FuNGI

A0A0L0SDG6

Protein Details

Accession

A0A0L0SDG6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
109-128	GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 9, cyto 8, nucl 6, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MPCHGADVPALFRWLSQKYPRITSPVVEEKELVVNGHVIPVDFSKPNPNGVEFDNLYLDMNGIIHPCCHPDDKAAPATEDDMMIAIFEYIDRIMAMIRPRKVLYMAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAQEAAAKEQELRADLAASNHPFGQPDSETPSEKFDSNCITPGTPFMANLVVALRYYVAHRLNTNPGWRDLKVLLSDASVPGEGEHKVMDFVRRQRCEPGYDANTRHVLYGLDADLIMLGLATHEPHFTILREDVFANEKNRKGNRNCHNCGQPGHRQDECPNPKVTINHNKGGTGTDFEKKPYLFLHVPILREYLEAELYFKEQETGFRFDLERAIDDWVFLCFFVGNDFLPHLPCLEIREGAIDLLIDVYKNNLRKMGGYLTSGGHAHLDRVQYIFHELGVAETNIFKLRKEHEDDRAAQSRRRAQQAKLQKAGFTAVQIQEMMAEFDMEERESSITNAAVAERLRQKLAAAPLAPSPTTRTVPSAPTNESTAAAPATTTVAATADKPMAVDSAESTTTAEPATMPESELIPTISSKRSRKDAGLEGDVVESEPAAKKQEVADDEEEEEDDEAEQDDEAEDSSVDDLGKASPVPTKVLPATVKTTGTEDTVELHKDGWRERYYDQKFHESSTEFRTQVAHAYMEGLCWVLHYYYVGCPSWKWFYPYHYAPFASDFVDIAQLKIEFELGEPFKPVEQLMGVFPAASRKHIPSVFHDLMTSDKSEIIDFYPVDFEVDLNGKKHAWQGVALLPFIDEKRLLKAINERYPHMSEADHRLNSRGTEVMMVSSSHPLFPTFCSVYQPPARADNSEHDPIVVKLDMILGNLGGTIRADVRACLPGGTLVSPFPDHPSQRSVKNNKSLSVVYAHPAYDMKDFKPYLLPGTQLPGRVLTWGDITFAFNKHRRRSPHILVKDYGTQATLTRPPGAMDGGSARPSGGSTGSGGWYDSRSGSARSSQQSQHHQHQSRDYNLRLRGSGVVAVLDAPRDDRGNARYSESSSSRSYSTGGRGGYQGQQQHQQQAWQYTQPQAYAAGGVPPVVAHHQQYPGIPPAMPQHQQFVPPVGAQSAAQQAQMMQLQMQLQMQMQMQMQQMQMQQQFHQQQQHAHQHGQQQPQQQPQQQPQQHHGTNGLPQRPPQPNLAWSRNLRRGGASGGSASGSGAPGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.28
3	0.34
4	0.4
5	0.44
6	0.51
7	0.53
8	0.55
9	0.54
10	0.49
11	0.5
12	0.52
13	0.49
14	0.44
15	0.42
16	0.36
17	0.38
18	0.36
19	0.28
20	0.19
21	0.18
22	0.16
23	0.18
24	0.16
25	0.11
26	0.13
27	0.14
28	0.18
29	0.17
30	0.19
31	0.26
32	0.27
33	0.32
34	0.34
35	0.34
36	0.32
37	0.33
38	0.4
39	0.31
40	0.32
41	0.28
42	0.25
43	0.24
44	0.21
45	0.18
46	0.11
47	0.1
48	0.09
49	0.09
50	0.09
51	0.1
52	0.11
53	0.14
54	0.17
55	0.2
56	0.2
57	0.25
58	0.3
59	0.35
60	0.4
61	0.39
62	0.37
63	0.35
64	0.35
65	0.29
66	0.25
67	0.18
68	0.12
69	0.1
70	0.09
71	0.08
72	0.05
73	0.04
74	0.04
75	0.05
76	0.05
77	0.05
78	0.05
79	0.05
80	0.06
81	0.1
82	0.18
83	0.24
84	0.27
85	0.3
86	0.31
87	0.33
88	0.34
89	0.35
90	0.32
91	0.32
92	0.3
93	0.27
94	0.27
95	0.25
96	0.25
97	0.23
98	0.19
99	0.12
100	0.15
101	0.21
102	0.29
103	0.39
104	0.47
105	0.55
106	0.66
107	0.74
108	0.8
109	0.81
110	0.78
111	0.74
112	0.75
113	0.74
114	0.7
115	0.67
116	0.59
117	0.51
118	0.5
119	0.44
120	0.34
121	0.27
122	0.2
123	0.15
124	0.15
125	0.16
126	0.15
127	0.15
128	0.14
129	0.14
130	0.14
131	0.16
132	0.21
133	0.21
134	0.21
135	0.21
136	0.21
137	0.2
138	0.2
139	0.22
140	0.18
141	0.19
142	0.24
143	0.26
144	0.29
145	0.29
146	0.33
147	0.31
148	0.3
149	0.29
150	0.26
151	0.29
152	0.28
153	0.3
154	0.27
155	0.25
156	0.24
157	0.25
158	0.25
159	0.19
160	0.18
161	0.16
162	0.15
163	0.14
164	0.14
165	0.13
166	0.09
167	0.09
168	0.09
169	0.08
170	0.07
171	0.09
172	0.15
173	0.17
174	0.19
175	0.21
176	0.25
177	0.32
178	0.36
179	0.42
180	0.38
181	0.41
182	0.43
183	0.41
184	0.41
185	0.35
186	0.34
187	0.29
188	0.28
189	0.23
190	0.19
191	0.2
192	0.16
193	0.16
194	0.12
195	0.1
196	0.09
197	0.11
198	0.1
199	0.09
200	0.09
201	0.08
202	0.1
203	0.11
204	0.16
205	0.2
206	0.29
207	0.38
208	0.41
209	0.43
210	0.49
211	0.51
212	0.51
213	0.48
214	0.48
215	0.45
216	0.49
217	0.49
218	0.45
219	0.46
220	0.42
221	0.38
222	0.3
223	0.23
224	0.17
225	0.18
226	0.14
227	0.11
228	0.1
229	0.09
230	0.08
231	0.08
232	0.07
233	0.04
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.04
238	0.05
239	0.05
240	0.06
241	0.08
242	0.09
243	0.1
244	0.13
245	0.14
246	0.14
247	0.16
248	0.15
249	0.16
250	0.19
251	0.22
252	0.24
253	0.28
254	0.3
255	0.37
256	0.42
257	0.5
258	0.53
259	0.59
260	0.64
261	0.69
262	0.71
263	0.71
264	0.72
265	0.67
266	0.66
267	0.62
268	0.61
269	0.56
270	0.57
271	0.51
272	0.47
273	0.47
274	0.53
275	0.53
276	0.48
277	0.43
278	0.39
279	0.41
280	0.41
281	0.46
282	0.46
283	0.45
284	0.46
285	0.45
286	0.44
287	0.41
288	0.4
289	0.32
290	0.25
291	0.22
292	0.22
293	0.22
294	0.23
295	0.27
296	0.24
297	0.24
298	0.22
299	0.26
300	0.22
301	0.23
302	0.31
303	0.29
304	0.31
305	0.3
306	0.3
307	0.24
308	0.22
309	0.21
310	0.13
311	0.11
312	0.1
313	0.1
314	0.1
315	0.1
316	0.11
317	0.1
318	0.1
319	0.09
320	0.14
321	0.17
322	0.22
323	0.21
324	0.22
325	0.23
326	0.22
327	0.25
328	0.22
329	0.19
330	0.14
331	0.17
332	0.15
333	0.14
334	0.14
335	0.12
336	0.11
337	0.09
338	0.08
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.07
343	0.06
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.09
348	0.09
349	0.09
350	0.08
351	0.09
352	0.11
353	0.12
354	0.12
355	0.11
356	0.13
357	0.12
358	0.11
359	0.11
360	0.07
361	0.05
362	0.06
363	0.06
364	0.04
365	0.04
366	0.06
367	0.1
368	0.12
369	0.13
370	0.15
371	0.15
372	0.17
373	0.2
374	0.22
375	0.21
376	0.2
377	0.21
378	0.19
379	0.19
380	0.18
381	0.16
382	0.12
383	0.1
384	0.1
385	0.12
386	0.12
387	0.11
388	0.12
389	0.12
390	0.1
391	0.13
392	0.12
393	0.09
394	0.09
395	0.08
396	0.08
397	0.1
398	0.09
399	0.06
400	0.06
401	0.07
402	0.11
403	0.11
404	0.1
405	0.13
406	0.17
407	0.23
408	0.3
409	0.34
410	0.38
411	0.43
412	0.46
413	0.5
414	0.54
415	0.5
416	0.45
417	0.46
418	0.47
419	0.46
420	0.52
421	0.49
422	0.43
423	0.5
424	0.59
425	0.61
426	0.59
427	0.55
428	0.47
429	0.43
430	0.43
431	0.34
432	0.24
433	0.2
434	0.14
435	0.14
436	0.13
437	0.12
438	0.11
439	0.11
440	0.1
441	0.06
442	0.05
443	0.04
444	0.05
445	0.06
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.07
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.07
458	0.07
459	0.11
460	0.15
461	0.16
462	0.16
463	0.16
464	0.16
465	0.19
466	0.21
467	0.2
468	0.16
469	0.16
470	0.17
471	0.18
472	0.18
473	0.15
474	0.15
475	0.15
476	0.16
477	0.16
478	0.17
479	0.18
480	0.22
481	0.26
482	0.26
483	0.25
484	0.25
485	0.26
486	0.23
487	0.22
488	0.18
489	0.14
490	0.11
491	0.09
492	0.07
493	0.06
494	0.06
495	0.05
496	0.05
497	0.04
498	0.04
499	0.05
500	0.06
501	0.07
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.05
509	0.05
510	0.06
511	0.07
512	0.07
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.06
518	0.05
519	0.06
520	0.07
521	0.06
522	0.07
523	0.07
524	0.07
525	0.08
526	0.08
527	0.07
528	0.06
529	0.07
530	0.08
531	0.12
532	0.18
533	0.21
534	0.23
535	0.28
536	0.3
537	0.32
538	0.35
539	0.37
540	0.35
541	0.34
542	0.31
543	0.27
544	0.24
545	0.22
546	0.17
547	0.1
548	0.06
549	0.04
550	0.05
551	0.05
552	0.07
553	0.07
554	0.08
555	0.09
556	0.13
557	0.14
558	0.17
559	0.18
560	0.17
561	0.17
562	0.16
563	0.16
564	0.12
565	0.1
566	0.06
567	0.05
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.03
572	0.03
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.03
577	0.03
578	0.03
579	0.03
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.05
588	0.07
589	0.08
590	0.1
591	0.09
592	0.12
593	0.11
594	0.16
595	0.16
596	0.15
597	0.18
598	0.18
599	0.18
600	0.17
601	0.18
602	0.15
603	0.15
604	0.13
605	0.1
606	0.1
607	0.11
608	0.11
609	0.1
610	0.1
611	0.11
612	0.12
613	0.13
614	0.17
615	0.18
616	0.19
617	0.2
618	0.3
619	0.33
620	0.38
621	0.39
622	0.41
623	0.4
624	0.38
625	0.41
626	0.32
627	0.3
628	0.3
629	0.32
630	0.24
631	0.24
632	0.24
633	0.21
634	0.22
635	0.21
636	0.15
637	0.1
638	0.12
639	0.11
640	0.1
641	0.1
642	0.07
643	0.06
644	0.06
645	0.06
646	0.04
647	0.04
648	0.05
649	0.06
650	0.06
651	0.09
652	0.09
653	0.09
654	0.1
655	0.13
656	0.17
657	0.17
658	0.19
659	0.18
660	0.22
661	0.28
662	0.32
663	0.33
664	0.31
665	0.3
666	0.27
667	0.28
668	0.25
669	0.19
670	0.15
671	0.11
672	0.09
673	0.13
674	0.13
675	0.1
676	0.11
677	0.1
678	0.1
679	0.1
680	0.1
681	0.05
682	0.05
683	0.1
684	0.1
685	0.1
686	0.11
687	0.11
688	0.11
689	0.12
690	0.11
691	0.07
692	0.06
693	0.07
694	0.07
695	0.08
696	0.07
697	0.07
698	0.07
699	0.12
700	0.12
701	0.13
702	0.15
703	0.15
704	0.21
705	0.23
706	0.25
707	0.25
708	0.34
709	0.33
710	0.31
711	0.3
712	0.25
713	0.24
714	0.24
715	0.19
716	0.1
717	0.1
718	0.1
719	0.1
720	0.1
721	0.09
722	0.1
723	0.1
724	0.1
725	0.1
726	0.09
727	0.1
728	0.09
729	0.08
730	0.07
731	0.1
732	0.11
733	0.1
734	0.12
735	0.11
736	0.12
737	0.15
738	0.16
739	0.14
740	0.13
741	0.15
742	0.19
743	0.2
744	0.19
745	0.16
746	0.13
747	0.14
748	0.13
749	0.12
750	0.08
751	0.08
752	0.11
753	0.14
754	0.14
755	0.15
756	0.23
757	0.31
758	0.37
759	0.38
760	0.37
761	0.4
762	0.41
763	0.4
764	0.33
765	0.25
766	0.21
767	0.27
768	0.31
769	0.28
770	0.27
771	0.28
772	0.28
773	0.27
774	0.25
775	0.18
776	0.12
777	0.12
778	0.11
779	0.1
780	0.1
781	0.1
782	0.09
783	0.12
784	0.12
785	0.11
786	0.11
787	0.11
788	0.11
789	0.12
790	0.17
791	0.16
792	0.16
793	0.2
794	0.21
795	0.26
796	0.3
797	0.31
798	0.27
799	0.3
800	0.31
801	0.28
802	0.3
803	0.29
804	0.31
805	0.31
806	0.29
807	0.24
808	0.24
809	0.22
810	0.22
811	0.17
812	0.11
813	0.08
814	0.11
815	0.11
816	0.1
817	0.09
818	0.06
819	0.06
820	0.07
821	0.06
822	0.04
823	0.04
824	0.04
825	0.05
826	0.06
827	0.07
828	0.07
829	0.09
830	0.11
831	0.12
832	0.11
833	0.11
834	0.1
835	0.11
836	0.11
837	0.1
838	0.08
839	0.09
840	0.1
841	0.1
842	0.14
843	0.19
844	0.19
845	0.21
846	0.28
847	0.3
848	0.36
849	0.46
850	0.5
851	0.53
852	0.61
853	0.61
854	0.57
855	0.57
856	0.51
857	0.42
858	0.37
859	0.3
860	0.23
861	0.21
862	0.19
863	0.16
864	0.16
865	0.16
866	0.18
867	0.19
868	0.18
869	0.24
870	0.24
871	0.24
872	0.28
873	0.27
874	0.26
875	0.25
876	0.25
877	0.19
878	0.24
879	0.25
880	0.22
881	0.22
882	0.19
883	0.18
884	0.18
885	0.18
886	0.13
887	0.14
888	0.12
889	0.13
890	0.11
891	0.13
892	0.14
893	0.16
894	0.22
895	0.26
896	0.34
897	0.4
898	0.47
899	0.52
900	0.59
901	0.66
902	0.7
903	0.74
904	0.74
905	0.73
906	0.67
907	0.64
908	0.6
909	0.52
910	0.42
911	0.32
912	0.24
913	0.19
914	0.22
915	0.23
916	0.19
917	0.2
918	0.2
919	0.2
920	0.2
921	0.2
922	0.16
923	0.13
924	0.14
925	0.15
926	0.16
927	0.15
928	0.13
929	0.12
930	0.13
931	0.12
932	0.09
933	0.08
934	0.08
935	0.1
936	0.11
937	0.11
938	0.11
939	0.11
940	0.11
941	0.12
942	0.11
943	0.12
944	0.13
945	0.15
946	0.17
947	0.21
948	0.27
949	0.3
950	0.35
951	0.38
952	0.44
953	0.52
954	0.57
955	0.61
956	0.66
957	0.67
958	0.67
959	0.7
960	0.7
961	0.68
962	0.68
963	0.63
964	0.6
965	0.59
966	0.57
967	0.48
968	0.43
969	0.36
970	0.31
971	0.28
972	0.21
973	0.15
974	0.13
975	0.13
976	0.11
977	0.1
978	0.08
979	0.08
980	0.09
981	0.1
982	0.11
983	0.15
984	0.18
985	0.23
986	0.25
987	0.28
988	0.29
989	0.31
990	0.36
991	0.34
992	0.35
993	0.32
994	0.33
995	0.29
996	0.28
997	0.27
998	0.24
999	0.26
1000	0.26
1001	0.24
1002	0.24
1003	0.24
1004	0.26
1005	0.29
1006	0.31
1007	0.31
1008	0.3
1009	0.37
1010	0.38
1011	0.44
1012	0.43
1013	0.42
1014	0.42
1015	0.43
1016	0.42
1017	0.4
1018	0.4
1019	0.39
1020	0.39
1021	0.35
1022	0.31
1023	0.26
1024	0.24
1025	0.2
1026	0.17
1027	0.13
1028	0.12
1029	0.11
1030	0.1
1031	0.09
1032	0.1
1033	0.12
1034	0.14
1035	0.14
1036	0.18
1037	0.21
1038	0.23
1039	0.24
1040	0.27
1041	0.28
1042	0.28
1043	0.26
1044	0.24
1045	0.27
1046	0.33
1047	0.36
1048	0.32
1049	0.33
1050	0.33
1051	0.36
1052	0.36
1053	0.34
1054	0.29
1055	0.25
1056	0.25
1057	0.2
1058	0.19
1059	0.16
1060	0.18
1061	0.2
1062	0.19
1063	0.18
1064	0.17
1065	0.17
1066	0.19
1067	0.21
1068	0.18
1069	0.12
1070	0.14
1071	0.15
1072	0.16
1073	0.17
1074	0.15
1075	0.13
1076	0.16
1077	0.16
1078	0.17
1079	0.17
1080	0.2
1081	0.21
1082	0.23
1083	0.23
1084	0.24
1085	0.26
1086	0.3
1087	0.34
1088	0.31
1089	0.31
1090	0.37
1091	0.42
1092	0.43
1093	0.49
1094	0.45
1095	0.48
1096	0.55
1097	0.64
1098	0.6
1099	0.58
1100	0.57
1101	0.58
1102	0.63
1103	0.65
1104	0.6
1105	0.59
1106	0.61
1107	0.67
1108	0.71
1109	0.68
1110	0.7
1111	0.7
1112	0.75
1113	0.72
1114	0.71
1115	0.69
1116	0.7
1117	0.66
1118	0.59
1119	0.54
1120	0.47
1121	0.49
1122	0.51
1123	0.5
1124	0.43
1125	0.44
1126	0.5
1127	0.54
1128	0.54
1129	0.53
1130	0.5
1131	0.52
1132	0.58
1133	0.62
1134	0.6
1135	0.6
1136	0.68
1137	0.7
1138	0.68
1139	0.61
1140	0.55
1141	0.51
1142	0.48
1143	0.43
1144	0.35
1145	0.27
1146	0.24
1147	0.23
1148	0.2
1149	0.17
1150	0.13
1151	0.11

A0A0L0SDG6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer