Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2CSZ8

Protein Details
Accession A0A0D2CSZ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-144EDTKRTVNSRSPRPRKHSPKPVHTGSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-133RPRK
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 11, cyto 1, plas 1, pero 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09123  PLDc_Tdp1_2  
Amino Acid Sequences MSASRITARILRFTSCSTSSHIFAETRSRFASPPALRRQLSYSPLMAARPPKRIKLDAGQKDTLPASQRSASDSNVADPASVRVKRAAFLSSISRSISPPGISRSGTTTPQPQNEASEDTKRTVNSRSPRPRKHSPKPVHTGSDVRSSVAEAKPASATKLLPSPFRLTTIRDLPPSKNVDSISLHDILGNPLIKEAWVFNYCFDVDWLMTHFDPDIRSNVKVKIIHGSWKNDSPNKIAIDDACRRWTNVEAATAYLPDQFGTHHSKMFVLFTHDDLAQVVIHTANILEQDWTNMTQAAWLSPMLPLLEGKQVNKPGKLGTGTRFKHDLLAYLIAYGSKTKALREQLAQFNFMSVRGALIASVPSRMKESSTTQNDDAAWDLKLWGYPSLSRALKSIVSQQQTNLSDNTIRTKSPHVVCQVSSIATLPQSWLNQFFPVFHSTLQSIPSSPAREWDSKNVSIIYPTPQNVATSLDGFASGGSIHTKAQSAAHLKQIAALRSSLCQWTKGSTKETRAGRDEAAPHIKTYVCFANKPTTKNPCPEVTWALLTSANLSQQAWGTLRAKEKEIVVQSYEIGVLVWPELFAERFEAEVASETDEDDADRDNNGAVKRNDSEKMKMIPVFGKDIPQPPHTLDATAESSGPETLVGLRIPYDLPLTPYEKSDMPWSPQGVYEQPDRWGRRWPRDFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.35
3 0.34
4 0.33
5 0.35
6 0.34
7 0.32
8 0.32
9 0.27
10 0.26
11 0.35
12 0.31
13 0.32
14 0.32
15 0.32
16 0.29
17 0.32
18 0.4
19 0.37
20 0.45
21 0.5
22 0.57
23 0.56
24 0.58
25 0.61
26 0.58
27 0.55
28 0.49
29 0.41
30 0.36
31 0.37
32 0.36
33 0.34
34 0.36
35 0.37
36 0.43
37 0.47
38 0.51
39 0.55
40 0.58
41 0.6
42 0.61
43 0.66
44 0.66
45 0.69
46 0.64
47 0.57
48 0.57
49 0.51
50 0.44
51 0.38
52 0.3
53 0.27
54 0.28
55 0.29
56 0.32
57 0.33
58 0.31
59 0.31
60 0.3
61 0.28
62 0.26
63 0.25
64 0.19
65 0.18
66 0.2
67 0.23
68 0.23
69 0.23
70 0.25
71 0.26
72 0.28
73 0.29
74 0.28
75 0.21
76 0.22
77 0.28
78 0.25
79 0.26
80 0.26
81 0.26
82 0.24
83 0.26
84 0.27
85 0.22
86 0.22
87 0.25
88 0.27
89 0.27
90 0.27
91 0.3
92 0.3
93 0.31
94 0.31
95 0.35
96 0.38
97 0.41
98 0.44
99 0.39
100 0.39
101 0.39
102 0.41
103 0.35
104 0.36
105 0.34
106 0.33
107 0.35
108 0.32
109 0.32
110 0.32
111 0.37
112 0.39
113 0.48
114 0.57
115 0.65
116 0.74
117 0.79
118 0.85
119 0.87
120 0.89
121 0.89
122 0.88
123 0.88
124 0.87
125 0.85
126 0.79
127 0.72
128 0.67
129 0.59
130 0.58
131 0.47
132 0.39
133 0.33
134 0.29
135 0.31
136 0.26
137 0.27
138 0.17
139 0.19
140 0.2
141 0.21
142 0.21
143 0.17
144 0.17
145 0.16
146 0.21
147 0.22
148 0.22
149 0.25
150 0.28
151 0.27
152 0.31
153 0.3
154 0.28
155 0.33
156 0.37
157 0.37
158 0.38
159 0.4
160 0.38
161 0.44
162 0.45
163 0.4
164 0.36
165 0.33
166 0.31
167 0.3
168 0.31
169 0.28
170 0.24
171 0.23
172 0.2
173 0.2
174 0.17
175 0.18
176 0.16
177 0.12
178 0.11
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.15
191 0.12
192 0.09
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.12
201 0.13
202 0.16
203 0.16
204 0.18
205 0.2
206 0.23
207 0.27
208 0.27
209 0.26
210 0.29
211 0.28
212 0.33
213 0.36
214 0.39
215 0.37
216 0.41
217 0.45
218 0.43
219 0.44
220 0.4
221 0.4
222 0.36
223 0.33
224 0.28
225 0.24
226 0.27
227 0.3
228 0.29
229 0.28
230 0.27
231 0.27
232 0.28
233 0.28
234 0.25
235 0.22
236 0.22
237 0.17
238 0.18
239 0.18
240 0.17
241 0.15
242 0.12
243 0.1
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.1
248 0.17
249 0.18
250 0.18
251 0.18
252 0.19
253 0.2
254 0.2
255 0.17
256 0.15
257 0.15
258 0.14
259 0.16
260 0.15
261 0.15
262 0.14
263 0.14
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.11
295 0.12
296 0.13
297 0.17
298 0.24
299 0.26
300 0.26
301 0.26
302 0.21
303 0.23
304 0.24
305 0.23
306 0.21
307 0.28
308 0.28
309 0.3
310 0.32
311 0.29
312 0.31
313 0.29
314 0.25
315 0.18
316 0.19
317 0.16
318 0.14
319 0.14
320 0.1
321 0.1
322 0.08
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.13
328 0.16
329 0.18
330 0.21
331 0.26
332 0.3
333 0.31
334 0.32
335 0.27
336 0.25
337 0.22
338 0.19
339 0.14
340 0.07
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.09
352 0.09
353 0.1
354 0.12
355 0.16
356 0.23
357 0.28
358 0.32
359 0.3
360 0.32
361 0.31
362 0.29
363 0.26
364 0.17
365 0.13
366 0.09
367 0.09
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.15
376 0.16
377 0.16
378 0.16
379 0.16
380 0.17
381 0.17
382 0.24
383 0.23
384 0.25
385 0.25
386 0.25
387 0.3
388 0.31
389 0.32
390 0.24
391 0.19
392 0.19
393 0.2
394 0.24
395 0.18
396 0.17
397 0.17
398 0.2
399 0.26
400 0.26
401 0.31
402 0.3
403 0.3
404 0.3
405 0.32
406 0.29
407 0.23
408 0.21
409 0.16
410 0.12
411 0.11
412 0.1
413 0.08
414 0.09
415 0.1
416 0.11
417 0.13
418 0.13
419 0.14
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.16
424 0.16
425 0.14
426 0.15
427 0.14
428 0.15
429 0.16
430 0.14
431 0.12
432 0.13
433 0.16
434 0.17
435 0.16
436 0.2
437 0.23
438 0.27
439 0.29
440 0.35
441 0.37
442 0.36
443 0.37
444 0.34
445 0.29
446 0.26
447 0.25
448 0.2
449 0.18
450 0.18
451 0.18
452 0.17
453 0.17
454 0.17
455 0.18
456 0.16
457 0.13
458 0.13
459 0.11
460 0.1
461 0.1
462 0.09
463 0.06
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.07
469 0.08
470 0.09
471 0.09
472 0.1
473 0.15
474 0.2
475 0.21
476 0.27
477 0.27
478 0.26
479 0.3
480 0.33
481 0.29
482 0.25
483 0.23
484 0.18
485 0.18
486 0.2
487 0.21
488 0.18
489 0.18
490 0.18
491 0.22
492 0.27
493 0.29
494 0.34
495 0.35
496 0.39
497 0.44
498 0.48
499 0.49
500 0.49
501 0.48
502 0.43
503 0.41
504 0.38
505 0.38
506 0.41
507 0.35
508 0.31
509 0.3
510 0.29
511 0.25
512 0.26
513 0.27
514 0.22
515 0.23
516 0.26
517 0.35
518 0.38
519 0.43
520 0.48
521 0.5
522 0.52
523 0.56
524 0.58
525 0.52
526 0.51
527 0.5
528 0.46
529 0.39
530 0.36
531 0.31
532 0.28
533 0.24
534 0.21
535 0.19
536 0.16
537 0.14
538 0.12
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.14
543 0.13
544 0.17
545 0.18
546 0.21
547 0.28
548 0.29
549 0.31
550 0.31
551 0.32
552 0.34
553 0.36
554 0.34
555 0.29
556 0.28
557 0.25
558 0.24
559 0.22
560 0.15
561 0.11
562 0.08
563 0.06
564 0.06
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.06
569 0.07
570 0.07
571 0.09
572 0.09
573 0.1
574 0.1
575 0.1
576 0.09
577 0.11
578 0.12
579 0.12
580 0.11
581 0.11
582 0.11
583 0.11
584 0.11
585 0.09
586 0.1
587 0.09
588 0.09
589 0.09
590 0.1
591 0.14
592 0.16
593 0.23
594 0.22
595 0.27
596 0.3
597 0.35
598 0.4
599 0.4
600 0.44
601 0.43
602 0.46
603 0.46
604 0.44
605 0.43
606 0.41
607 0.39
608 0.4
609 0.34
610 0.34
611 0.33
612 0.39
613 0.4
614 0.38
615 0.38
616 0.35
617 0.4
618 0.36
619 0.33
620 0.26
621 0.26
622 0.27
623 0.25
624 0.22
625 0.17
626 0.17
627 0.16
628 0.15
629 0.1
630 0.07
631 0.08
632 0.1
633 0.1
634 0.09
635 0.1
636 0.11
637 0.12
638 0.13
639 0.14
640 0.13
641 0.16
642 0.2
643 0.23
644 0.22
645 0.24
646 0.26
647 0.25
648 0.25
649 0.3
650 0.31
651 0.33
652 0.38
653 0.38
654 0.36
655 0.38
656 0.4
657 0.36
658 0.35
659 0.36
660 0.32
661 0.36
662 0.43
663 0.46
664 0.44
665 0.51
666 0.56
667 0.61