Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2CM21

Protein Details
Accession A0A0D2CM21    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
397-420AAEEARRQKRAKRKVTKRDEPGATBasic
435-456NLDTEKKTTKKERKLAESKFSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
401-414ARRQKRAKRKVTKR
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10, cyto_nucl 8.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAHSPPAPSRPPLPQTQTSFSRNFSSANGRPSPLGPQSPPLAMNYSSPSPQAFSPQQYFQPPAAKRPRLSPDVQSPSAAQSFPPTPTALPTTPIGNAPLNGSAAAAPAQGLMPPPQRPPDKAEDRNYEDILVGTGINIEEEARMLVQNDYFGSSTPKTATSGSFEYQNNSFPAPVSSGGATTSQQEQTEGLTQEYQPSEEEMKERNEARADWEASRYSQYPLWDMFLLGGALNEKIRNISITEHLVDPQSGVLVNTQKHMPPPTVRVNGLEGASRIIDKGQAILDTGQKGERLSDIMKVISLATRARMTGLLSASSRLAKERRQHSTGKVPEEWQDIAVQGKPATDVPDGAASPAGSSSLKRTHSQAGSDSSFRHDQVSGPMRLISTFEKVSQAEKAAEEARRQKRAKRKVTKRDEPGATVTGTDATLEPATVANLDTEKKTTKKERKLAESKFSEQQQHKSANEAARMAVAGLFGSRLGGKKSRTYDWMNAGKAGASPAATPGRPPASGAPSTPGTPAPDRTRTAPKEKQFGQWDEDKDSKIQARDVLLVLEGDGRASRSYVRGLSLPEKTDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.6
3 0.64
4 0.66
5 0.63
6 0.61
7 0.55
8 0.52
9 0.45
10 0.4
11 0.37
12 0.39
13 0.38
14 0.43
15 0.43
16 0.4
17 0.4
18 0.4
19 0.43
20 0.4
21 0.4
22 0.34
23 0.36
24 0.37
25 0.38
26 0.37
27 0.33
28 0.3
29 0.25
30 0.26
31 0.26
32 0.26
33 0.25
34 0.25
35 0.24
36 0.22
37 0.22
38 0.27
39 0.27
40 0.3
41 0.34
42 0.37
43 0.41
44 0.43
45 0.46
46 0.42
47 0.46
48 0.42
49 0.47
50 0.54
51 0.56
52 0.53
53 0.58
54 0.62
55 0.59
56 0.61
57 0.59
58 0.59
59 0.6
60 0.6
61 0.52
62 0.46
63 0.44
64 0.42
65 0.34
66 0.24
67 0.2
68 0.22
69 0.22
70 0.23
71 0.2
72 0.18
73 0.21
74 0.27
75 0.22
76 0.22
77 0.22
78 0.22
79 0.22
80 0.23
81 0.22
82 0.18
83 0.18
84 0.17
85 0.17
86 0.16
87 0.14
88 0.14
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.08
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.11
99 0.16
100 0.18
101 0.22
102 0.29
103 0.33
104 0.35
105 0.4
106 0.46
107 0.51
108 0.57
109 0.62
110 0.63
111 0.66
112 0.68
113 0.62
114 0.52
115 0.42
116 0.34
117 0.26
118 0.18
119 0.11
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.14
140 0.14
141 0.15
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.17
146 0.18
147 0.18
148 0.21
149 0.2
150 0.25
151 0.24
152 0.26
153 0.25
154 0.27
155 0.23
156 0.2
157 0.19
158 0.14
159 0.15
160 0.14
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.13
174 0.14
175 0.18
176 0.17
177 0.15
178 0.14
179 0.14
180 0.17
181 0.17
182 0.16
183 0.12
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.16
188 0.16
189 0.18
190 0.21
191 0.22
192 0.22
193 0.22
194 0.21
195 0.24
196 0.27
197 0.26
198 0.23
199 0.25
200 0.23
201 0.23
202 0.25
203 0.21
204 0.17
205 0.17
206 0.17
207 0.17
208 0.17
209 0.18
210 0.15
211 0.14
212 0.12
213 0.1
214 0.09
215 0.07
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.1
228 0.13
229 0.14
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.11
235 0.08
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.15
246 0.16
247 0.17
248 0.16
249 0.21
250 0.28
251 0.3
252 0.3
253 0.29
254 0.29
255 0.28
256 0.26
257 0.21
258 0.13
259 0.11
260 0.1
261 0.09
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.09
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.14
306 0.18
307 0.25
308 0.32
309 0.38
310 0.41
311 0.44
312 0.46
313 0.54
314 0.54
315 0.51
316 0.45
317 0.4
318 0.39
319 0.38
320 0.34
321 0.24
322 0.19
323 0.15
324 0.14
325 0.13
326 0.11
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.11
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.05
344 0.06
345 0.1
346 0.15
347 0.18
348 0.19
349 0.22
350 0.28
351 0.3
352 0.31
353 0.31
354 0.3
355 0.3
356 0.31
357 0.28
358 0.25
359 0.25
360 0.23
361 0.22
362 0.17
363 0.15
364 0.22
365 0.28
366 0.25
367 0.24
368 0.24
369 0.22
370 0.22
371 0.23
372 0.17
373 0.14
374 0.14
375 0.14
376 0.16
377 0.17
378 0.18
379 0.18
380 0.18
381 0.16
382 0.15
383 0.17
384 0.18
385 0.2
386 0.24
387 0.32
388 0.37
389 0.45
390 0.48
391 0.53
392 0.59
393 0.68
394 0.74
395 0.75
396 0.79
397 0.81
398 0.89
399 0.92
400 0.89
401 0.88
402 0.8
403 0.72
404 0.65
405 0.56
406 0.45
407 0.35
408 0.27
409 0.18
410 0.15
411 0.12
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.08
423 0.09
424 0.1
425 0.12
426 0.17
427 0.19
428 0.27
429 0.37
430 0.46
431 0.55
432 0.62
433 0.68
434 0.74
435 0.82
436 0.82
437 0.81
438 0.77
439 0.71
440 0.7
441 0.65
442 0.63
443 0.57
444 0.57
445 0.54
446 0.54
447 0.49
448 0.47
449 0.49
450 0.45
451 0.43
452 0.38
453 0.31
454 0.25
455 0.24
456 0.2
457 0.15
458 0.1
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.06
464 0.07
465 0.08
466 0.12
467 0.17
468 0.2
469 0.28
470 0.33
471 0.37
472 0.41
473 0.46
474 0.49
475 0.53
476 0.58
477 0.52
478 0.48
479 0.44
480 0.38
481 0.32
482 0.27
483 0.18
484 0.11
485 0.1
486 0.14
487 0.18
488 0.17
489 0.17
490 0.22
491 0.24
492 0.24
493 0.26
494 0.27
495 0.29
496 0.31
497 0.31
498 0.3
499 0.29
500 0.3
501 0.29
502 0.26
503 0.24
504 0.26
505 0.32
506 0.35
507 0.39
508 0.41
509 0.45
510 0.54
511 0.55
512 0.62
513 0.64
514 0.64
515 0.67
516 0.68
517 0.71
518 0.69
519 0.67
520 0.63
521 0.61
522 0.58
523 0.55
524 0.55
525 0.48
526 0.41
527 0.43
528 0.43
529 0.38
530 0.37
531 0.34
532 0.33
533 0.34
534 0.33
535 0.28
536 0.23
537 0.2
538 0.18
539 0.16
540 0.12
541 0.1
542 0.1
543 0.11
544 0.11
545 0.12
546 0.14
547 0.14
548 0.19
549 0.2
550 0.22
551 0.23
552 0.29
553 0.35
554 0.38