Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2A3J9

Protein Details
Accession A0A0D2A3J9    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
597-624SPSAASPSSRQRQRRSPPPSTRTKPAEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
400-425RPPIAPRNKSSHSTQKSKLGALKPRK
504-521PSTPAHERRRLGRLGGKK
550-564AKRRLGRLGGLRKRE
607-658QRQRRSPPPSTRTKPAEEPKKEETAEEAASRRRMELKRTIAAQDGGKKKRRF
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MPDSASEGWQELQTTSRRQCPKLFYSVSTKEQSLTLLLTDLISIWECSLDRYDILAAAARQQTSIDPSVSTDQFEVLLSKIRKSLGEGENSVIRDGRGNSQTLLLRTRIDLPRPLRPLEWAFTLDPQRASELAERILRPSLHEVFVSQNKINSLLGIIKDKDHIISRLLDRVGNSAVDLSLVFPGITGFASRKGGHVSAADANKHVPGMASFDEKVWTRQFANDDGYEGADRTGLSNLVRGCEKCFAHSKAEHENWVKDLPSTDKSSQIDTSNKRIGSPSTKVPRKKPDSDSESTGDEFERQATPPHLKSKDTPKATHETTEDEETEDDEPAPKRTQPSTIGGLGRRNATKAFGASKRSPDQVVVSKTKSPPRRRASTASTETETASEDDDAAGAGKEPRPPIAPRNKSSHSTQKSKLGALKPRKVSPSSSPSPPPSKSRLSTSSAGSASDQELPSRNSRVAAARASKTPEQEEEEDGEETDDLNGKSSTPSPSPPPPPPQAKPSTPAHERRRLGRLGGKKQATPSTSASASPPETSKGEKMIPETQSPAKRRLGRLGGLRKRERETTTSPQARDKPPGPVNEDDSHATTTPSPSPSPSAASPSSRQRQRRSPPPSTRTKPAEEPKKEETAEEAASRRRMELKRTIAAQDGGKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.33
3 0.41
4 0.47
5 0.51
6 0.57
7 0.61
8 0.62
9 0.64
10 0.63
11 0.58
12 0.61
13 0.63
14 0.62
15 0.58
16 0.52
17 0.43
18 0.39
19 0.36
20 0.28
21 0.22
22 0.16
23 0.13
24 0.12
25 0.11
26 0.1
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.07
32 0.09
33 0.09
34 0.11
35 0.14
36 0.14
37 0.13
38 0.15
39 0.15
40 0.14
41 0.15
42 0.16
43 0.13
44 0.18
45 0.21
46 0.2
47 0.19
48 0.19
49 0.2
50 0.22
51 0.24
52 0.19
53 0.16
54 0.19
55 0.25
56 0.25
57 0.25
58 0.2
59 0.18
60 0.17
61 0.17
62 0.15
63 0.1
64 0.18
65 0.18
66 0.19
67 0.22
68 0.23
69 0.23
70 0.26
71 0.34
72 0.32
73 0.37
74 0.37
75 0.37
76 0.4
77 0.4
78 0.37
79 0.28
80 0.22
81 0.2
82 0.2
83 0.25
84 0.23
85 0.24
86 0.24
87 0.29
88 0.32
89 0.3
90 0.31
91 0.26
92 0.24
93 0.24
94 0.32
95 0.31
96 0.32
97 0.38
98 0.39
99 0.46
100 0.49
101 0.5
102 0.42
103 0.43
104 0.43
105 0.38
106 0.37
107 0.31
108 0.28
109 0.32
110 0.35
111 0.32
112 0.29
113 0.26
114 0.25
115 0.22
116 0.24
117 0.23
118 0.21
119 0.23
120 0.26
121 0.25
122 0.25
123 0.29
124 0.26
125 0.24
126 0.28
127 0.27
128 0.24
129 0.24
130 0.23
131 0.25
132 0.31
133 0.33
134 0.27
135 0.26
136 0.25
137 0.27
138 0.26
139 0.2
140 0.16
141 0.14
142 0.15
143 0.18
144 0.18
145 0.17
146 0.19
147 0.19
148 0.2
149 0.19
150 0.19
151 0.16
152 0.2
153 0.21
154 0.25
155 0.25
156 0.24
157 0.22
158 0.23
159 0.22
160 0.17
161 0.16
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.08
177 0.12
178 0.12
179 0.14
180 0.16
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.17
185 0.2
186 0.22
187 0.21
188 0.19
189 0.19
190 0.18
191 0.18
192 0.15
193 0.09
194 0.07
195 0.1
196 0.11
197 0.13
198 0.13
199 0.14
200 0.16
201 0.16
202 0.19
203 0.17
204 0.18
205 0.16
206 0.19
207 0.21
208 0.21
209 0.24
210 0.21
211 0.21
212 0.19
213 0.19
214 0.16
215 0.14
216 0.11
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.14
227 0.13
228 0.15
229 0.2
230 0.2
231 0.2
232 0.27
233 0.28
234 0.32
235 0.34
236 0.35
237 0.38
238 0.4
239 0.43
240 0.39
241 0.37
242 0.33
243 0.32
244 0.28
245 0.2
246 0.2
247 0.17
248 0.18
249 0.23
250 0.21
251 0.26
252 0.26
253 0.28
254 0.29
255 0.29
256 0.33
257 0.31
258 0.36
259 0.36
260 0.35
261 0.33
262 0.32
263 0.31
264 0.3
265 0.3
266 0.32
267 0.37
268 0.44
269 0.49
270 0.55
271 0.62
272 0.64
273 0.68
274 0.66
275 0.65
276 0.66
277 0.64
278 0.61
279 0.53
280 0.47
281 0.39
282 0.34
283 0.24
284 0.17
285 0.14
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.1
290 0.12
291 0.16
292 0.19
293 0.26
294 0.27
295 0.27
296 0.31
297 0.4
298 0.46
299 0.46
300 0.45
301 0.41
302 0.45
303 0.44
304 0.43
305 0.34
306 0.28
307 0.26
308 0.26
309 0.22
310 0.17
311 0.16
312 0.14
313 0.14
314 0.11
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.11
319 0.12
320 0.12
321 0.14
322 0.15
323 0.19
324 0.2
325 0.23
326 0.24
327 0.26
328 0.27
329 0.26
330 0.28
331 0.26
332 0.25
333 0.22
334 0.19
335 0.16
336 0.15
337 0.14
338 0.14
339 0.18
340 0.18
341 0.24
342 0.25
343 0.3
344 0.31
345 0.32
346 0.31
347 0.26
348 0.27
349 0.27
350 0.3
351 0.29
352 0.28
353 0.31
354 0.34
355 0.41
356 0.46
357 0.49
358 0.54
359 0.57
360 0.62
361 0.63
362 0.66
363 0.65
364 0.65
365 0.62
366 0.55
367 0.49
368 0.43
369 0.38
370 0.31
371 0.26
372 0.17
373 0.12
374 0.09
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.04
381 0.04
382 0.06
383 0.07
384 0.1
385 0.11
386 0.12
387 0.15
388 0.18
389 0.26
390 0.35
391 0.42
392 0.43
393 0.5
394 0.53
395 0.53
396 0.56
397 0.58
398 0.54
399 0.54
400 0.53
401 0.54
402 0.52
403 0.52
404 0.53
405 0.49
406 0.51
407 0.53
408 0.58
409 0.55
410 0.57
411 0.58
412 0.54
413 0.51
414 0.49
415 0.48
416 0.45
417 0.45
418 0.45
419 0.46
420 0.5
421 0.49
422 0.47
423 0.44
424 0.46
425 0.44
426 0.45
427 0.45
428 0.44
429 0.44
430 0.41
431 0.4
432 0.34
433 0.32
434 0.26
435 0.22
436 0.19
437 0.2
438 0.18
439 0.14
440 0.17
441 0.18
442 0.21
443 0.22
444 0.21
445 0.18
446 0.2
447 0.23
448 0.23
449 0.26
450 0.29
451 0.29
452 0.31
453 0.36
454 0.36
455 0.34
456 0.34
457 0.31
458 0.3
459 0.3
460 0.29
461 0.26
462 0.26
463 0.24
464 0.21
465 0.18
466 0.13
467 0.11
468 0.1
469 0.11
470 0.09
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.12
475 0.14
476 0.17
477 0.16
478 0.19
479 0.23
480 0.31
481 0.37
482 0.42
483 0.47
484 0.51
485 0.57
486 0.58
487 0.6
488 0.6
489 0.57
490 0.56
491 0.56
492 0.56
493 0.56
494 0.62
495 0.63
496 0.65
497 0.65
498 0.66
499 0.66
500 0.6
501 0.57
502 0.55
503 0.56
504 0.56
505 0.62
506 0.59
507 0.54
508 0.57
509 0.58
510 0.51
511 0.46
512 0.41
513 0.36
514 0.34
515 0.32
516 0.29
517 0.26
518 0.26
519 0.24
520 0.21
521 0.2
522 0.21
523 0.24
524 0.25
525 0.25
526 0.26
527 0.26
528 0.3
529 0.34
530 0.35
531 0.34
532 0.37
533 0.4
534 0.45
535 0.47
536 0.48
537 0.49
538 0.53
539 0.55
540 0.59
541 0.58
542 0.56
543 0.62
544 0.67
545 0.67
546 0.7
547 0.73
548 0.69
549 0.68
550 0.68
551 0.63
552 0.58
553 0.58
554 0.58
555 0.62
556 0.63
557 0.61
558 0.63
559 0.66
560 0.64
561 0.64
562 0.58
563 0.57
564 0.55
565 0.59
566 0.56
567 0.53
568 0.54
569 0.49
570 0.49
571 0.42
572 0.39
573 0.35
574 0.3
575 0.27
576 0.22
577 0.23
578 0.24
579 0.25
580 0.23
581 0.23
582 0.27
583 0.27
584 0.3
585 0.29
586 0.31
587 0.31
588 0.35
589 0.38
590 0.44
591 0.52
592 0.56
593 0.63
594 0.66
595 0.73
596 0.78
597 0.83
598 0.83
599 0.84
600 0.86
601 0.86
602 0.88
603 0.85
604 0.84
605 0.8
606 0.77
607 0.77
608 0.76
609 0.79
610 0.75
611 0.76
612 0.72
613 0.73
614 0.66
615 0.57
616 0.51
617 0.45
618 0.41
619 0.38
620 0.36
621 0.34
622 0.38
623 0.38
624 0.36
625 0.4
626 0.41
627 0.45
628 0.5
629 0.53
630 0.55
631 0.58
632 0.58
633 0.54
634 0.53
635 0.52
636 0.51
637 0.53
638 0.55