Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B2VXN8

Protein Details
Accession B2VXN8    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-85VNGVAKKKTKPSKKDAPALKPTPKHydrophilic
339-394MPNGLNLPSKKQKRKHADVNGDATEVPAKKTKKHRTPEEEKRKAEKKARKEKKRAQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-94GVAKKKTKPSKKDAPALKPTPKAKVAPVKPA
349-353KQKRK
365-394PAKKTKKHRTPEEEKRKAEKKARKEKKRAQ
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MSTMKKTPVPLPGSKPKSKPQASSSKPQLSQEFVNSDDDSPSESTAQPKKAEKPKTTIGIHVNGVAKKKTKPSKKDAPALKPTPKAKVAPVKPAPKQTVTQKDVSDSSSSDESDDSGDVPMKDIQAKVPVKEKGKDASSDSSDSSGSDSSSDESDSDDEPQQTPKPASSQAQSRQTTTTTTTTTTQTHAVEFQSTQTYVPPKGFTAVPVNSTTASKSAGLFDNLEGKQVWYMTAPGGVSLKDLEELEMEKVMDGEAVLSYKGIDYNCPQMQKSEEVEHQNTGSEAAASITRSTIRAPKPQVKGLKMRFLPTGFSGDDGGNLGDSESESEKLREPAGLGMPNGLNLPSKKQKRKHADVNGDATEVPAKKTKKHRTPEEEKRKAEKKARKEKKRAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.71
3 0.71
4 0.75
5 0.75
6 0.73
7 0.72
8 0.74
9 0.72
10 0.76
11 0.77
12 0.76
13 0.72
14 0.7
15 0.65
16 0.58
17 0.56
18 0.51
19 0.44
20 0.36
21 0.38
22 0.33
23 0.3
24 0.26
25 0.23
26 0.2
27 0.18
28 0.18
29 0.16
30 0.16
31 0.23
32 0.29
33 0.34
34 0.36
35 0.41
36 0.49
37 0.56
38 0.65
39 0.63
40 0.63
41 0.66
42 0.69
43 0.65
44 0.62
45 0.59
46 0.53
47 0.49
48 0.46
49 0.43
50 0.37
51 0.39
52 0.37
53 0.35
54 0.35
55 0.44
56 0.49
57 0.55
58 0.61
59 0.66
60 0.73
61 0.78
62 0.83
63 0.83
64 0.82
65 0.82
66 0.81
67 0.79
68 0.76
69 0.7
70 0.68
71 0.63
72 0.56
73 0.53
74 0.56
75 0.53
76 0.55
77 0.6
78 0.62
79 0.62
80 0.68
81 0.65
82 0.58
83 0.59
84 0.58
85 0.6
86 0.55
87 0.55
88 0.47
89 0.46
90 0.44
91 0.41
92 0.33
93 0.23
94 0.22
95 0.19
96 0.18
97 0.16
98 0.14
99 0.13
100 0.12
101 0.12
102 0.09
103 0.08
104 0.1
105 0.09
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.14
110 0.13
111 0.14
112 0.21
113 0.22
114 0.23
115 0.28
116 0.33
117 0.35
118 0.38
119 0.4
120 0.36
121 0.37
122 0.37
123 0.34
124 0.33
125 0.32
126 0.31
127 0.28
128 0.24
129 0.22
130 0.19
131 0.17
132 0.12
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.11
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.16
148 0.16
149 0.17
150 0.17
151 0.16
152 0.16
153 0.18
154 0.2
155 0.2
156 0.27
157 0.31
158 0.4
159 0.4
160 0.39
161 0.37
162 0.36
163 0.34
164 0.3
165 0.25
166 0.17
167 0.18
168 0.18
169 0.19
170 0.2
171 0.19
172 0.19
173 0.17
174 0.16
175 0.15
176 0.14
177 0.13
178 0.12
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.11
189 0.13
190 0.13
191 0.13
192 0.16
193 0.16
194 0.17
195 0.17
196 0.18
197 0.16
198 0.17
199 0.15
200 0.1
201 0.11
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.11
209 0.17
210 0.16
211 0.17
212 0.15
213 0.14
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.06
218 0.07
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.1
252 0.18
253 0.21
254 0.23
255 0.23
256 0.23
257 0.25
258 0.27
259 0.29
260 0.26
261 0.28
262 0.33
263 0.34
264 0.34
265 0.31
266 0.28
267 0.24
268 0.2
269 0.15
270 0.09
271 0.07
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.11
280 0.18
281 0.22
282 0.3
283 0.37
284 0.45
285 0.5
286 0.57
287 0.63
288 0.61
289 0.66
290 0.63
291 0.65
292 0.59
293 0.56
294 0.53
295 0.46
296 0.43
297 0.35
298 0.33
299 0.24
300 0.23
301 0.21
302 0.17
303 0.17
304 0.15
305 0.13
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.08
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.13
316 0.16
317 0.17
318 0.18
319 0.16
320 0.16
321 0.19
322 0.22
323 0.23
324 0.2
325 0.22
326 0.21
327 0.21
328 0.2
329 0.17
330 0.16
331 0.15
332 0.23
333 0.3
334 0.41
335 0.5
336 0.58
337 0.68
338 0.75
339 0.84
340 0.87
341 0.87
342 0.87
343 0.85
344 0.85
345 0.75
346 0.66
347 0.55
348 0.45
349 0.4
350 0.3
351 0.25
352 0.25
353 0.26
354 0.33
355 0.44
356 0.55
357 0.59
358 0.69
359 0.77
360 0.81
361 0.89
362 0.92
363 0.93
364 0.92
365 0.89
366 0.89
367 0.86
368 0.85
369 0.84
370 0.83
371 0.83
372 0.84
373 0.87
374 0.89