Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B2WCQ5

Protein Details
Accession B2WCQ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
244-266DSNDSLKRRKVDKNERRRMDFSKBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MPLVDYPDSGSDDDGGGVDSNSVPAAQSAQALKRKHSHSANAIAALPPLPSAFHDLYASNARISTSDNPSLHGGRKRAVPHVEGNWPSHVYLEWIPTQTESDSLHRLIQHVRDSLELQNAKRLKKLPIPDIVSSLQSELGAPLPLHVSLSRTLQIKAEDRETFLETLRLSLRRSTVCSFVFEFRNLKWVPNFDRNRWFLVLSIKRPVNDELNHLLHACNEAARSSGHPGLYTGTEGDGPMEDHDSNDSLKRRKVDKNERRRMDFSKYFHVTIAWNLEEPDTEWTGLVEQLDTTTFIQSPEAEFDTVKVRIGSAVHNIALSTRRLRLSKGVGLGLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.09
4 0.08
5 0.08
6 0.07
7 0.08
8 0.07
9 0.07
10 0.06
11 0.06
12 0.08
13 0.08
14 0.12
15 0.15
16 0.22
17 0.29
18 0.31
19 0.36
20 0.42
21 0.45
22 0.51
23 0.53
24 0.54
25 0.54
26 0.61
27 0.59
28 0.53
29 0.5
30 0.42
31 0.36
32 0.28
33 0.21
34 0.13
35 0.1
36 0.08
37 0.08
38 0.14
39 0.14
40 0.15
41 0.16
42 0.16
43 0.19
44 0.24
45 0.24
46 0.18
47 0.18
48 0.17
49 0.16
50 0.2
51 0.22
52 0.23
53 0.3
54 0.29
55 0.31
56 0.34
57 0.37
58 0.39
59 0.39
60 0.35
61 0.31
62 0.36
63 0.37
64 0.41
65 0.42
66 0.39
67 0.39
68 0.41
69 0.45
70 0.42
71 0.41
72 0.37
73 0.34
74 0.31
75 0.26
76 0.21
77 0.17
78 0.16
79 0.17
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.16
84 0.18
85 0.14
86 0.15
87 0.14
88 0.15
89 0.17
90 0.17
91 0.19
92 0.19
93 0.2
94 0.21
95 0.23
96 0.24
97 0.23
98 0.23
99 0.22
100 0.24
101 0.24
102 0.28
103 0.26
104 0.22
105 0.28
106 0.31
107 0.31
108 0.33
109 0.34
110 0.32
111 0.35
112 0.41
113 0.39
114 0.43
115 0.47
116 0.43
117 0.44
118 0.4
119 0.34
120 0.29
121 0.24
122 0.16
123 0.11
124 0.1
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.1
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.17
142 0.2
143 0.2
144 0.23
145 0.2
146 0.2
147 0.22
148 0.21
149 0.19
150 0.16
151 0.16
152 0.11
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.12
157 0.13
158 0.16
159 0.15
160 0.19
161 0.19
162 0.22
163 0.21
164 0.23
165 0.23
166 0.23
167 0.24
168 0.22
169 0.22
170 0.17
171 0.24
172 0.22
173 0.22
174 0.2
175 0.23
176 0.27
177 0.35
178 0.39
179 0.36
180 0.44
181 0.44
182 0.46
183 0.42
184 0.37
185 0.28
186 0.34
187 0.35
188 0.29
189 0.34
190 0.32
191 0.31
192 0.33
193 0.34
194 0.3
195 0.26
196 0.28
197 0.27
198 0.28
199 0.28
200 0.26
201 0.23
202 0.18
203 0.18
204 0.14
205 0.09
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.12
212 0.15
213 0.14
214 0.14
215 0.15
216 0.15
217 0.15
218 0.14
219 0.1
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.11
232 0.12
233 0.16
234 0.21
235 0.23
236 0.27
237 0.33
238 0.38
239 0.46
240 0.56
241 0.62
242 0.67
243 0.75
244 0.82
245 0.84
246 0.84
247 0.81
248 0.75
249 0.74
250 0.71
251 0.64
252 0.63
253 0.59
254 0.53
255 0.47
256 0.43
257 0.35
258 0.3
259 0.31
260 0.22
261 0.18
262 0.18
263 0.18
264 0.17
265 0.17
266 0.17
267 0.14
268 0.13
269 0.12
270 0.12
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.09
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.12
285 0.14
286 0.16
287 0.17
288 0.16
289 0.16
290 0.17
291 0.21
292 0.21
293 0.21
294 0.17
295 0.15
296 0.16
297 0.17
298 0.19
299 0.2
300 0.23
301 0.22
302 0.22
303 0.21
304 0.22
305 0.23
306 0.24
307 0.22
308 0.23
309 0.29
310 0.3
311 0.34
312 0.39
313 0.43
314 0.46
315 0.46