Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2CHE5

Protein Details
Accession A0A0D2CHE5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
397-417QREKRMKDLLRRIKEIKKPFNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
400-430KRMKDLLRRIKEIKKPFNVKALLRRKDKPKA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.333, cyto 5, cyto_mito 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013909  NIPA/Rsm1_C  
IPR012935  Znf_C3HC-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08600  Rsm1  
PF07967  zf-C3HC  
Amino Acid Sequences MSYAIETKKRKFDRILEALTDGAASNPPSAPSSPSRSSVNASTTSLSLYAASDSSKRRRITPTSKTTASHTSTPATLSGHYLPSSRAAFLQRLETFRHVTQWHVPSTDPINAAVWAKRGWTCVDTDTVACGVCKERLYVDLDLDKALLKSSEKHGDEGADEDAAGDEEDSFAISSEIYDGIVKRYQDMIVTAHAESCLWRKRGCDASIQRIEGLLNTSLALSGLKARYDSLASHLDQIPQVEPLPLGSFVSPQEVEQFRLGGQERPHIDTLRLAVCGWERKCDDVIECRHCFRSLGLWLYRGESPAIEKLDAIDNHLEYCPWRSAEAQDTELQTGHSRTTTGEEITPKKERVPGWVLVYQAMAKDNRQKRASTGPPSTAASEAVLSENGSESTTPEQREKRMKDLLRRIKEIKKPFNVKALLRRKDKPKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.72
3 0.64
4 0.6
5 0.53
6 0.44
7 0.36
8 0.25
9 0.16
10 0.13
11 0.11
12 0.11
13 0.12
14 0.13
15 0.15
16 0.16
17 0.2
18 0.24
19 0.31
20 0.33
21 0.36
22 0.38
23 0.38
24 0.41
25 0.41
26 0.4
27 0.35
28 0.33
29 0.31
30 0.28
31 0.27
32 0.22
33 0.18
34 0.14
35 0.11
36 0.1
37 0.09
38 0.11
39 0.14
40 0.21
41 0.29
42 0.36
43 0.37
44 0.42
45 0.5
46 0.58
47 0.64
48 0.68
49 0.7
50 0.7
51 0.72
52 0.68
53 0.64
54 0.62
55 0.56
56 0.5
57 0.42
58 0.36
59 0.33
60 0.33
61 0.3
62 0.23
63 0.19
64 0.19
65 0.18
66 0.18
67 0.18
68 0.18
69 0.18
70 0.21
71 0.22
72 0.19
73 0.19
74 0.2
75 0.22
76 0.22
77 0.29
78 0.27
79 0.29
80 0.32
81 0.32
82 0.33
83 0.31
84 0.36
85 0.29
86 0.29
87 0.35
88 0.36
89 0.35
90 0.32
91 0.31
92 0.29
93 0.32
94 0.32
95 0.24
96 0.2
97 0.19
98 0.19
99 0.2
100 0.18
101 0.17
102 0.13
103 0.14
104 0.15
105 0.16
106 0.17
107 0.16
108 0.17
109 0.16
110 0.19
111 0.18
112 0.16
113 0.16
114 0.14
115 0.13
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.11
120 0.12
121 0.11
122 0.12
123 0.14
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.18
128 0.18
129 0.17
130 0.17
131 0.15
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.1
137 0.15
138 0.23
139 0.23
140 0.24
141 0.25
142 0.24
143 0.24
144 0.23
145 0.19
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.03
158 0.03
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.08
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.13
184 0.17
185 0.17
186 0.18
187 0.19
188 0.24
189 0.31
190 0.31
191 0.36
192 0.34
193 0.42
194 0.45
195 0.44
196 0.39
197 0.33
198 0.31
199 0.22
200 0.19
201 0.1
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.04
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.13
219 0.14
220 0.16
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.17
225 0.14
226 0.12
227 0.11
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.1
238 0.09
239 0.08
240 0.14
241 0.14
242 0.16
243 0.15
244 0.16
245 0.13
246 0.17
247 0.18
248 0.16
249 0.17
250 0.21
251 0.22
252 0.25
253 0.27
254 0.24
255 0.23
256 0.21
257 0.22
258 0.18
259 0.16
260 0.13
261 0.12
262 0.14
263 0.21
264 0.2
265 0.23
266 0.22
267 0.24
268 0.25
269 0.25
270 0.25
271 0.26
272 0.33
273 0.35
274 0.37
275 0.37
276 0.37
277 0.37
278 0.35
279 0.28
280 0.26
281 0.23
282 0.27
283 0.27
284 0.27
285 0.27
286 0.29
287 0.29
288 0.23
289 0.19
290 0.13
291 0.14
292 0.16
293 0.17
294 0.15
295 0.14
296 0.15
297 0.21
298 0.21
299 0.21
300 0.19
301 0.17
302 0.19
303 0.19
304 0.18
305 0.12
306 0.16
307 0.16
308 0.14
309 0.15
310 0.15
311 0.18
312 0.25
313 0.27
314 0.27
315 0.27
316 0.28
317 0.27
318 0.26
319 0.24
320 0.19
321 0.17
322 0.15
323 0.12
324 0.11
325 0.11
326 0.16
327 0.17
328 0.16
329 0.19
330 0.24
331 0.28
332 0.34
333 0.38
334 0.35
335 0.36
336 0.4
337 0.37
338 0.39
339 0.4
340 0.39
341 0.39
342 0.41
343 0.38
344 0.33
345 0.33
346 0.26
347 0.22
348 0.21
349 0.16
350 0.17
351 0.27
352 0.33
353 0.41
354 0.43
355 0.43
356 0.44
357 0.54
358 0.59
359 0.58
360 0.57
361 0.53
362 0.53
363 0.54
364 0.51
365 0.42
366 0.33
367 0.25
368 0.19
369 0.16
370 0.14
371 0.12
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.15
380 0.2
381 0.23
382 0.3
383 0.34
384 0.42
385 0.53
386 0.56
387 0.58
388 0.63
389 0.68
390 0.7
391 0.77
392 0.79
393 0.77
394 0.8
395 0.79
396 0.79
397 0.81
398 0.81
399 0.8
400 0.8
401 0.8
402 0.77
403 0.79
404 0.76
405 0.74
406 0.74
407 0.74
408 0.73
409 0.73
410 0.77