FuNGI

A0A0C2SQN1

Protein Details

Accession

A0A0C2SQN1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
490-509	MSRMCPTKKKGNGGRFQKGG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
497-516	KKKGNGGRFQKGGWKGKGKP

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045358 Ty3_capsid IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding
Pfam	View protein in Pfam PF19259 Ty3_capsid PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

MNAGLYRILESADHLHLESTIDQQLVPTHAVRTLDPRSGRYVFDLHGRRIYQDPSNHLWYYLISNQQVPRSEFFVPQTAGRLPSGSVIHEGRLYFDETEIYFDHDTRRWRSRVGNNPLSDEPFLGPEYIPGNPEEELPTHLRTQSTAVVGPINPGTVFSANTESSDKEGTSGTDNALEYISADQEEDAELEQQEEGNQSETHLETVVPPTPLNLELLQIEPPVDPITTTPDVEMSQAPPQNNHQGGGGGAKLPLPEDFTGVRSKCSGFLASIRAYFSFYPNQFASDAQKITLALMCCKGAASTWRDSKFMKFDTDPVSHGTWNEFRTRFINQWEEVSAMASAMIKIQKLELGKKYNMTQLISRFDELIPYCKIQDNEPMKIHFFTQCFPDNIKTHIFLKNPMTYNDARKYATEFGLAYDRIDTDNGKRPRYRTTGNDNYNHQQRDPNAMDVDAINFEEGTNIRFTKLSPSQVEDYKKQGKCFNCGQKGHMSRMCPTKKKGNGGRFQKGGWKGKGKPLQSIRSAETEEEPAKENRGEGSSSGNDVARIRAMIKALDEEDRIEVLGKDF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.16
3	0.16
4	0.18
5	0.17
6	0.16
7	0.16
8	0.15
9	0.15
10	0.15
11	0.18
12	0.18
13	0.19
14	0.17
15	0.15
16	0.18
17	0.2
18	0.2
19	0.25
20	0.28
21	0.33
22	0.34
23	0.35
24	0.39
25	0.4
26	0.4
27	0.36
28	0.35
29	0.29
30	0.36
31	0.4
32	0.37
33	0.41
34	0.41
35	0.4
36	0.4
37	0.43
38	0.41
39	0.4
40	0.43
41	0.43
42	0.48
43	0.46
44	0.42
45	0.38
46	0.32
47	0.32
48	0.3
49	0.3
50	0.25
51	0.3
52	0.33
53	0.37
54	0.41
55	0.39
56	0.36
57	0.35
58	0.35
59	0.33
60	0.33
61	0.34
62	0.3
63	0.28
64	0.29
65	0.28
66	0.27
67	0.25
68	0.23
69	0.17
70	0.2
71	0.2
72	0.17
73	0.19
74	0.18
75	0.19
76	0.21
77	0.2
78	0.18
79	0.19
80	0.2
81	0.16
82	0.15
83	0.16
84	0.14
85	0.17
86	0.15
87	0.17
88	0.15
89	0.16
90	0.19
91	0.21
92	0.27
93	0.31
94	0.39
95	0.37
96	0.4
97	0.49
98	0.55
99	0.62
100	0.66
101	0.68
102	0.62
103	0.65
104	0.62
105	0.56
106	0.47
107	0.38
108	0.28
109	0.21
110	0.2
111	0.16
112	0.14
113	0.12
114	0.13
115	0.13
116	0.13
117	0.11
118	0.13
119	0.12
120	0.13
121	0.13
122	0.12
123	0.15
124	0.17
125	0.19
126	0.19
127	0.2
128	0.2
129	0.19
130	0.21
131	0.21
132	0.19
133	0.18
134	0.17
135	0.17
136	0.17
137	0.18
138	0.15
139	0.12
140	0.1
141	0.1
142	0.11
143	0.1
144	0.1
145	0.1
146	0.14
147	0.13
148	0.15
149	0.16
150	0.14
151	0.15
152	0.16
153	0.14
154	0.12
155	0.12
156	0.11
157	0.13
158	0.14
159	0.12
160	0.14
161	0.14
162	0.13
163	0.13
164	0.12
165	0.09
166	0.09
167	0.08
168	0.06
169	0.06
170	0.05
171	0.05
172	0.06
173	0.05
174	0.05
175	0.06
176	0.06
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.07
182	0.07
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.1
187	0.1
188	0.1
189	0.09
190	0.09
191	0.08
192	0.1
193	0.12
194	0.11
195	0.11
196	0.11
197	0.12
198	0.12
199	0.13
200	0.11
201	0.09
202	0.09
203	0.1
204	0.1
205	0.09
206	0.09
207	0.07
208	0.08
209	0.08
210	0.07
211	0.06
212	0.06
213	0.12
214	0.13
215	0.13
216	0.12
217	0.13
218	0.13
219	0.14
220	0.15
221	0.1
222	0.14
223	0.16
224	0.17
225	0.17
226	0.2
227	0.26
228	0.25
229	0.24
230	0.19
231	0.17
232	0.17
233	0.17
234	0.14
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.06
239	0.07
240	0.06
241	0.08
242	0.08
243	0.09
244	0.1
245	0.11
246	0.17
247	0.16
248	0.17
249	0.16
250	0.16
251	0.15
252	0.16
253	0.15
254	0.1
255	0.12
256	0.15
257	0.15
258	0.15
259	0.14
260	0.13
261	0.14
262	0.14
263	0.14
264	0.16
265	0.16
266	0.18
267	0.18
268	0.19
269	0.18
270	0.18
271	0.19
272	0.17
273	0.17
274	0.13
275	0.14
276	0.12
277	0.12
278	0.14
279	0.11
280	0.08
281	0.09
282	0.09
283	0.08
284	0.08
285	0.08
286	0.06
287	0.1
288	0.13
289	0.17
290	0.24
291	0.25
292	0.27
293	0.28
294	0.3
295	0.31
296	0.29
297	0.27
298	0.22
299	0.24
300	0.28
301	0.29
302	0.27
303	0.25
304	0.25
305	0.21
306	0.21
307	0.2
308	0.18
309	0.18
310	0.23
311	0.2
312	0.2
313	0.22
314	0.25
315	0.24
316	0.25
317	0.28
318	0.23
319	0.24
320	0.23
321	0.21
322	0.18
323	0.16
324	0.12
325	0.07
326	0.07
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.07
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.09
335	0.11
336	0.16
337	0.2
338	0.25
339	0.26
340	0.29
341	0.31
342	0.32
343	0.33
344	0.3
345	0.27
346	0.26
347	0.3
348	0.29
349	0.28
350	0.25
351	0.22
352	0.24
353	0.21
354	0.21
355	0.18
356	0.17
357	0.18
358	0.2
359	0.2
360	0.18
361	0.27
362	0.28
363	0.32
364	0.34
365	0.35
366	0.33
367	0.33
368	0.33
369	0.28
370	0.24
371	0.19
372	0.21
373	0.23
374	0.24
375	0.25
376	0.3
377	0.27
378	0.29
379	0.3
380	0.28
381	0.27
382	0.31
383	0.3
384	0.28
385	0.32
386	0.36
387	0.36
388	0.35
389	0.37
390	0.34
391	0.4
392	0.41
393	0.39
394	0.33
395	0.32
396	0.35
397	0.33
398	0.31
399	0.25
400	0.2
401	0.18
402	0.22
403	0.21
404	0.18
405	0.15
406	0.14
407	0.13
408	0.14
409	0.14
410	0.14
411	0.24
412	0.29
413	0.34
414	0.37
415	0.39
416	0.46
417	0.51
418	0.52
419	0.5
420	0.56
421	0.61
422	0.64
423	0.67
424	0.65
425	0.66
426	0.67
427	0.62
428	0.53
429	0.47
430	0.42
431	0.46
432	0.43
433	0.39
434	0.32
435	0.3
436	0.29
437	0.24
438	0.24
439	0.15
440	0.13
441	0.09
442	0.08
443	0.07
444	0.09
445	0.09
446	0.09
447	0.11
448	0.11
449	0.12
450	0.13
451	0.13
452	0.21
453	0.26
454	0.31
455	0.31
456	0.36
457	0.39
458	0.46
459	0.51
460	0.45
461	0.48
462	0.51
463	0.51
464	0.5
465	0.53
466	0.5
467	0.5
468	0.58
469	0.6
470	0.6
471	0.59
472	0.59
473	0.62
474	0.63
475	0.65
476	0.59
477	0.51
478	0.48
479	0.56
480	0.62
481	0.58
482	0.6
483	0.61
484	0.65
485	0.73
486	0.76
487	0.76
488	0.77
489	0.79
490	0.82
491	0.74
492	0.68
493	0.66
494	0.66
495	0.65
496	0.63
497	0.62
498	0.58
499	0.66
500	0.72
501	0.65
502	0.66
503	0.66
504	0.66
505	0.64
506	0.64
507	0.57
508	0.55
509	0.54
510	0.46
511	0.4
512	0.38
513	0.33
514	0.3
515	0.3
516	0.26
517	0.28
518	0.27
519	0.25
520	0.22
521	0.23
522	0.23
523	0.2
524	0.25
525	0.23
526	0.25
527	0.26
528	0.24
529	0.23
530	0.23
531	0.24
532	0.19
533	0.18
534	0.16
535	0.17
536	0.18
537	0.18
538	0.18
539	0.21
540	0.21
541	0.23
542	0.23
543	0.22
544	0.22
545	0.21
546	0.2
547	0.17

A0A0C2SQN1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer