Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B2VV79

Protein Details
Accession B2VV79    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
399-428VDGGGGQKVKRNQRRHKSKAKSESKFESKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
406-423KVKRNQRRHKSKAKSESK
Subcellular Location(s) cyto 9, cyto_nucl 8.666, cyto_pero 7.333, nucl 7, mito_nucl 6.833, mito 5.5, pero 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039637  CNOT7/CNOT8/Pop2  
IPR006941  RNase_CAF1  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0030014  C:CCR4-NOT complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004535  F:poly(A)-specific ribonuclease activity  
GO:0006402  P:mRNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF04857  CAF1  
Amino Acid Sequences MVSNTFPTCRLGNSCERDLSDDTEFPGVVARPIGDFNSKASYHYQTVRCNVDLLKIIQLGVTLFNVQGDVPPSHLDTSNLRYKPKSLQRHASNIVVCPCTWSFNFNFALEEDMYNEESIQMLKKSGADFEKHREQGIDPKEFGSLLTTSGMVISEDVNWISFHSGYDFAYMLKMLTSKPLPEDEEAYRKLVKMFFPKLLDVKYLWRHANNLVRRGVIGSTATNILNNLGTKSGLQDLADELGCQRVGNSHTAGSDAWLTGVVFWEMKKKIFDGTVPEEMSGHMWGLTGVGPPASATAQAAVIAAQGASQGLSGFQQGVNNTFYPGNARHGVDGPSTPTNHPAGLANTPGPTGMMTPGAYGYGNNGMVPSGHYGDIGLSRLGNPLMAPSMTPRVNSDGGVDGGGGQKVKRNQRRHKSKAKSESKFESKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.46
3 0.46
4 0.47
5 0.45
6 0.43
7 0.38
8 0.32
9 0.3
10 0.28
11 0.26
12 0.21
13 0.22
14 0.18
15 0.14
16 0.14
17 0.13
18 0.12
19 0.14
20 0.16
21 0.16
22 0.17
23 0.18
24 0.24
25 0.24
26 0.24
27 0.27
28 0.3
29 0.31
30 0.39
31 0.42
32 0.42
33 0.48
34 0.51
35 0.47
36 0.45
37 0.4
38 0.37
39 0.35
40 0.31
41 0.29
42 0.25
43 0.24
44 0.21
45 0.21
46 0.17
47 0.13
48 0.12
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.11
56 0.11
57 0.12
58 0.13
59 0.15
60 0.16
61 0.17
62 0.18
63 0.18
64 0.24
65 0.32
66 0.33
67 0.35
68 0.34
69 0.37
70 0.45
71 0.51
72 0.55
73 0.55
74 0.62
75 0.66
76 0.73
77 0.74
78 0.7
79 0.62
80 0.55
81 0.51
82 0.42
83 0.35
84 0.3
85 0.27
86 0.25
87 0.23
88 0.23
89 0.2
90 0.24
91 0.26
92 0.22
93 0.23
94 0.19
95 0.23
96 0.19
97 0.18
98 0.14
99 0.13
100 0.14
101 0.13
102 0.12
103 0.09
104 0.08
105 0.09
106 0.1
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.11
111 0.12
112 0.16
113 0.18
114 0.2
115 0.23
116 0.29
117 0.38
118 0.37
119 0.37
120 0.33
121 0.32
122 0.37
123 0.4
124 0.37
125 0.29
126 0.28
127 0.28
128 0.27
129 0.25
130 0.19
131 0.13
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.11
166 0.14
167 0.15
168 0.15
169 0.19
170 0.18
171 0.23
172 0.24
173 0.24
174 0.23
175 0.21
176 0.22
177 0.21
178 0.21
179 0.23
180 0.25
181 0.27
182 0.28
183 0.29
184 0.29
185 0.28
186 0.26
187 0.19
188 0.22
189 0.22
190 0.25
191 0.25
192 0.24
193 0.25
194 0.28
195 0.35
196 0.34
197 0.35
198 0.31
199 0.3
200 0.29
201 0.28
202 0.23
203 0.16
204 0.13
205 0.08
206 0.07
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.09
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.13
239 0.13
240 0.11
241 0.1
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.12
252 0.13
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.17
257 0.18
258 0.19
259 0.2
260 0.24
261 0.27
262 0.27
263 0.26
264 0.24
265 0.23
266 0.23
267 0.16
268 0.11
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.08
303 0.09
304 0.12
305 0.14
306 0.14
307 0.15
308 0.14
309 0.14
310 0.16
311 0.18
312 0.2
313 0.22
314 0.22
315 0.22
316 0.24
317 0.26
318 0.23
319 0.23
320 0.22
321 0.22
322 0.24
323 0.22
324 0.24
325 0.23
326 0.22
327 0.21
328 0.2
329 0.19
330 0.19
331 0.2
332 0.18
333 0.17
334 0.17
335 0.16
336 0.14
337 0.11
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.1
344 0.1
345 0.1
346 0.09
347 0.1
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.13
355 0.14
356 0.12
357 0.12
358 0.11
359 0.12
360 0.13
361 0.14
362 0.14
363 0.12
364 0.1
365 0.1
366 0.13
367 0.12
368 0.11
369 0.09
370 0.1
371 0.12
372 0.11
373 0.11
374 0.13
375 0.21
376 0.21
377 0.22
378 0.23
379 0.26
380 0.28
381 0.28
382 0.26
383 0.22
384 0.21
385 0.2
386 0.18
387 0.13
388 0.14
389 0.15
390 0.14
391 0.12
392 0.17
393 0.25
394 0.36
395 0.45
396 0.54
397 0.64
398 0.74
399 0.85
400 0.89
401 0.92
402 0.92
403 0.94
404 0.94
405 0.94
406 0.91
407 0.88
408 0.88