FuNGI

A0A0C2SK39

Protein Details

Accession

A0A0C2SK39

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-41	QEARRCKALEEQKLRRTRKF	Hydrophilic
98-131	TAATDAKPTGKKKKRKRGGRKAKKPSKWADKCMY	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
104-124	KPTGKKKKRKRGGRKAKKPSK

Subcellular Location(s)

mito 12, nucl 9.5, cyto_nucl 7, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017336 Snurportin-1
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0061015 P:snRNA import into nucleus

Amino Acid Sequences

MLDRKSAFKLPPTTIRDAALTQEARRCKALEEQKLRRTRKFDSARQLDFFADLTLSDDDEDDDDDSVALPSIAVGSFVSAMKNDVDRTDSRLETESTTAATDAKPTGKKKKRKRGGRKAKKPSKWADKCMYAELLEMIDPGDSSSDTVDGGTGHGLPKDLESDWVAVGPVPVGKRCLAVTHQSSGAVGVAPNTSLRSRLLGKTLIARFPSALPPLTILDCILDVNWKDNGILHVLDVIKWKGQDVGDCEARFRFWWRDTRLAEVAQCMPSMTGYQSTVPLPMVSVAMQQTTPATNLPKFQFTYPTTFLPIPYFTDTSLSLLSEHIIPLAREARKVTINVPVNHSATTNGDANNEGGMDVDVTVLQTANEKYPSRSNLQGHHMLSSAFTQDTTDKTAETRSPAHTTAVVSMAVLAHIESDGLLLYVAEASYESGSSPLSNWIPIVGYERNGRSGDVQRSKNGEGCLLKFAGENEGPLDLFERLVKRNLERKALLKSERGMDMDT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.54
3	0.48
4	0.42
5	0.39
6	0.37
7	0.33
8	0.3
9	0.35
10	0.37
11	0.38
12	0.39
13	0.37
14	0.32
15	0.39
16	0.45
17	0.5
18	0.56
19	0.63
20	0.7
21	0.79
22	0.82
23	0.8
24	0.76
25	0.72
26	0.72
27	0.72
28	0.72
29	0.73
30	0.76
31	0.74
32	0.7
33	0.66
34	0.55
35	0.47
36	0.38
37	0.27
38	0.18
39	0.12
40	0.13
41	0.11
42	0.11
43	0.1
44	0.1
45	0.1
46	0.1
47	0.11
48	0.09
49	0.09
50	0.09
51	0.08
52	0.08
53	0.08
54	0.07
55	0.06
56	0.05
57	0.04
58	0.05
59	0.05
60	0.05
61	0.05
62	0.05
63	0.07
64	0.08
65	0.08
66	0.08
67	0.09
68	0.1
69	0.12
70	0.13
71	0.12
72	0.16
73	0.17
74	0.22
75	0.26
76	0.25
77	0.25
78	0.27
79	0.27
80	0.25
81	0.26
82	0.21
83	0.16
84	0.16
85	0.14
86	0.13
87	0.11
88	0.12
89	0.12
90	0.18
91	0.23
92	0.29
93	0.4
94	0.49
95	0.59
96	0.68
97	0.77
98	0.82
99	0.87
100	0.92
101	0.93
102	0.95
103	0.96
104	0.96
105	0.96
106	0.96
107	0.93
108	0.91
109	0.9
110	0.9
111	0.86
112	0.84
113	0.8
114	0.76
115	0.7
116	0.64
117	0.55
118	0.44
119	0.36
120	0.28
121	0.21
122	0.13
123	0.11
124	0.08
125	0.06
126	0.05
127	0.05
128	0.05
129	0.04
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.06
136	0.05
137	0.05
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.07
142	0.07
143	0.07
144	0.08
145	0.09
146	0.09
147	0.1
148	0.1
149	0.11
150	0.1
151	0.11
152	0.1
153	0.08
154	0.08
155	0.06
156	0.07
157	0.07
158	0.08
159	0.1
160	0.1
161	0.11
162	0.11
163	0.14
164	0.14
165	0.2
166	0.22
167	0.23
168	0.23
169	0.21
170	0.21
171	0.19
172	0.17
173	0.1
174	0.07
175	0.06
176	0.05
177	0.06
178	0.06
179	0.07
180	0.07
181	0.08
182	0.09
183	0.11
184	0.14
185	0.15
186	0.18
187	0.18
188	0.18
189	0.25
190	0.26
191	0.26
192	0.24
193	0.23
194	0.21
195	0.21
196	0.22
197	0.17
198	0.15
199	0.12
200	0.13
201	0.14
202	0.13
203	0.12
204	0.09
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.05
209	0.07
210	0.06
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.09
216	0.1
217	0.09
218	0.09
219	0.07
220	0.09
221	0.09
222	0.1
223	0.11
224	0.11
225	0.1
226	0.1
227	0.11
228	0.1
229	0.11
230	0.12
231	0.13
232	0.17
233	0.2
234	0.2
235	0.21
236	0.18
237	0.18
238	0.17
239	0.17
240	0.17
241	0.17
242	0.25
243	0.28
244	0.36
245	0.36
246	0.41
247	0.39
248	0.35
249	0.32
250	0.26
251	0.24
252	0.17
253	0.16
254	0.11
255	0.09
256	0.08
257	0.09
258	0.07
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.09
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.08
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.07
272	0.06
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.1
281	0.11
282	0.15
283	0.17
284	0.2
285	0.2
286	0.21
287	0.26
288	0.25
289	0.31
290	0.29
291	0.29
292	0.28
293	0.27
294	0.27
295	0.22
296	0.21
297	0.18
298	0.18
299	0.17
300	0.15
301	0.16
302	0.16
303	0.15
304	0.14
305	0.12
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.09
315	0.15
316	0.15
317	0.17
318	0.18
319	0.2
320	0.22
321	0.23
322	0.22
323	0.25
324	0.31
325	0.31
326	0.35
327	0.36
328	0.35
329	0.34
330	0.33
331	0.25
332	0.2
333	0.21
334	0.18
335	0.14
336	0.14
337	0.14
338	0.14
339	0.13
340	0.11
341	0.08
342	0.06
343	0.06
344	0.05
345	0.05
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.07
353	0.08
354	0.1
355	0.15
356	0.16
357	0.19
358	0.25
359	0.29
360	0.3
361	0.36
362	0.38
363	0.39
364	0.44
365	0.48
366	0.43
367	0.41
368	0.37
369	0.3
370	0.27
371	0.22
372	0.18
373	0.11
374	0.1
375	0.1
376	0.11
377	0.13
378	0.16
379	0.15
380	0.14
381	0.15
382	0.19
383	0.19
384	0.22
385	0.24
386	0.25
387	0.29
388	0.3
389	0.31
390	0.29
391	0.28
392	0.25
393	0.23
394	0.18
395	0.13
396	0.13
397	0.11
398	0.09
399	0.08
400	0.06
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.03
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.05
416	0.05
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.07
421	0.07
422	0.08
423	0.13
424	0.13
425	0.14
426	0.13
427	0.14
428	0.14
429	0.15
430	0.19
431	0.15
432	0.18
433	0.23
434	0.25
435	0.28
436	0.28
437	0.28
438	0.29
439	0.35
440	0.43
441	0.46
442	0.48
443	0.49
444	0.54
445	0.56
446	0.55
447	0.48
448	0.44
449	0.4
450	0.38
451	0.37
452	0.32
453	0.3
454	0.26
455	0.26
456	0.26
457	0.22
458	0.2
459	0.17
460	0.18
461	0.17
462	0.16
463	0.17
464	0.11
465	0.11
466	0.15
467	0.18
468	0.19
469	0.25
470	0.3
471	0.36
472	0.44
473	0.49
474	0.54
475	0.54
476	0.57
477	0.61
478	0.64
479	0.62
480	0.6
481	0.58
482	0.54
483	0.54

A0A0C2SK39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer