Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B2W2H1

Protein Details
Accession B2W2H1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-48SPSVVVSKQRSRRKSTRPEGENVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029040  RPABC4/Spt4  
IPR009287  Spt4  
IPR022800  Spt4/RpoE2_Znf  
IPR038510  Spt4_sf  
Gene Ontology GO:0000775  C:chromosome, centromeric region  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0032786  P:positive regulation of DNA-templated transcription, elongation  
Pfam View protein in Pfam  
PF06093  Spt4  
CDD cd07973  Spt4  
Amino Acid Sequences MARKGRATIKTPDKYITVDSDSGEESPSVVVSKQRSRRKSTRPEGENVDPVASRDGLNLSKAPGPQDGRRQPRQDARTGGQSTSLAGSLFPDNHSDADFPSIQPTHTTLSFATDSQNQPKSSSRAETSARRVRTTGPARGQGRDNTDDSDMSNKPIQGGAYIPPNQQRNMRACMVCSVVRTQQQFLTEGCPNCEDVLELAGNPEQINDCTSQVFDGLISVSDTSRSWVARYQRLEGYRPGVYATQVEGILPEDVIGLVESAGINYVPRDGSEQDTLPRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.47
3 0.42
4 0.36
5 0.31
6 0.29
7 0.27
8 0.26
9 0.24
10 0.21
11 0.16
12 0.11
13 0.1
14 0.1
15 0.09
16 0.09
17 0.13
18 0.18
19 0.28
20 0.37
21 0.47
22 0.54
23 0.62
24 0.71
25 0.78
26 0.82
27 0.84
28 0.85
29 0.81
30 0.8
31 0.78
32 0.73
33 0.68
34 0.57
35 0.48
36 0.38
37 0.33
38 0.29
39 0.22
40 0.17
41 0.13
42 0.15
43 0.14
44 0.16
45 0.15
46 0.15
47 0.18
48 0.19
49 0.2
50 0.22
51 0.26
52 0.29
53 0.39
54 0.46
55 0.51
56 0.59
57 0.61
58 0.63
59 0.67
60 0.67
61 0.63
62 0.6
63 0.54
64 0.55
65 0.53
66 0.46
67 0.38
68 0.34
69 0.28
70 0.22
71 0.2
72 0.1
73 0.08
74 0.1
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.11
79 0.11
80 0.12
81 0.13
82 0.11
83 0.1
84 0.13
85 0.13
86 0.11
87 0.14
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.15
92 0.14
93 0.13
94 0.15
95 0.11
96 0.14
97 0.15
98 0.14
99 0.14
100 0.16
101 0.19
102 0.23
103 0.28
104 0.25
105 0.26
106 0.3
107 0.31
108 0.29
109 0.3
110 0.25
111 0.25
112 0.29
113 0.32
114 0.37
115 0.4
116 0.4
117 0.37
118 0.37
119 0.34
120 0.4
121 0.4
122 0.38
123 0.35
124 0.4
125 0.41
126 0.42
127 0.42
128 0.36
129 0.35
130 0.31
131 0.29
132 0.23
133 0.22
134 0.2
135 0.18
136 0.2
137 0.15
138 0.15
139 0.16
140 0.14
141 0.13
142 0.14
143 0.14
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.14
148 0.16
149 0.17
150 0.21
151 0.23
152 0.24
153 0.27
154 0.31
155 0.29
156 0.32
157 0.35
158 0.31
159 0.29
160 0.29
161 0.29
162 0.24
163 0.21
164 0.19
165 0.19
166 0.23
167 0.24
168 0.24
169 0.23
170 0.23
171 0.23
172 0.21
173 0.22
174 0.22
175 0.22
176 0.22
177 0.2
178 0.2
179 0.18
180 0.18
181 0.13
182 0.09
183 0.1
184 0.08
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.08
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.09
211 0.11
212 0.12
213 0.12
214 0.18
215 0.24
216 0.31
217 0.34
218 0.37
219 0.41
220 0.44
221 0.46
222 0.45
223 0.43
224 0.36
225 0.33
226 0.31
227 0.25
228 0.23
229 0.21
230 0.18
231 0.16
232 0.14
233 0.14
234 0.12
235 0.13
236 0.12
237 0.1
238 0.09
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.13
256 0.14
257 0.19
258 0.23
259 0.25