Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2A2V8

Protein Details
Accession A0A0D2A2V8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
232-251KSHPLKGKGKESERHRRPYGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-245KGKGKESER
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 6.5, cyto_mito 5.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MSLADSCCTCATLLSDAKVPYDPHSEKSLLHHRQLDCCSRFICATCQYKNPRFQAYCPFCQISSGPSALPREGLRLPPSYTKTAASRGSRRAESPPPSYDDSIAPRRLPEQSAGPPADTDDTVHFVGSEDSLQSLSLAYKVPIPVLRRYNNLYSDQLLAARKWILVPKSHYTGPPLSTPPDAEEEERKTKLRRWMIATKCADYNVAQLYLKGSDHNLELAVEAFRSDEEWEKSHPLKGKGKESERHRRPYGTGGSISGQLP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.24
3 0.24
4 0.26
5 0.28
6 0.27
7 0.24
8 0.31
9 0.31
10 0.3
11 0.35
12 0.35
13 0.33
14 0.4
15 0.46
16 0.43
17 0.47
18 0.51
19 0.48
20 0.54
21 0.59
22 0.6
23 0.52
24 0.49
25 0.43
26 0.38
27 0.37
28 0.32
29 0.32
30 0.3
31 0.35
32 0.36
33 0.44
34 0.51
35 0.57
36 0.63
37 0.63
38 0.64
39 0.59
40 0.59
41 0.62
42 0.6
43 0.57
44 0.54
45 0.51
46 0.41
47 0.4
48 0.37
49 0.28
50 0.24
51 0.21
52 0.16
53 0.17
54 0.19
55 0.17
56 0.19
57 0.17
58 0.17
59 0.18
60 0.21
61 0.21
62 0.22
63 0.25
64 0.29
65 0.32
66 0.31
67 0.31
68 0.3
69 0.29
70 0.32
71 0.36
72 0.36
73 0.38
74 0.42
75 0.45
76 0.44
77 0.44
78 0.44
79 0.45
80 0.45
81 0.43
82 0.39
83 0.38
84 0.4
85 0.38
86 0.34
87 0.29
88 0.29
89 0.3
90 0.3
91 0.26
92 0.23
93 0.24
94 0.24
95 0.23
96 0.19
97 0.18
98 0.19
99 0.24
100 0.24
101 0.23
102 0.21
103 0.2
104 0.19
105 0.15
106 0.12
107 0.08
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.08
113 0.09
114 0.08
115 0.07
116 0.04
117 0.04
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.11
130 0.13
131 0.18
132 0.25
133 0.27
134 0.28
135 0.32
136 0.35
137 0.35
138 0.36
139 0.31
140 0.26
141 0.25
142 0.22
143 0.21
144 0.18
145 0.15
146 0.14
147 0.13
148 0.11
149 0.11
150 0.15
151 0.14
152 0.17
153 0.22
154 0.25
155 0.29
156 0.3
157 0.3
158 0.3
159 0.32
160 0.29
161 0.27
162 0.25
163 0.24
164 0.23
165 0.23
166 0.2
167 0.21
168 0.2
169 0.19
170 0.23
171 0.26
172 0.3
173 0.32
174 0.33
175 0.32
176 0.37
177 0.44
178 0.47
179 0.47
180 0.49
181 0.57
182 0.6
183 0.67
184 0.64
185 0.58
186 0.51
187 0.45
188 0.39
189 0.3
190 0.28
191 0.21
192 0.19
193 0.17
194 0.16
195 0.17
196 0.17
197 0.17
198 0.14
199 0.13
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.1
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.09
214 0.14
215 0.16
216 0.19
217 0.22
218 0.29
219 0.3
220 0.35
221 0.4
222 0.42
223 0.48
224 0.53
225 0.6
226 0.63
227 0.69
228 0.72
229 0.76
230 0.79
231 0.79
232 0.81
233 0.76
234 0.72
235 0.67
236 0.68
237 0.66
238 0.6
239 0.53
240 0.46
241 0.43