Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2XL01

Protein Details
Accession A0A0C2XL01    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-169ETEWNPPKKSRSQKDRQKKAKTTHDSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
149-162PKKSRSQKDRQKKA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MASLKRKREEIEDSEDDEPAYGRQILPVAALPNDFDEEPANGMEYLFTVRREMRSLPIVTRVANPYEVASFPQPPTTDKFSPSHPALPSPEWRAIYKSRFCNFRKNFNQPTIHVQYVSNASRKLMPDKKERDLWWAFLSGKPETEWNPPKKSRSQKDRQKKAKTTHDSTDNEETVLNYEVYQPDSIVREASSTGPASERLPPPSRFTPREPLPSLLKCIDELMALHLLMYFAHWFNLYLDGCEIYCPTECHARWIFSLLARTEDRISGDDVASLRGLARACITILGRLLGQHPSAEVSADQGDLISKQSCWIIISTVVDIWEQHDLWMDAEDMLKSIPC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.47
3 0.4
4 0.31
5 0.25
6 0.17
7 0.15
8 0.12
9 0.1
10 0.12
11 0.13
12 0.13
13 0.14
14 0.16
15 0.15
16 0.14
17 0.15
18 0.14
19 0.14
20 0.16
21 0.15
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.14
26 0.13
27 0.13
28 0.11
29 0.11
30 0.1
31 0.09
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.14
36 0.17
37 0.19
38 0.22
39 0.24
40 0.25
41 0.3
42 0.32
43 0.31
44 0.35
45 0.35
46 0.33
47 0.35
48 0.33
49 0.29
50 0.27
51 0.25
52 0.2
53 0.2
54 0.19
55 0.17
56 0.17
57 0.18
58 0.18
59 0.21
60 0.21
61 0.22
62 0.27
63 0.32
64 0.31
65 0.32
66 0.33
67 0.33
68 0.39
69 0.4
70 0.4
71 0.34
72 0.35
73 0.35
74 0.38
75 0.38
76 0.36
77 0.38
78 0.34
79 0.34
80 0.35
81 0.37
82 0.41
83 0.43
84 0.47
85 0.47
86 0.54
87 0.56
88 0.62
89 0.61
90 0.64
91 0.65
92 0.66
93 0.68
94 0.67
95 0.69
96 0.6
97 0.64
98 0.59
99 0.5
100 0.42
101 0.35
102 0.3
103 0.31
104 0.32
105 0.26
106 0.2
107 0.2
108 0.23
109 0.24
110 0.31
111 0.31
112 0.34
113 0.41
114 0.47
115 0.51
116 0.54
117 0.53
118 0.52
119 0.47
120 0.44
121 0.36
122 0.32
123 0.28
124 0.24
125 0.26
126 0.19
127 0.17
128 0.15
129 0.16
130 0.15
131 0.24
132 0.3
133 0.33
134 0.4
135 0.43
136 0.47
137 0.54
138 0.62
139 0.62
140 0.64
141 0.69
142 0.72
143 0.8
144 0.87
145 0.88
146 0.88
147 0.87
148 0.85
149 0.85
150 0.82
151 0.77
152 0.71
153 0.69
154 0.6
155 0.57
156 0.53
157 0.42
158 0.34
159 0.29
160 0.24
161 0.17
162 0.16
163 0.12
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.08
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.11
184 0.16
185 0.17
186 0.21
187 0.26
188 0.27
189 0.32
190 0.39
191 0.45
192 0.43
193 0.46
194 0.5
195 0.49
196 0.56
197 0.52
198 0.48
199 0.48
200 0.45
201 0.44
202 0.36
203 0.32
204 0.24
205 0.22
206 0.19
207 0.13
208 0.11
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.14
224 0.13
225 0.12
226 0.12
227 0.13
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.11
235 0.19
236 0.19
237 0.26
238 0.28
239 0.29
240 0.28
241 0.3
242 0.3
243 0.24
244 0.29
245 0.22
246 0.24
247 0.23
248 0.24
249 0.22
250 0.22
251 0.21
252 0.18
253 0.19
254 0.16
255 0.16
256 0.16
257 0.15
258 0.15
259 0.13
260 0.12
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.13
269 0.13
270 0.12
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.12
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.12
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.11
292 0.1
293 0.09
294 0.11
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.14
301 0.16
302 0.16
303 0.16
304 0.16
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.16
309 0.14
310 0.13
311 0.16
312 0.16
313 0.16
314 0.17
315 0.16
316 0.12
317 0.14
318 0.13
319 0.1