Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0SCF2

Protein Details
Accession A0A0L0SCF2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
162-185REDLRTARQQKSTRRRSRPTSRRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-185STRRRSRPTSRRS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR027131  SMC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
Amino Acid Sequences MGTSMVSCGKLLKPEGAQLLRTLDKNTRHSSYTVNRKRASEKEIKSLLDKLDIQIDNICQFLPQERVSALAAMGNKELLKEVQKAAGEPGMLTKHAQLEELDEHVKDKSQNVDFFTNAVEALQAKNQAIEVQYLRIRNRQTIKRKAALTRALVWETKYNHLREDLRTARQQKSTRRRSRPTSRRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.35
3 0.34
4 0.33
5 0.3
6 0.33
7 0.32
8 0.31
9 0.3
10 0.29
11 0.34
12 0.4
13 0.44
14 0.42
15 0.42
16 0.42
17 0.46
18 0.49
19 0.54
20 0.56
21 0.59
22 0.59
23 0.6
24 0.65
25 0.63
26 0.61
27 0.6
28 0.55
29 0.55
30 0.56
31 0.54
32 0.49
33 0.47
34 0.4
35 0.34
36 0.31
37 0.23
38 0.26
39 0.25
40 0.23
41 0.21
42 0.21
43 0.17
44 0.17
45 0.16
46 0.08
47 0.08
48 0.1
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.07
66 0.09
67 0.1
68 0.11
69 0.13
70 0.13
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.11
75 0.09
76 0.11
77 0.08
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.08
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.1
90 0.11
91 0.1
92 0.12
93 0.1
94 0.1
95 0.14
96 0.18
97 0.2
98 0.23
99 0.25
100 0.23
101 0.23
102 0.22
103 0.17
104 0.13
105 0.1
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.12
117 0.11
118 0.13
119 0.16
120 0.2
121 0.22
122 0.26
123 0.28
124 0.32
125 0.4
126 0.46
127 0.53
128 0.6
129 0.66
130 0.67
131 0.71
132 0.69
133 0.68
134 0.66
135 0.6
136 0.55
137 0.51
138 0.47
139 0.43
140 0.4
141 0.38
142 0.34
143 0.38
144 0.38
145 0.35
146 0.35
147 0.4
148 0.41
149 0.39
150 0.46
151 0.43
152 0.44
153 0.52
154 0.56
155 0.56
156 0.61
157 0.65
158 0.66
159 0.71
160 0.76
161 0.78
162 0.83
163 0.86
164 0.88
165 0.92