Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B2VWF2

Protein Details
Accession B2VWF2    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-129GVAPRAKMNQQRSRRFRAAREAKEKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
878-891RGGFRGRGRGGRGG
1063-1078RGGRGGRGGRGGYRGG
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 9, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
GO:0051984  P:positive regulation of chromosome segregation  
GO:0106354  P:tRNA surveillance  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPAMFRWLSQKYPKIVSTVQEELPKKVGDAVIPVDRTGPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDKPAPKTEADMMMAIFEYTDRVVGMVRPRKLLYMAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAREAKEKDEERAEFQKILNSQKASRGEDINTLEEVVEKTWDSNAITPGTPFMHLLAESLQYWCAYKFTTDPSWKDMKVIISDASVPGEGEHKIMNFIRSQRAMPTHDPNTSHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFKVLREDVFYDSGKDKVCTRCGRKGHIRTNCEFPEDEKKLTEEEAAEEWATSEHQLKPYIWLHTNVLREYLAVEMDTPKRTFKYDLERSLDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRDQGIDLLISIWRDLAAEMDDYVTKDGYPDMRRVQQIMSALASREAGIFKKRKEVADRQAANRARREAQSNAHKRQRTDNDGVSAPGFKRAKETTDTYTSAGIVFFDPKDAQSKEVRDVHKDIMHSRDSQSNKSAAARLKEMLKAKADGTSLPEPEPTPDSEPASESASGTETPVHLGKRKLDEVDDLDNGTPGRNTPVVPQSPTQAAQPPKKDDSPPEDTIMLWEDGYEERYYEQKFHVAPNDIAFRNKVARQYAEGLCWVLAYYMQGCPSWTWYFPHHYAPFAADFVGLEDMDPRKLFEKGVPFHPYEQLMGVLPAASNHAIPEPFRVLMEDPNSSIVDFYPEDFPIDLNGKKFAWQGVAVLPFIDEKRLLEAMATKYPELSDDERKRNEFGKETLMFSQESGLFDDVEKALYRKGQQKHKIDPAKSRALHGDIEPHDLFVMDSQLVPPFDADGTTDFEITQDRSMRVYYEMPSISSSRAHKSVLLEGVKLPKPALQPGEAESVRRNNERGGFRGRGRGGRGGGGGGYNDRRENQNGGGRGGYQNGRGAGGGGWDNNRGGYNGNQGGYGGPPPPHNFPPPFPGANFAPPPGGNFFPPPPPGWVPPPNLGGWQGHSAPGYGPPPVPPQGGQRGGWMGNTQHHGAPPPRQAPNNSSLRDERFYRPADEILGRSGGGGGGGGYQGNNAYNDRPPRDDRGGRGGRGGRGGYRGGGGGGGGGGGGGGYQNNRPTYNANDYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.52
3 0.53
4 0.53
5 0.5
6 0.48
7 0.45
8 0.44
9 0.46
10 0.46
11 0.43
12 0.44
13 0.4
14 0.33
15 0.32
16 0.29
17 0.22
18 0.24
19 0.26
20 0.28
21 0.28
22 0.28
23 0.27
24 0.26
25 0.27
26 0.3
27 0.29
28 0.27
29 0.28
30 0.3
31 0.3
32 0.3
33 0.32
34 0.28
35 0.27
36 0.24
37 0.21
38 0.21
39 0.18
40 0.16
41 0.13
42 0.1
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.13
49 0.18
50 0.22
51 0.22
52 0.29
53 0.38
54 0.46
55 0.53
56 0.56
57 0.54
58 0.51
59 0.53
60 0.5
61 0.45
62 0.38
63 0.31
64 0.25
65 0.22
66 0.21
67 0.17
68 0.12
69 0.08
70 0.07
71 0.06
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.11
77 0.21
78 0.28
79 0.3
80 0.34
81 0.35
82 0.37
83 0.38
84 0.38
85 0.32
86 0.32
87 0.3
88 0.27
89 0.27
90 0.25
91 0.25
92 0.23
93 0.19
94 0.12
95 0.15
96 0.21
97 0.29
98 0.39
99 0.47
100 0.55
101 0.66
102 0.74
103 0.8
104 0.83
105 0.81
106 0.78
107 0.79
108 0.79
109 0.79
110 0.81
111 0.78
112 0.73
113 0.75
114 0.7
115 0.64
116 0.61
117 0.53
118 0.49
119 0.49
120 0.47
121 0.4
122 0.39
123 0.4
124 0.36
125 0.41
126 0.41
127 0.38
128 0.37
129 0.43
130 0.48
131 0.47
132 0.46
133 0.43
134 0.38
135 0.41
136 0.42
137 0.36
138 0.3
139 0.26
140 0.22
141 0.2
142 0.19
143 0.13
144 0.12
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.13
149 0.13
150 0.15
151 0.18
152 0.19
153 0.19
154 0.18
155 0.2
156 0.19
157 0.18
158 0.15
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.12
168 0.11
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.11
174 0.12
175 0.18
176 0.26
177 0.32
178 0.34
179 0.39
180 0.45
181 0.43
182 0.43
183 0.4
184 0.34
185 0.3
186 0.3
187 0.24
188 0.19
189 0.2
190 0.19
191 0.17
192 0.14
193 0.11
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.13
201 0.15
202 0.16
203 0.18
204 0.22
205 0.27
206 0.28
207 0.29
208 0.31
209 0.34
210 0.38
211 0.4
212 0.44
213 0.42
214 0.44
215 0.45
216 0.43
217 0.44
218 0.39
219 0.34
220 0.26
221 0.22
222 0.18
223 0.18
224 0.15
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.04
231 0.03
232 0.02
233 0.03
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.09
239 0.14
240 0.16
241 0.16
242 0.2
243 0.24
244 0.27
245 0.28
246 0.3
247 0.28
248 0.29
249 0.29
250 0.27
251 0.24
252 0.23
253 0.21
254 0.21
255 0.23
256 0.25
257 0.33
258 0.4
259 0.45
260 0.51
261 0.55
262 0.63
263 0.68
264 0.73
265 0.75
266 0.75
267 0.75
268 0.69
269 0.72
270 0.65
271 0.57
272 0.47
273 0.41
274 0.42
275 0.39
276 0.38
277 0.3
278 0.3
279 0.28
280 0.28
281 0.26
282 0.16
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.13
287 0.12
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.08
292 0.11
293 0.12
294 0.15
295 0.17
296 0.17
297 0.23
298 0.26
299 0.3
300 0.29
301 0.29
302 0.29
303 0.32
304 0.35
305 0.29
306 0.27
307 0.22
308 0.2
309 0.18
310 0.16
311 0.11
312 0.07
313 0.08
314 0.1
315 0.13
316 0.16
317 0.16
318 0.18
319 0.19
320 0.21
321 0.24
322 0.25
323 0.33
324 0.38
325 0.45
326 0.49
327 0.49
328 0.48
329 0.5
330 0.45
331 0.35
332 0.26
333 0.2
334 0.15
335 0.13
336 0.12
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.06
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.12
351 0.14
352 0.15
353 0.14
354 0.15
355 0.14
356 0.14
357 0.13
358 0.08
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.12
381 0.14
382 0.17
383 0.21
384 0.26
385 0.27
386 0.28
387 0.27
388 0.24
389 0.24
390 0.21
391 0.18
392 0.14
393 0.13
394 0.12
395 0.12
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.15
401 0.2
402 0.2
403 0.29
404 0.32
405 0.35
406 0.41
407 0.49
408 0.5
409 0.56
410 0.6
411 0.54
412 0.6
413 0.61
414 0.57
415 0.52
416 0.47
417 0.39
418 0.37
419 0.39
420 0.34
421 0.37
422 0.44
423 0.49
424 0.54
425 0.58
426 0.59
427 0.56
428 0.62
429 0.62
430 0.59
431 0.55
432 0.5
433 0.45
434 0.43
435 0.42
436 0.33
437 0.27
438 0.2
439 0.22
440 0.2
441 0.16
442 0.21
443 0.21
444 0.23
445 0.25
446 0.29
447 0.26
448 0.3
449 0.32
450 0.28
451 0.27
452 0.24
453 0.2
454 0.17
455 0.12
456 0.08
457 0.08
458 0.07
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.13
463 0.13
464 0.15
465 0.18
466 0.21
467 0.25
468 0.32
469 0.33
470 0.31
471 0.34
472 0.34
473 0.33
474 0.32
475 0.28
476 0.26
477 0.26
478 0.24
479 0.23
480 0.26
481 0.26
482 0.27
483 0.28
484 0.24
485 0.23
486 0.23
487 0.26
488 0.23
489 0.22
490 0.21
491 0.2
492 0.21
493 0.25
494 0.26
495 0.24
496 0.22
497 0.22
498 0.2
499 0.21
500 0.2
501 0.16
502 0.18
503 0.18
504 0.18
505 0.17
506 0.17
507 0.15
508 0.16
509 0.17
510 0.13
511 0.14
512 0.14
513 0.15
514 0.15
515 0.15
516 0.15
517 0.15
518 0.14
519 0.11
520 0.1
521 0.09
522 0.09
523 0.08
524 0.08
525 0.06
526 0.07
527 0.09
528 0.1
529 0.12
530 0.14
531 0.17
532 0.2
533 0.22
534 0.21
535 0.2
536 0.21
537 0.21
538 0.22
539 0.2
540 0.16
541 0.15
542 0.14
543 0.13
544 0.11
545 0.08
546 0.05
547 0.07
548 0.07
549 0.08
550 0.1
551 0.17
552 0.18
553 0.2
554 0.2
555 0.2
556 0.21
557 0.21
558 0.19
559 0.19
560 0.23
561 0.27
562 0.31
563 0.33
564 0.35
565 0.37
566 0.37
567 0.36
568 0.37
569 0.39
570 0.36
571 0.34
572 0.31
573 0.28
574 0.27
575 0.25
576 0.18
577 0.1
578 0.08
579 0.07
580 0.07
581 0.09
582 0.08
583 0.06
584 0.07
585 0.1
586 0.11
587 0.12
588 0.12
589 0.14
590 0.15
591 0.17
592 0.21
593 0.21
594 0.21
595 0.22
596 0.26
597 0.23
598 0.23
599 0.21
600 0.18
601 0.19
602 0.2
603 0.21
604 0.18
605 0.19
606 0.21
607 0.26
608 0.26
609 0.23
610 0.22
611 0.18
612 0.16
613 0.14
614 0.12
615 0.06
616 0.05
617 0.05
618 0.05
619 0.06
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.08
624 0.12
625 0.13
626 0.13
627 0.14
628 0.16
629 0.22
630 0.23
631 0.31
632 0.27
633 0.27
634 0.26
635 0.26
636 0.24
637 0.18
638 0.16
639 0.09
640 0.08
641 0.08
642 0.08
643 0.06
644 0.05
645 0.07
646 0.07
647 0.09
648 0.09
649 0.09
650 0.1
651 0.1
652 0.11
653 0.13
654 0.2
655 0.22
656 0.28
657 0.31
658 0.31
659 0.32
660 0.34
661 0.31
662 0.23
663 0.21
664 0.16
665 0.12
666 0.1
667 0.09
668 0.06
669 0.05
670 0.05
671 0.06
672 0.06
673 0.05
674 0.06
675 0.07
676 0.07
677 0.08
678 0.11
679 0.11
680 0.11
681 0.11
682 0.12
683 0.12
684 0.15
685 0.17
686 0.15
687 0.14
688 0.16
689 0.16
690 0.14
691 0.13
692 0.1
693 0.1
694 0.1
695 0.11
696 0.11
697 0.11
698 0.12
699 0.12
700 0.12
701 0.11
702 0.14
703 0.14
704 0.13
705 0.15
706 0.14
707 0.16
708 0.17
709 0.16
710 0.14
711 0.13
712 0.13
713 0.15
714 0.16
715 0.14
716 0.13
717 0.12
718 0.12
719 0.12
720 0.11
721 0.08
722 0.07
723 0.1
724 0.1
725 0.1
726 0.09
727 0.14
728 0.16
729 0.2
730 0.21
731 0.17
732 0.17
733 0.17
734 0.18
735 0.18
736 0.19
737 0.25
738 0.32
739 0.4
740 0.43
741 0.45
742 0.46
743 0.47
744 0.47
745 0.4
746 0.35
747 0.36
748 0.33
749 0.34
750 0.34
751 0.31
752 0.27
753 0.23
754 0.23
755 0.16
756 0.15
757 0.15
758 0.13
759 0.12
760 0.12
761 0.14
762 0.11
763 0.11
764 0.1
765 0.09
766 0.1
767 0.13
768 0.17
769 0.24
770 0.31
771 0.41
772 0.5
773 0.57
774 0.64
775 0.72
776 0.76
777 0.73
778 0.74
779 0.71
780 0.71
781 0.64
782 0.58
783 0.51
784 0.45
785 0.42
786 0.33
787 0.34
788 0.25
789 0.31
790 0.29
791 0.25
792 0.22
793 0.21
794 0.2
795 0.12
796 0.13
797 0.06
798 0.06
799 0.07
800 0.1
801 0.1
802 0.1
803 0.09
804 0.08
805 0.08
806 0.08
807 0.09
808 0.08
809 0.12
810 0.12
811 0.12
812 0.11
813 0.11
814 0.13
815 0.14
816 0.16
817 0.15
818 0.15
819 0.16
820 0.16
821 0.17
822 0.18
823 0.19
824 0.18
825 0.2
826 0.2
827 0.19
828 0.21
829 0.21
830 0.2
831 0.22
832 0.23
833 0.22
834 0.24
835 0.24
836 0.25
837 0.26
838 0.3
839 0.32
840 0.31
841 0.27
842 0.27
843 0.34
844 0.33
845 0.31
846 0.27
847 0.23
848 0.24
849 0.28
850 0.29
851 0.24
852 0.23
853 0.25
854 0.33
855 0.29
856 0.29
857 0.27
858 0.31
859 0.33
860 0.34
861 0.33
862 0.29
863 0.37
864 0.39
865 0.4
866 0.41
867 0.43
868 0.43
869 0.5
870 0.49
871 0.46
872 0.46
873 0.47
874 0.41
875 0.38
876 0.36
877 0.28
878 0.24
879 0.2
880 0.17
881 0.15
882 0.16
883 0.16
884 0.17
885 0.18
886 0.22
887 0.24
888 0.27
889 0.3
890 0.33
891 0.33
892 0.33
893 0.32
894 0.31
895 0.29
896 0.29
897 0.25
898 0.2
899 0.21
900 0.2
901 0.2
902 0.18
903 0.17
904 0.13
905 0.14
906 0.13
907 0.12
908 0.13
909 0.14
910 0.14
911 0.14
912 0.14
913 0.13
914 0.14
915 0.14
916 0.21
917 0.23
918 0.23
919 0.22
920 0.22
921 0.22
922 0.21
923 0.2
924 0.15
925 0.13
926 0.17
927 0.21
928 0.26
929 0.3
930 0.36
931 0.37
932 0.38
933 0.43
934 0.45
935 0.44
936 0.39
937 0.39
938 0.35
939 0.38
940 0.37
941 0.31
942 0.28
943 0.26
944 0.28
945 0.27
946 0.26
947 0.21
948 0.23
949 0.25
950 0.27
951 0.29
952 0.28
953 0.31
954 0.33
955 0.35
956 0.39
957 0.44
958 0.43
959 0.46
960 0.47
961 0.41
962 0.39
963 0.37
964 0.31
965 0.27
966 0.27
967 0.23
968 0.22
969 0.21
970 0.2
971 0.18
972 0.22
973 0.2
974 0.17
975 0.17
976 0.18
977 0.23
978 0.26
979 0.27
980 0.24
981 0.3
982 0.37
983 0.41
984 0.38
985 0.37
986 0.38
987 0.36
988 0.36
989 0.31
990 0.25
991 0.26
992 0.29
993 0.28
994 0.25
995 0.26
996 0.31
997 0.33
998 0.38
999 0.41
1000 0.45
1001 0.49
1002 0.52
1003 0.55
1004 0.56
1005 0.6
1006 0.61
1007 0.54
1008 0.53
1009 0.52
1010 0.53
1011 0.53
1012 0.52
1013 0.48
1014 0.47
1015 0.48
1016 0.46
1017 0.43
1018 0.39
1019 0.39
1020 0.38
1021 0.34
1022 0.29
1023 0.27
1024 0.23
1025 0.2
1026 0.19
1027 0.14
1028 0.1
1029 0.09
1030 0.06
1031 0.05
1032 0.06
1033 0.06
1034 0.05
1035 0.06
1036 0.07
1037 0.09
1038 0.11
1039 0.12
1040 0.15
1041 0.21
1042 0.3
1043 0.34
1044 0.39
1045 0.42
1046 0.48
1047 0.56
1048 0.59
1049 0.58
1050 0.61
1051 0.63
1052 0.59
1053 0.62
1054 0.59
1055 0.52
1056 0.52
1057 0.48
1058 0.4
1059 0.37
1060 0.37
1061 0.3
1062 0.26
1063 0.23
1064 0.18
1065 0.16
1066 0.13
1067 0.09
1068 0.07
1069 0.06
1070 0.04
1071 0.04
1072 0.03
1073 0.03
1074 0.03
1075 0.03
1076 0.04
1077 0.07
1078 0.11
1079 0.17
1080 0.2
1081 0.21
1082 0.24
1083 0.28
1084 0.34