Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0SI27

Protein Details
Accession A0A0L0SI27    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
562-601VTAKVKISKKKIAKTLFKQSKSSQKNKPERSRSPPPPASGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
567-595KISKKKIAKTLFKQSKSSQKNKPERSRSP
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 8.5, cyto_mito 6.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MISPTGEPISVVMPSYASMSGPPSPTYQGMGAVPMWLQSSALAAPPNLAAPLPSGPYHAGQYGAYPPARDAGQRPRASSSPWFASDGSIPHPNHATTSADPARYHPHNTSASYSTGYAPSAASGSGFSASRTVGSTSSTVSLSHPNPSHIAPLVEQMRKRRTSQPPLPTVPKESKTTTQRYQWLVEYDAQVAAGNGYDAGTVPPGYSSAKAPWSNGDEAGSTGEPTDAQDRDLDPTAPTVNRSPSSKRSAAGGASAAPRTELHLPTGKLTSYVPYTKRDYEFLCRADQVAKLPTSLGPPGDPETERRRHKVRHVQEYSDMDFEGGLQLKVEKIVRSRIYETLFWKEECFGLTAETIVDKAVELDHIGGQYGTQTPTKFLCLVLKLLQIDPSYDIVLEYIRDPEFKYLRALGAFYLRLTANSLQCYEELEPLLVDYRKLRFRQPTGAYALTTMDQFVDGLLREERLCDIILPRIQKRHVLEDKGDLDPRFSALSERFEAEEEAPIPAEEAREVSDREDADDDEHEEGAVPDDDGQVVGDADIDAIMAEASEPARVPELPEVDVTAKVKISKKKIAKTLFKQSKSSQKNKPERSRSPPPPASGDGGFRESMSVEETNRMRIAMGLKPLRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.12
3 0.11
4 0.1
5 0.1
6 0.13
7 0.17
8 0.19
9 0.2
10 0.2
11 0.23
12 0.24
13 0.26
14 0.23
15 0.22
16 0.2
17 0.21
18 0.18
19 0.16
20 0.15
21 0.13
22 0.13
23 0.1
24 0.1
25 0.08
26 0.1
27 0.09
28 0.11
29 0.12
30 0.11
31 0.12
32 0.12
33 0.13
34 0.11
35 0.1
36 0.09
37 0.1
38 0.12
39 0.14
40 0.13
41 0.15
42 0.17
43 0.19
44 0.21
45 0.19
46 0.18
47 0.15
48 0.18
49 0.19
50 0.22
51 0.21
52 0.2
53 0.19
54 0.21
55 0.22
56 0.21
57 0.23
58 0.29
59 0.39
60 0.41
61 0.43
62 0.45
63 0.46
64 0.49
65 0.49
66 0.45
67 0.41
68 0.4
69 0.4
70 0.35
71 0.35
72 0.33
73 0.29
74 0.26
75 0.29
76 0.27
77 0.27
78 0.29
79 0.27
80 0.26
81 0.26
82 0.26
83 0.19
84 0.28
85 0.3
86 0.31
87 0.31
88 0.32
89 0.38
90 0.37
91 0.4
92 0.33
93 0.36
94 0.37
95 0.39
96 0.41
97 0.36
98 0.34
99 0.32
100 0.3
101 0.25
102 0.22
103 0.19
104 0.15
105 0.13
106 0.11
107 0.1
108 0.09
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.11
120 0.1
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.14
125 0.14
126 0.13
127 0.13
128 0.19
129 0.19
130 0.25
131 0.25
132 0.25
133 0.27
134 0.27
135 0.28
136 0.23
137 0.23
138 0.16
139 0.22
140 0.26
141 0.29
142 0.31
143 0.36
144 0.43
145 0.45
146 0.48
147 0.52
148 0.56
149 0.62
150 0.68
151 0.7
152 0.7
153 0.73
154 0.76
155 0.68
156 0.64
157 0.61
158 0.55
159 0.5
160 0.46
161 0.48
162 0.49
163 0.54
164 0.53
165 0.53
166 0.56
167 0.55
168 0.54
169 0.49
170 0.44
171 0.38
172 0.35
173 0.3
174 0.24
175 0.2
176 0.18
177 0.14
178 0.12
179 0.09
180 0.06
181 0.05
182 0.03
183 0.04
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.1
195 0.11
196 0.18
197 0.19
198 0.19
199 0.22
200 0.25
201 0.25
202 0.24
203 0.22
204 0.16
205 0.16
206 0.17
207 0.13
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.11
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.14
219 0.16
220 0.15
221 0.12
222 0.13
223 0.15
224 0.13
225 0.15
226 0.14
227 0.17
228 0.18
229 0.21
230 0.25
231 0.29
232 0.36
233 0.36
234 0.34
235 0.33
236 0.33
237 0.3
238 0.26
239 0.2
240 0.15
241 0.15
242 0.15
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.11
247 0.14
248 0.13
249 0.14
250 0.18
251 0.19
252 0.2
253 0.21
254 0.19
255 0.16
256 0.15
257 0.15
258 0.13
259 0.18
260 0.18
261 0.21
262 0.25
263 0.28
264 0.29
265 0.3
266 0.29
267 0.31
268 0.35
269 0.32
270 0.3
271 0.26
272 0.26
273 0.25
274 0.23
275 0.18
276 0.17
277 0.15
278 0.13
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.13
283 0.11
284 0.08
285 0.09
286 0.11
287 0.13
288 0.12
289 0.15
290 0.21
291 0.29
292 0.32
293 0.36
294 0.4
295 0.43
296 0.52
297 0.58
298 0.6
299 0.63
300 0.63
301 0.61
302 0.6
303 0.59
304 0.51
305 0.41
306 0.32
307 0.21
308 0.17
309 0.14
310 0.1
311 0.07
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.16
321 0.19
322 0.22
323 0.24
324 0.26
325 0.28
326 0.29
327 0.31
328 0.3
329 0.29
330 0.26
331 0.24
332 0.21
333 0.19
334 0.17
335 0.15
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.05
344 0.04
345 0.03
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.07
358 0.08
359 0.09
360 0.09
361 0.11
362 0.12
363 0.14
364 0.13
365 0.13
366 0.15
367 0.14
368 0.16
369 0.17
370 0.19
371 0.18
372 0.18
373 0.2
374 0.17
375 0.16
376 0.15
377 0.14
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.1
389 0.15
390 0.16
391 0.17
392 0.19
393 0.17
394 0.18
395 0.18
396 0.18
397 0.13
398 0.15
399 0.14
400 0.12
401 0.13
402 0.11
403 0.11
404 0.14
405 0.17
406 0.16
407 0.17
408 0.18
409 0.16
410 0.16
411 0.19
412 0.17
413 0.16
414 0.14
415 0.12
416 0.11
417 0.11
418 0.14
419 0.11
420 0.11
421 0.12
422 0.16
423 0.23
424 0.25
425 0.31
426 0.36
427 0.4
428 0.49
429 0.5
430 0.5
431 0.49
432 0.49
433 0.43
434 0.35
435 0.32
436 0.23
437 0.18
438 0.14
439 0.08
440 0.07
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.05
445 0.07
446 0.08
447 0.09
448 0.09
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.11
455 0.15
456 0.19
457 0.23
458 0.26
459 0.31
460 0.32
461 0.37
462 0.39
463 0.44
464 0.48
465 0.47
466 0.46
467 0.48
468 0.5
469 0.47
470 0.48
471 0.38
472 0.32
473 0.27
474 0.26
475 0.19
476 0.16
477 0.16
478 0.15
479 0.2
480 0.2
481 0.21
482 0.21
483 0.21
484 0.22
485 0.19
486 0.2
487 0.16
488 0.15
489 0.13
490 0.12
491 0.12
492 0.11
493 0.11
494 0.08
495 0.08
496 0.1
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.17
501 0.16
502 0.18
503 0.19
504 0.17
505 0.17
506 0.18
507 0.18
508 0.15
509 0.15
510 0.13
511 0.12
512 0.11
513 0.12
514 0.11
515 0.09
516 0.08
517 0.08
518 0.09
519 0.08
520 0.08
521 0.06
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.04
528 0.04
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.04
535 0.04
536 0.05
537 0.05
538 0.06
539 0.09
540 0.09
541 0.11
542 0.16
543 0.18
544 0.19
545 0.19
546 0.21
547 0.2
548 0.24
549 0.22
550 0.19
551 0.18
552 0.23
553 0.29
554 0.35
555 0.41
556 0.48
557 0.57
558 0.63
559 0.71
560 0.76
561 0.8
562 0.8
563 0.84
564 0.84
565 0.8
566 0.78
567 0.76
568 0.76
569 0.76
570 0.76
571 0.75
572 0.76
573 0.82
574 0.86
575 0.9
576 0.89
577 0.89
578 0.89
579 0.9
580 0.89
581 0.89
582 0.85
583 0.78
584 0.74
585 0.68
586 0.63
587 0.55
588 0.5
589 0.43
590 0.39
591 0.34
592 0.28
593 0.25
594 0.2
595 0.18
596 0.18
597 0.16
598 0.14
599 0.21
600 0.23
601 0.26
602 0.26
603 0.26
604 0.22
605 0.23
606 0.26
607 0.24
608 0.32