Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2AFZ6

Protein Details
Accession A0A0D2AFZ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRARRFRSARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
413-446KRRKEVEDKRARNEQRRNQANEAREARSAKRRRS
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 7, cyto 7, cyto_mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLTKKYPKIITPVIEEQPYEIDGVQYPVDTTKPNPNGEEMHNLYLDFNGIVHPCSHPENKPPPANESEMMLEIFKYTERVVNMVRPRRLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRSARDAKEADEKKAEFQTLLRQQQRDRDEDENEETVDDVIKKTWDSNVITPGTPFMFILAQSIRYWVQWKLNTDPAWAQLKVIISDASVPGEGEHKIMQFIRSQRSDPAYDPNTRHVMYGLDADLIMLGIATHEPHFRVLREDVDVRDAKAKTCKLCGQQGHYAENCRGEAKIKSGQFDEKGTTEELKPFVWLNVPILREYLGAEMFVPGQTFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREDGIDKLIAIWRDNIPIMGGYLTCDGRVDLARAQIILQGLAKQEDAIFKRRKEVEDKRARNEQRRNQANEAREARSAKRRRSSPDYTKGGRADARVPTGPVETFEASNFPVLDYNSIVNRAAVDKTLASNKSAAAVLKEQMLAKKAAETPTKNGANGINGTPNSSGGSPSSILGKRKATALEEESDSAGTPGRNTPIEKKTYNSGDPNNPPPDTVRLWEEGYADRYYEQKFHVDPQDIGFRHKVAEAYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIEKKTVKFDKGTPFKPYEQLMGVLPASSNHAIPSAFHPLMTDPESDIVDFYPEEFDLDLNGAKQSWKAIVLLPFIDERRLLAAMHTKYHLLTDDEHARNERGHDALIISDQNPLYDILAMKFYSKKAKGGPNTVKLSMQKSQLAGEVIKNEDFLPHMDLVGPQEDIRLEPAVDDDRSLNVFFTMPPPTHVHKSMLFPGVVLPPPVLDKGDLAMIRSKARISGRDFGGAPLYDNTRRDRLDTQNRGGRINYAVDRPPFDAGPPGMPPPSQWPPGMPPPPPPGYGGQGGYSRNPPPSNGYGGYATHTSQGHGGQDQGYYGNPGQNQYYGGQAPNQYHGGNGQYQQNGGRSFSDGYHQGQNRGPPARDNRSGNYGGGGYSQGGYGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.62
3 0.66
4 0.68
5 0.65
6 0.63
7 0.62
8 0.59
9 0.52
10 0.47
11 0.4
12 0.35
13 0.3
14 0.24
15 0.17
16 0.13
17 0.12
18 0.15
19 0.14
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.14
24 0.15
25 0.17
26 0.25
27 0.32
28 0.35
29 0.36
30 0.38
31 0.41
32 0.43
33 0.48
34 0.42
35 0.39
36 0.36
37 0.34
38 0.31
39 0.27
40 0.24
41 0.14
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.11
46 0.12
47 0.13
48 0.15
49 0.21
50 0.27
51 0.28
52 0.37
53 0.46
54 0.53
55 0.6
56 0.59
57 0.6
58 0.59
59 0.6
60 0.51
61 0.44
62 0.38
63 0.32
64 0.3
65 0.24
66 0.18
67 0.14
68 0.14
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.13
73 0.14
74 0.18
75 0.2
76 0.28
77 0.37
78 0.44
79 0.47
80 0.45
81 0.47
82 0.46
83 0.45
84 0.39
85 0.31
86 0.29
87 0.26
88 0.24
89 0.23
90 0.19
91 0.19
92 0.18
93 0.16
94 0.09
95 0.13
96 0.19
97 0.26
98 0.36
99 0.45
100 0.54
101 0.65
102 0.74
103 0.79
104 0.82
105 0.8
106 0.77
107 0.79
108 0.79
109 0.75
110 0.76
111 0.69
112 0.62
113 0.67
114 0.62
115 0.56
116 0.53
117 0.47
118 0.42
119 0.43
120 0.41
121 0.31
122 0.3
123 0.35
124 0.37
125 0.46
126 0.48
127 0.48
128 0.51
129 0.58
130 0.62
131 0.56
132 0.52
133 0.48
134 0.45
135 0.46
136 0.47
137 0.4
138 0.35
139 0.31
140 0.26
141 0.21
142 0.19
143 0.15
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.16
150 0.2
151 0.23
152 0.26
153 0.31
154 0.32
155 0.32
156 0.31
157 0.3
158 0.25
159 0.21
160 0.17
161 0.12
162 0.1
163 0.1
164 0.13
165 0.12
166 0.13
167 0.13
168 0.16
169 0.15
170 0.15
171 0.18
172 0.18
173 0.25
174 0.28
175 0.32
176 0.35
177 0.42
178 0.41
179 0.42
180 0.4
181 0.37
182 0.38
183 0.33
184 0.28
185 0.24
186 0.24
187 0.22
188 0.21
189 0.16
190 0.11
191 0.12
192 0.13
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.13
203 0.14
204 0.15
205 0.18
206 0.24
207 0.3
208 0.31
209 0.33
210 0.35
211 0.39
212 0.4
213 0.37
214 0.4
215 0.37
216 0.4
217 0.41
218 0.41
219 0.42
220 0.39
221 0.38
222 0.29
223 0.26
224 0.21
225 0.21
226 0.16
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.08
232 0.06
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.04
238 0.05
239 0.07
240 0.08
241 0.11
242 0.13
243 0.13
244 0.18
245 0.19
246 0.2
247 0.23
248 0.25
249 0.23
250 0.27
251 0.28
252 0.24
253 0.29
254 0.28
255 0.26
256 0.31
257 0.35
258 0.31
259 0.35
260 0.4
261 0.39
262 0.46
263 0.48
264 0.47
265 0.5
266 0.51
267 0.51
268 0.47
269 0.45
270 0.38
271 0.36
272 0.3
273 0.24
274 0.2
275 0.18
276 0.18
277 0.2
278 0.25
279 0.24
280 0.26
281 0.28
282 0.31
283 0.31
284 0.31
285 0.29
286 0.22
287 0.23
288 0.22
289 0.22
290 0.19
291 0.2
292 0.19
293 0.17
294 0.17
295 0.15
296 0.15
297 0.15
298 0.14
299 0.14
300 0.17
301 0.18
302 0.17
303 0.17
304 0.17
305 0.14
306 0.14
307 0.13
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.13
324 0.14
325 0.14
326 0.16
327 0.15
328 0.13
329 0.13
330 0.13
331 0.1
332 0.08
333 0.08
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.08
347 0.11
348 0.11
349 0.12
350 0.11
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.09
356 0.07
357 0.08
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.11
362 0.11
363 0.13
364 0.13
365 0.12
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.08
373 0.08
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.11
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.07
394 0.08
395 0.12
396 0.14
397 0.21
398 0.26
399 0.26
400 0.33
401 0.36
402 0.38
403 0.43
404 0.51
405 0.53
406 0.59
407 0.64
408 0.63
409 0.69
410 0.72
411 0.72
412 0.72
413 0.7
414 0.69
415 0.72
416 0.73
417 0.7
418 0.7
419 0.63
420 0.61
421 0.56
422 0.48
423 0.43
424 0.39
425 0.36
426 0.41
427 0.45
428 0.44
429 0.48
430 0.5
431 0.54
432 0.6
433 0.66
434 0.66
435 0.69
436 0.68
437 0.63
438 0.63
439 0.57
440 0.51
441 0.43
442 0.35
443 0.29
444 0.24
445 0.25
446 0.21
447 0.2
448 0.19
449 0.18
450 0.16
451 0.13
452 0.13
453 0.11
454 0.11
455 0.1
456 0.11
457 0.1
458 0.1
459 0.09
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.08
467 0.09
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.08
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.12
478 0.13
479 0.12
480 0.12
481 0.12
482 0.13
483 0.13
484 0.12
485 0.09
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.11
490 0.1
491 0.11
492 0.12
493 0.11
494 0.1
495 0.12
496 0.13
497 0.17
498 0.21
499 0.21
500 0.23
501 0.31
502 0.31
503 0.29
504 0.28
505 0.24
506 0.21
507 0.21
508 0.18
509 0.13
510 0.12
511 0.14
512 0.13
513 0.12
514 0.11
515 0.1
516 0.1
517 0.07
518 0.08
519 0.07
520 0.07
521 0.12
522 0.14
523 0.16
524 0.18
525 0.2
526 0.19
527 0.2
528 0.21
529 0.18
530 0.18
531 0.19
532 0.18
533 0.17
534 0.17
535 0.15
536 0.14
537 0.13
538 0.1
539 0.09
540 0.07
541 0.06
542 0.07
543 0.09
544 0.1
545 0.12
546 0.19
547 0.23
548 0.28
549 0.28
550 0.29
551 0.32
552 0.35
553 0.37
554 0.35
555 0.34
556 0.36
557 0.39
558 0.44
559 0.42
560 0.38
561 0.34
562 0.31
563 0.31
564 0.25
565 0.23
566 0.19
567 0.18
568 0.18
569 0.19
570 0.19
571 0.16
572 0.18
573 0.16
574 0.14
575 0.12
576 0.14
577 0.14
578 0.15
579 0.14
580 0.14
581 0.15
582 0.19
583 0.23
584 0.23
585 0.22
586 0.23
587 0.3
588 0.27
589 0.29
590 0.26
591 0.21
592 0.19
593 0.2
594 0.18
595 0.1
596 0.12
597 0.1
598 0.11
599 0.11
600 0.1
601 0.09
602 0.09
603 0.08
604 0.06
605 0.05
606 0.03
607 0.03
608 0.04
609 0.06
610 0.06
611 0.07
612 0.08
613 0.08
614 0.09
615 0.14
616 0.17
617 0.16
618 0.19
619 0.2
620 0.25
621 0.28
622 0.3
623 0.27
624 0.24
625 0.24
626 0.2
627 0.2
628 0.15
629 0.12
630 0.09
631 0.07
632 0.09
633 0.14
634 0.13
635 0.13
636 0.16
637 0.16
638 0.19
639 0.23
640 0.24
641 0.21
642 0.27
643 0.37
644 0.42
645 0.44
646 0.47
647 0.47
648 0.46
649 0.47
650 0.42
651 0.34
652 0.27
653 0.25
654 0.2
655 0.18
656 0.16
657 0.12
658 0.11
659 0.08
660 0.11
661 0.1
662 0.1
663 0.08
664 0.09
665 0.09
666 0.1
667 0.13
668 0.18
669 0.17
670 0.17
671 0.17
672 0.17
673 0.2
674 0.2
675 0.17
676 0.11
677 0.12
678 0.13
679 0.12
680 0.12
681 0.09
682 0.08
683 0.07
684 0.07
685 0.07
686 0.06
687 0.07
688 0.07
689 0.07
690 0.06
691 0.07
692 0.07
693 0.06
694 0.07
695 0.06
696 0.07
697 0.07
698 0.08
699 0.08
700 0.09
701 0.09
702 0.12
703 0.15
704 0.16
705 0.16
706 0.16
707 0.17
708 0.16
709 0.17
710 0.13
711 0.11
712 0.11
713 0.12
714 0.1
715 0.1
716 0.18
717 0.19
718 0.21
719 0.21
720 0.2
721 0.19
722 0.2
723 0.2
724 0.13
725 0.14
726 0.17
727 0.26
728 0.27
729 0.28
730 0.29
731 0.29
732 0.28
733 0.28
734 0.25
735 0.16
736 0.15
737 0.14
738 0.13
739 0.12
740 0.13
741 0.12
742 0.1
743 0.13
744 0.12
745 0.11
746 0.12
747 0.11
748 0.1
749 0.11
750 0.11
751 0.08
752 0.11
753 0.11
754 0.12
755 0.14
756 0.16
757 0.24
758 0.25
759 0.28
760 0.33
761 0.41
762 0.46
763 0.54
764 0.61
765 0.6
766 0.63
767 0.61
768 0.58
769 0.52
770 0.51
771 0.45
772 0.4
773 0.34
774 0.3
775 0.3
776 0.28
777 0.27
778 0.23
779 0.21
780 0.2
781 0.19
782 0.18
783 0.18
784 0.15
785 0.14
786 0.14
787 0.13
788 0.13
789 0.12
790 0.12
791 0.11
792 0.12
793 0.13
794 0.14
795 0.13
796 0.09
797 0.1
798 0.1
799 0.1
800 0.12
801 0.11
802 0.09
803 0.09
804 0.11
805 0.13
806 0.13
807 0.14
808 0.12
809 0.13
810 0.15
811 0.15
812 0.13
813 0.1
814 0.11
815 0.1
816 0.12
817 0.15
818 0.14
819 0.17
820 0.22
821 0.26
822 0.31
823 0.33
824 0.34
825 0.34
826 0.38
827 0.41
828 0.39
829 0.34
830 0.29
831 0.28
832 0.29
833 0.26
834 0.22
835 0.16
836 0.13
837 0.15
838 0.15
839 0.14
840 0.1
841 0.1
842 0.1
843 0.15
844 0.14
845 0.14
846 0.19
847 0.2
848 0.22
849 0.22
850 0.22
851 0.23
852 0.27
853 0.32
854 0.32
855 0.38
856 0.38
857 0.42
858 0.42
859 0.37
860 0.37
861 0.31
862 0.27
863 0.22
864 0.24
865 0.24
866 0.26
867 0.3
868 0.32
869 0.33
870 0.35
871 0.39
872 0.45
873 0.52
874 0.58
875 0.62
876 0.62
877 0.63
878 0.61
879 0.55
880 0.47
881 0.39
882 0.36
883 0.31
884 0.29
885 0.33
886 0.33
887 0.35
888 0.34
889 0.34
890 0.28
891 0.25
892 0.26
893 0.22
894 0.23
895 0.22
896 0.23
897 0.22
898 0.22
899 0.23
900 0.25
901 0.3
902 0.3
903 0.29
904 0.3
905 0.35
906 0.45
907 0.49
908 0.43
909 0.43
910 0.48
911 0.51
912 0.48
913 0.45
914 0.38
915 0.37
916 0.39
917 0.33
918 0.29
919 0.29
920 0.3
921 0.31
922 0.32
923 0.31
924 0.33
925 0.32
926 0.31
927 0.34
928 0.36
929 0.39
930 0.36
931 0.36
932 0.32
933 0.31
934 0.33
935 0.28
936 0.24
937 0.22
938 0.21
939 0.19
940 0.19
941 0.2
942 0.2
943 0.19
944 0.2
945 0.17
946 0.17
947 0.17
948 0.16
949 0.14
950 0.15
951 0.16
952 0.18
953 0.18
954 0.2
955 0.21
956 0.22
957 0.23
958 0.2
959 0.23
960 0.21
961 0.21
962 0.24
963 0.26
964 0.27
965 0.29
966 0.31
967 0.25
968 0.24
969 0.25
970 0.25
971 0.25
972 0.26
973 0.28
974 0.27
975 0.29
976 0.32
977 0.35
978 0.33
979 0.3
980 0.28
981 0.25
982 0.25
983 0.25
984 0.27
985 0.25
986 0.27
987 0.34
988 0.35
989 0.37
990 0.39
991 0.44
992 0.47
993 0.5
994 0.48
995 0.48
996 0.55
997 0.59
998 0.64
999 0.63
1000 0.61
1001 0.61
1002 0.62
1003 0.53
1004 0.46
1005 0.38
1006 0.3
1007 0.26
1008 0.22
1009 0.15
1010 0.13
1011 0.13