
388 0.33
389 0.32
390 0.33
391 0.28
392 0.25
393 0.19
394 0.16
395 0.15
396 0.13
397 0.13
398 0.09
399 0.09
400 0.08
401 0.08
402 0.07
403 0.06
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.05
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.1
415 0.12
416 0.15
417 0.15
418 0.14
419 0.11
420 0.17
421 0.17
422 0.18
423 0.19
424 0.19
425 0.26
426 0.32
427 0.32
428 0.36
429 0.45
430 0.49
431 0.56
432 0.62
433 0.61
434 0.65
435 0.72
436 0.66
437 0.62
438 0.61
439 0.55
440 0.52
441 0.47
442 0.38
443 0.33
444 0.29
445 0.24
446 0.23
447 0.2
448 0.21
449 0.2
450 0.2
451 0.17
452 0.17
453 0.17
454 0.14
455 0.13
456 0.07
457 0.09
458 0.09
459 0.1
460 0.1
461 0.12
462 0.13
463 0.15
464 0.18
465 0.18
466 0.21
467 0.23
468 0.26
469 0.25
470 0.24
471 0.24
472 0.21
473 0.19
474 0.16
475 0.18
476 0.18
477 0.18
478 0.23
479 0.3
480 0.32
481 0.32
482 0.32
483 0.32
484 0.39
485 0.47
486 0.45
487 0.38
488 0.41
489 0.43
490 0.47
491 0.48
492 0.41
493 0.34
494 0.32
495 0.32
496 0.28
497 0.25
498 0.21
499 0.17
500 0.13
501 0.12
502 0.1
503 0.09
504 0.08
505 0.07
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.05
510 0.07
511 0.08
512 0.09
513 0.13
514 0.21
515 0.24
516 0.3
517 0.4
518 0.5
519 0.6
520 0.69
521 0.76
522 0.79
523 0.87
524 0.92
525 0.93
526 0.93
527 0.93
528 0.94
529 0.94
530 0.94
531 0.94
532 0.93
533 0.92
534 0.91
535 0.91
536 0.92
537 0.91
538 0.87
539 0.87
540 0.86
541 0.85
542 0.83
543 0.78
544 0.71
545 0.62
546 0.57
547 0.49
548 0.41
549 0.35
550 0.31
551 0.32
552 0.32
553 0.37
554 0.42
555 0.48
556 0.54
557 0.6
558 0.66
559 0.68
560 0.74
561 0.75
562 0.77
563 0.79
564 0.78
565 0.75
566 0.75
567 0.72
568 0.69
569 0.69
570 0.64
571 0.56
572 0.5
573 0.47
574 0.39
575 0.34
576 0.25
577 0.19
578 0.15
579 0.17
580 0.19
581 0.21