Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2XNP4

Protein Details
Accession A0A0C2XNP4    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
261-280GKTRSTPKSRTEKKEKVFIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-65KHRGGPGSRGGKYYSRGGGK
84-111EPRKFENGRGRGRGRGRGGERGSRGGHR
284-336RFERPERGGRGRGRGDRGHGDRGRGDRGDRGDRGERGERGRGGRGRGGGRGGR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.5, cyto 13.5, nucl 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVATKNPFAILDSEDASRSSSPAPAPTKGAQAPLPAQPSSRGTSKHRGGPGSRGGKYYSRGGGKAAPRDADQPQNAPEEAPAEPRKFENGRGRGRGRGRGGERGSRGGHRAFDRHSQTGKTDSDKKFHQGWGGDDGNQELKTEQAATVDAAVEGDSWGGNAPSGDWGGAAPSADWGSGDAAPAEPASAPVEEDKEGKPRREEEEDNTLTLDQYRAKEKEKETIVPKLEGPRKANDGADDSAFKDVVLLTKDEDAESYFVGKTRSTPKSRTEKKEKVFIEIDARFERPERGGRGRGRGDRGHGDRGRGDRGDRGDRGERGERGRGGRGRGGGRGGRQNGPSEINVDDENAFPSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.19
4 0.19
5 0.17
6 0.16
7 0.15
8 0.17
9 0.17
10 0.25
11 0.29
12 0.29
13 0.34
14 0.35
15 0.4
16 0.38
17 0.4
18 0.34
19 0.34
20 0.35
21 0.35
22 0.36
23 0.3
24 0.29
25 0.3
26 0.32
27 0.31
28 0.33
29 0.32
30 0.35
31 0.44
32 0.49
33 0.53
34 0.55
35 0.57
36 0.55
37 0.58
38 0.61
39 0.59
40 0.55
41 0.5
42 0.48
43 0.46
44 0.46
45 0.44
46 0.41
47 0.36
48 0.35
49 0.35
50 0.39
51 0.4
52 0.44
53 0.42
54 0.37
55 0.34
56 0.38
57 0.4
58 0.41
59 0.37
60 0.33
61 0.32
62 0.33
63 0.32
64 0.28
65 0.24
66 0.19
67 0.17
68 0.22
69 0.24
70 0.22
71 0.23
72 0.24
73 0.3
74 0.29
75 0.37
76 0.4
77 0.44
78 0.5
79 0.57
80 0.59
81 0.6
82 0.64
83 0.64
84 0.58
85 0.57
86 0.53
87 0.54
88 0.55
89 0.54
90 0.51
91 0.48
92 0.46
93 0.39
94 0.39
95 0.32
96 0.33
97 0.29
98 0.3
99 0.29
100 0.35
101 0.38
102 0.39
103 0.39
104 0.36
105 0.35
106 0.37
107 0.36
108 0.34
109 0.38
110 0.36
111 0.38
112 0.38
113 0.41
114 0.39
115 0.38
116 0.37
117 0.29
118 0.29
119 0.31
120 0.3
121 0.27
122 0.23
123 0.23
124 0.2
125 0.18
126 0.16
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.04
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.03
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.1
181 0.1
182 0.18
183 0.22
184 0.24
185 0.26
186 0.28
187 0.32
188 0.36
189 0.38
190 0.34
191 0.41
192 0.39
193 0.37
194 0.34
195 0.29
196 0.23
197 0.21
198 0.17
199 0.1
200 0.11
201 0.17
202 0.19
203 0.22
204 0.28
205 0.3
206 0.36
207 0.36
208 0.41
209 0.39
210 0.44
211 0.42
212 0.38
213 0.38
214 0.39
215 0.42
216 0.42
217 0.41
218 0.37
219 0.39
220 0.39
221 0.38
222 0.31
223 0.29
224 0.25
225 0.23
226 0.2
227 0.17
228 0.16
229 0.15
230 0.13
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.12
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.14
250 0.22
251 0.31
252 0.34
253 0.39
254 0.47
255 0.57
256 0.67
257 0.73
258 0.75
259 0.76
260 0.76
261 0.81
262 0.72
263 0.68
264 0.6
265 0.53
266 0.51
267 0.43
268 0.42
269 0.35
270 0.35
271 0.29
272 0.28
273 0.28
274 0.23
275 0.28
276 0.3
277 0.34
278 0.42
279 0.46
280 0.54
281 0.59
282 0.62
283 0.62
284 0.59
285 0.58
286 0.59
287 0.59
288 0.6
289 0.54
290 0.52
291 0.51
292 0.51
293 0.51
294 0.44
295 0.41
296 0.37
297 0.41
298 0.45
299 0.41
300 0.44
301 0.45
302 0.45
303 0.49
304 0.5
305 0.48
306 0.46
307 0.51
308 0.49
309 0.47
310 0.53
311 0.51
312 0.5
313 0.49
314 0.5
315 0.47
316 0.45
317 0.47
318 0.43
319 0.45
320 0.49
321 0.49
322 0.48
323 0.48
324 0.49
325 0.46
326 0.45
327 0.4
328 0.33
329 0.29
330 0.26
331 0.24
332 0.21
333 0.19
334 0.16
335 0.17