Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B2WH28

Protein Details
Accession B2WH28    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-58LETPTQAKRQRKAPAPRSSQKKAAAHydrophilic
142-166PTSTVIKRGRGRPRKTPQKVSSPPQHydrophilic
413-456QNKVLPPKVNRNTKNVREHWLKGRQVDKKNKKGLKPSARFGKMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-56KRQRKAPAPRSSQKKA
148-157KRGRGRPRKT
288-294AKRKARE
301-324QAAKREREEKKAKKLAKKAAKEAK
381-403EKLNRHIKFLERTEKPAKDVKKG
429-460REHWLKGRQVDKKNKKGLKPSARFGKMERRPH
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR013268  U3_snoRNA_assoc  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08297  U3_snoRNA_assoc  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MVTTRGGTETPGAPTPTPRSSTRKTAGKRELEALETPTQAKRQRKAPAPRSSQKKAAAKSDAPTEELSQVSADDVAAVVAPSRESPDASSATEGKEDEAQTSHDAVFYTPAQRAGSVYETPATHRQPEGSPTPKVKEASVEPTSTVIKRGRGRPRKTPQKVSSPPQAEETPSRFNDEIPTSSYESSMAPIPSQEAPPSAQPEKAHMHFDDDEESVVTQISPTANKFHDVPTVTEPAAGSVQDSDEDNASDSDDEAPEVVTTAAASSKAQAAQADAERAQKAQQAKEEAKRKAREELIATQQAAKREREEKKAKKLAKKAAKEAKAVAAGPEEEEAAIKPRMEIDLSNGLLPASLLENIDDQRPPTPPPERRGATEEQLRKEKLNRHIKFLERTEKPAKDVKKGKLNVAVLAQQNKVLPPKVNRNTKNVREHWLKGRQVDKKNKKGLKPSARFGKMERRPHVNRGFLRNGDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.35
3 0.37
4 0.39
5 0.41
6 0.46
7 0.49
8 0.58
9 0.61
10 0.65
11 0.66
12 0.72
13 0.76
14 0.76
15 0.73
16 0.69
17 0.63
18 0.57
19 0.53
20 0.47
21 0.4
22 0.34
23 0.33
24 0.29
25 0.33
26 0.38
27 0.44
28 0.45
29 0.5
30 0.58
31 0.66
32 0.74
33 0.77
34 0.8
35 0.82
36 0.85
37 0.86
38 0.83
39 0.81
40 0.79
41 0.77
42 0.72
43 0.7
44 0.69
45 0.63
46 0.6
47 0.6
48 0.52
49 0.46
50 0.43
51 0.36
52 0.31
53 0.28
54 0.24
55 0.16
56 0.14
57 0.13
58 0.11
59 0.08
60 0.06
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.04
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.06
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.12
73 0.16
74 0.17
75 0.18
76 0.21
77 0.19
78 0.19
79 0.21
80 0.19
81 0.16
82 0.18
83 0.18
84 0.16
85 0.16
86 0.17
87 0.17
88 0.19
89 0.17
90 0.14
91 0.14
92 0.13
93 0.15
94 0.14
95 0.15
96 0.14
97 0.17
98 0.16
99 0.16
100 0.16
101 0.16
102 0.18
103 0.16
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.2
108 0.26
109 0.26
110 0.25
111 0.25
112 0.26
113 0.25
114 0.3
115 0.34
116 0.32
117 0.35
118 0.37
119 0.39
120 0.41
121 0.41
122 0.36
123 0.32
124 0.31
125 0.34
126 0.33
127 0.3
128 0.26
129 0.27
130 0.29
131 0.24
132 0.25
133 0.2
134 0.24
135 0.3
136 0.38
137 0.47
138 0.56
139 0.61
140 0.67
141 0.76
142 0.8
143 0.83
144 0.85
145 0.8
146 0.81
147 0.82
148 0.77
149 0.76
150 0.69
151 0.62
152 0.55
153 0.49
154 0.41
155 0.39
156 0.37
157 0.33
158 0.29
159 0.32
160 0.28
161 0.27
162 0.29
163 0.27
164 0.24
165 0.21
166 0.23
167 0.21
168 0.21
169 0.21
170 0.17
171 0.15
172 0.14
173 0.14
174 0.11
175 0.09
176 0.09
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.11
181 0.1
182 0.11
183 0.13
184 0.18
185 0.17
186 0.18
187 0.18
188 0.22
189 0.25
190 0.26
191 0.27
192 0.22
193 0.26
194 0.24
195 0.24
196 0.22
197 0.17
198 0.16
199 0.13
200 0.13
201 0.08
202 0.07
203 0.06
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.07
209 0.1
210 0.1
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.16
215 0.17
216 0.18
217 0.18
218 0.2
219 0.19
220 0.19
221 0.17
222 0.14
223 0.13
224 0.1
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.05
245 0.04
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.1
259 0.11
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.14
266 0.15
267 0.17
268 0.18
269 0.21
270 0.25
271 0.29
272 0.37
273 0.45
274 0.48
275 0.53
276 0.55
277 0.53
278 0.54
279 0.52
280 0.48
281 0.44
282 0.43
283 0.42
284 0.4
285 0.38
286 0.36
287 0.35
288 0.36
289 0.34
290 0.3
291 0.27
292 0.33
293 0.39
294 0.44
295 0.53
296 0.57
297 0.65
298 0.73
299 0.76
300 0.76
301 0.79
302 0.8
303 0.79
304 0.77
305 0.76
306 0.76
307 0.74
308 0.67
309 0.6
310 0.54
311 0.46
312 0.4
313 0.3
314 0.22
315 0.18
316 0.16
317 0.14
318 0.1
319 0.07
320 0.08
321 0.07
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.13
331 0.19
332 0.2
333 0.2
334 0.19
335 0.18
336 0.16
337 0.16
338 0.11
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.09
344 0.1
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.14
349 0.15
350 0.17
351 0.22
352 0.31
353 0.36
354 0.4
355 0.49
356 0.49
357 0.51
358 0.55
359 0.53
360 0.51
361 0.53
362 0.55
363 0.52
364 0.57
365 0.54
366 0.52
367 0.53
368 0.55
369 0.56
370 0.6
371 0.56
372 0.57
373 0.62
374 0.66
375 0.67
376 0.67
377 0.66
378 0.58
379 0.64
380 0.65
381 0.6
382 0.57
383 0.57
384 0.54
385 0.54
386 0.59
387 0.6
388 0.62
389 0.62
390 0.64
391 0.65
392 0.62
393 0.55
394 0.5
395 0.47
396 0.42
397 0.43
398 0.37
399 0.3
400 0.3
401 0.3
402 0.31
403 0.29
404 0.31
405 0.34
406 0.45
407 0.53
408 0.62
409 0.64
410 0.69
411 0.76
412 0.79
413 0.81
414 0.75
415 0.74
416 0.71
417 0.73
418 0.73
419 0.72
420 0.68
421 0.65
422 0.7
423 0.7
424 0.73
425 0.78
426 0.79
427 0.8
428 0.85
429 0.86
430 0.85
431 0.86
432 0.87
433 0.87
434 0.84
435 0.84
436 0.84
437 0.81
438 0.76
439 0.71
440 0.71
441 0.69
442 0.71
443 0.68
444 0.67
445 0.67
446 0.75
447 0.78
448 0.76
449 0.74
450 0.73
451 0.75