Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2CP00

Protein Details
Accession A0A0D2CP00    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-223RYFARKPKKTPEQIEKERKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
207-229ARKPKKTPEQIEKERKEKEEKKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000717  PCI_dom  
IPR040134  PSMD12/CSN4  
IPR040896  RPN5_C  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0000502  C:proteasome complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF01399  PCI  
PF18098  RPN5_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MSDGTIFKPEKDFTKEADKVLPEAEALAKQDIHKAIDKILLLEKQARQSSDLATTSRCLVTIVTLCKEAGDWSLLNEQVLLLSKKHGQLKQAITNMVQAVMGFLDDTPNLDTKLSVIEALRTVTEGKIFVEVERARITRILSDIKKEQGDIKSACDILCELQVETFGSMTRREKTEFILEQVALCIQNGDWTQAGILSRKISTRYFARKPKKTPEQIEKERKEKEEKKKTEEEPEQEQEDDVTDLKLRYYEQQITLAKHEDKYLEVCKHYRQVLDTESVENNPEQLHAVLQRVIYFVLLAPYDNEQSDLLHRIHQDSRNSQVPKDAALLKQFTIPELMRWPMVEQQYGEHLCSTDIFSKTPDASDSQAQTRYEALRHRVIEHNVRVIAKYYTRITFPRLTELLDLSDDETEKYISDLVTKKTVYARIDRPARVVSFEVKRGPDEVLDEWGNSMKGLLQLLERVGHLMQREEMMARIQPKEEVKRAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.49
3 0.47
4 0.51
5 0.45
6 0.39
7 0.37
8 0.33
9 0.23
10 0.2
11 0.2
12 0.15
13 0.16
14 0.17
15 0.18
16 0.18
17 0.24
18 0.25
19 0.26
20 0.3
21 0.29
22 0.29
23 0.32
24 0.31
25 0.28
26 0.31
27 0.29
28 0.26
29 0.32
30 0.33
31 0.37
32 0.4
33 0.39
34 0.36
35 0.36
36 0.36
37 0.35
38 0.34
39 0.28
40 0.26
41 0.26
42 0.26
43 0.24
44 0.21
45 0.16
46 0.13
47 0.16
48 0.2
49 0.24
50 0.22
51 0.23
52 0.23
53 0.23
54 0.23
55 0.19
56 0.15
57 0.14
58 0.12
59 0.13
60 0.18
61 0.18
62 0.17
63 0.16
64 0.14
65 0.13
66 0.17
67 0.15
68 0.12
69 0.15
70 0.19
71 0.24
72 0.32
73 0.33
74 0.34
75 0.41
76 0.48
77 0.53
78 0.53
79 0.49
80 0.42
81 0.43
82 0.39
83 0.31
84 0.23
85 0.15
86 0.11
87 0.09
88 0.08
89 0.05
90 0.04
91 0.05
92 0.05
93 0.07
94 0.08
95 0.09
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.1
109 0.11
110 0.1
111 0.11
112 0.1
113 0.09
114 0.11
115 0.12
116 0.11
117 0.18
118 0.18
119 0.19
120 0.23
121 0.23
122 0.21
123 0.23
124 0.23
125 0.17
126 0.21
127 0.26
128 0.23
129 0.28
130 0.31
131 0.33
132 0.33
133 0.32
134 0.34
135 0.29
136 0.33
137 0.29
138 0.28
139 0.27
140 0.27
141 0.26
142 0.2
143 0.18
144 0.13
145 0.14
146 0.12
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.1
156 0.13
157 0.16
158 0.17
159 0.19
160 0.2
161 0.23
162 0.29
163 0.27
164 0.27
165 0.27
166 0.25
167 0.22
168 0.22
169 0.19
170 0.11
171 0.1
172 0.08
173 0.05
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.11
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.12
187 0.15
188 0.14
189 0.17
190 0.23
191 0.31
192 0.38
193 0.47
194 0.56
195 0.61
196 0.68
197 0.74
198 0.77
199 0.77
200 0.77
201 0.77
202 0.77
203 0.79
204 0.83
205 0.79
206 0.75
207 0.71
208 0.66
209 0.66
210 0.65
211 0.65
212 0.66
213 0.66
214 0.66
215 0.7
216 0.69
217 0.69
218 0.65
219 0.59
220 0.54
221 0.52
222 0.46
223 0.38
224 0.35
225 0.25
226 0.2
227 0.16
228 0.09
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.09
236 0.13
237 0.15
238 0.15
239 0.21
240 0.24
241 0.25
242 0.26
243 0.27
244 0.24
245 0.22
246 0.22
247 0.17
248 0.15
249 0.17
250 0.21
251 0.2
252 0.21
253 0.22
254 0.23
255 0.27
256 0.28
257 0.26
258 0.22
259 0.22
260 0.22
261 0.24
262 0.22
263 0.21
264 0.19
265 0.18
266 0.18
267 0.15
268 0.13
269 0.1
270 0.09
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.09
294 0.1
295 0.13
296 0.12
297 0.14
298 0.15
299 0.18
300 0.23
301 0.28
302 0.31
303 0.31
304 0.35
305 0.41
306 0.41
307 0.38
308 0.37
309 0.33
310 0.29
311 0.3
312 0.28
313 0.21
314 0.24
315 0.25
316 0.21
317 0.23
318 0.22
319 0.19
320 0.19
321 0.18
322 0.16
323 0.17
324 0.18
325 0.15
326 0.15
327 0.16
328 0.18
329 0.2
330 0.19
331 0.17
332 0.17
333 0.23
334 0.24
335 0.23
336 0.17
337 0.16
338 0.15
339 0.15
340 0.17
341 0.16
342 0.16
343 0.16
344 0.17
345 0.19
346 0.2
347 0.2
348 0.18
349 0.15
350 0.16
351 0.2
352 0.22
353 0.23
354 0.28
355 0.27
356 0.26
357 0.28
358 0.27
359 0.26
360 0.29
361 0.3
362 0.32
363 0.34
364 0.37
365 0.4
366 0.44
367 0.49
368 0.47
369 0.47
370 0.43
371 0.42
372 0.39
373 0.34
374 0.31
375 0.25
376 0.25
377 0.24
378 0.23
379 0.26
380 0.27
381 0.31
382 0.34
383 0.34
384 0.37
385 0.34
386 0.34
387 0.33
388 0.32
389 0.28
390 0.22
391 0.21
392 0.14
393 0.15
394 0.13
395 0.12
396 0.12
397 0.1
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.08
402 0.14
403 0.18
404 0.21
405 0.26
406 0.26
407 0.28
408 0.32
409 0.38
410 0.36
411 0.4
412 0.42
413 0.46
414 0.54
415 0.53
416 0.52
417 0.51
418 0.48
419 0.43
420 0.4
421 0.38
422 0.36
423 0.4
424 0.41
425 0.37
426 0.38
427 0.36
428 0.35
429 0.28
430 0.26
431 0.23
432 0.23
433 0.22
434 0.21
435 0.21
436 0.21
437 0.2
438 0.16
439 0.14
440 0.11
441 0.12
442 0.12
443 0.13
444 0.12
445 0.14
446 0.16
447 0.17
448 0.15
449 0.15
450 0.15
451 0.16
452 0.16
453 0.17
454 0.16
455 0.16
456 0.18
457 0.16
458 0.17
459 0.18
460 0.21
461 0.23
462 0.24
463 0.24
464 0.28
465 0.35
466 0.43
467 0.49