Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2BWW4

Protein Details
Accession A0A0D2BWW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-39VHYYCWRNHKADARRRRRRKRVNQREDPLSNLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-28KADARRRRRRKR
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 7, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR007233  TRAPPC  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005794  C:Golgi apparatus  
GO:0030008  C:TRAPP complex  
GO:0006888  P:endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF04099  Sybindin  
CDD cd14856  TRAPPC4_synbindin  
Amino Acid Sequences MVVKEASVHYYCWRNHKADARRRRRRKRVNQREDPLSNLGVLYAEFLRCPPDPKNVAHTHMQLTDSVTGTRWYLRYPSQATMPVFALLIISKAGSLIYHRTFPTTSPGTAAGNLTGQSQTQTVGTLGLPGTSTLTTNDYLVLAGTFHGVHAITRSLTPKLPVTSSATTPSGKNWTYPDPTVAPSGIESLESSFFRLTVFQTLSGTKFLLFTDPSMPNTDVLMKGIYERYADYVCKNPFWQMEMPIRIEAWDRSLGQWLTRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.5
3 0.58
4 0.64
5 0.67
6 0.75
7 0.76
8 0.81
9 0.89
10 0.93
11 0.94
12 0.95
13 0.96
14 0.97
15 0.97
16 0.97
17 0.96
18 0.94
19 0.92
20 0.83
21 0.77
22 0.69
23 0.58
24 0.46
25 0.35
26 0.26
27 0.17
28 0.14
29 0.11
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.12
35 0.13
36 0.17
37 0.18
38 0.25
39 0.29
40 0.32
41 0.41
42 0.41
43 0.44
44 0.45
45 0.45
46 0.39
47 0.37
48 0.35
49 0.27
50 0.25
51 0.23
52 0.19
53 0.17
54 0.14
55 0.13
56 0.13
57 0.15
58 0.13
59 0.12
60 0.14
61 0.17
62 0.23
63 0.26
64 0.27
65 0.28
66 0.33
67 0.33
68 0.31
69 0.29
70 0.22
71 0.19
72 0.17
73 0.14
74 0.08
75 0.07
76 0.05
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.1
84 0.11
85 0.14
86 0.14
87 0.16
88 0.17
89 0.18
90 0.23
91 0.2
92 0.19
93 0.17
94 0.18
95 0.17
96 0.17
97 0.17
98 0.11
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.05
119 0.06
120 0.05
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.13
145 0.15
146 0.16
147 0.16
148 0.17
149 0.21
150 0.21
151 0.22
152 0.24
153 0.23
154 0.22
155 0.22
156 0.22
157 0.22
158 0.2
159 0.21
160 0.21
161 0.25
162 0.28
163 0.28
164 0.29
165 0.25
166 0.26
167 0.26
168 0.23
169 0.18
170 0.14
171 0.14
172 0.11
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.15
188 0.17
189 0.18
190 0.19
191 0.18
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.18
199 0.2
200 0.21
201 0.25
202 0.25
203 0.22
204 0.23
205 0.24
206 0.18
207 0.17
208 0.16
209 0.12
210 0.13
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.15
216 0.17
217 0.18
218 0.19
219 0.26
220 0.27
221 0.3
222 0.3
223 0.32
224 0.31
225 0.34
226 0.34
227 0.33
228 0.39
229 0.4
230 0.41
231 0.38
232 0.36
233 0.32
234 0.32
235 0.27
236 0.22
237 0.22
238 0.21
239 0.21
240 0.28
241 0.28