Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2SMP0

Protein Details
Accession A0A0C2SMP0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-104RKVQAKKYIIPRNKRPKYKLRSANLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-98GGGRKVQAKKYIIPRNKRPKYK
Subcellular Location(s) cyto 13, nucl 8, cyto_mito 8, cyto_pero 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
Amino Acid Sequences AQLLCDQKPGKTWVYQFLARHSMVKLGKPSGLDPKRAQAFNKPTVKRHFTLLESVIKENEIPPENIYNMDEKGVQRGGGRKVQAKKYIIPRNKRPKYKLRSANLELVTIVECVAADGGWLSPGIIFEGKQQYECAWFEVDPAISIGLSDNGWTSDFHCLQWFKDNFIPQATARNTSGKPILLLYDGHGSHEKYELLRLAKAHNIILFSLPPHTTHMLQPLDVGVFGPFSRAWIEQCDDYMEEYLEEIPRDQFVKHY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.49
3 0.46
4 0.47
5 0.49
6 0.44
7 0.43
8 0.35
9 0.36
10 0.33
11 0.36
12 0.35
13 0.32
14 0.33
15 0.32
16 0.35
17 0.38
18 0.4
19 0.41
20 0.39
21 0.45
22 0.49
23 0.51
24 0.5
25 0.49
26 0.53
27 0.56
28 0.63
29 0.58
30 0.59
31 0.65
32 0.7
33 0.61
34 0.58
35 0.53
36 0.45
37 0.47
38 0.44
39 0.42
40 0.37
41 0.37
42 0.32
43 0.28
44 0.26
45 0.21
46 0.23
47 0.18
48 0.17
49 0.18
50 0.2
51 0.2
52 0.21
53 0.2
54 0.17
55 0.15
56 0.15
57 0.16
58 0.13
59 0.16
60 0.16
61 0.16
62 0.16
63 0.21
64 0.24
65 0.26
66 0.29
67 0.33
68 0.39
69 0.45
70 0.5
71 0.48
72 0.5
73 0.55
74 0.62
75 0.63
76 0.65
77 0.69
78 0.73
79 0.79
80 0.82
81 0.79
82 0.8
83 0.8
84 0.82
85 0.81
86 0.76
87 0.76
88 0.71
89 0.71
90 0.61
91 0.53
92 0.42
93 0.33
94 0.27
95 0.18
96 0.14
97 0.06
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.03
102 0.02
103 0.03
104 0.02
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.07
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.13
118 0.12
119 0.15
120 0.15
121 0.14
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.1
127 0.08
128 0.07
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.17
145 0.17
146 0.18
147 0.27
148 0.26
149 0.24
150 0.27
151 0.3
152 0.27
153 0.28
154 0.29
155 0.2
156 0.28
157 0.26
158 0.25
159 0.24
160 0.28
161 0.26
162 0.27
163 0.29
164 0.21
165 0.2
166 0.17
167 0.17
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.16
172 0.15
173 0.17
174 0.19
175 0.18
176 0.18
177 0.19
178 0.18
179 0.13
180 0.16
181 0.18
182 0.18
183 0.2
184 0.2
185 0.2
186 0.23
187 0.24
188 0.23
189 0.2
190 0.19
191 0.18
192 0.18
193 0.16
194 0.13
195 0.15
196 0.14
197 0.13
198 0.16
199 0.19
200 0.19
201 0.21
202 0.28
203 0.26
204 0.26
205 0.25
206 0.22
207 0.19
208 0.18
209 0.16
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.08
215 0.09
216 0.12
217 0.12
218 0.14
219 0.18
220 0.21
221 0.2
222 0.22
223 0.24
224 0.22
225 0.22
226 0.22
227 0.18
228 0.14
229 0.14
230 0.15
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.13
235 0.15
236 0.16