Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0RVX5

Protein Details
Accession A0A0L0RVX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
463-490GRGSRGGGRGARKRPRTRGGRVNKRGGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-96RPRKGGK
331-346ARGRARGGPRPPPPPA
445-490GGRRGGRGRGSARGGRGGGRGSRGGGRGARKRPRTRGGRVNKRGGG
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 8, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000380  Topo_IA  
IPR013497  Topo_IA_cen  
IPR013824  Topo_IA_cen_sub1  
IPR013826  Topo_IA_cen_sub3  
IPR023405  Topo_IA_core_domain  
IPR003602  Topo_IA_DNA-bd_dom  
IPR010666  Znf_GRF  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF01131  Topoisom_bac  
PF06839  zf-GRF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51999  ZF_GRF  
Amino Acid Sequences MTTVEMQKLGVRYLRMPSGQVMNIAERLDQQGVVSYPRTESNEFEAAVDLRPLVEMQAAHPEWGGYVASLLNPPPADEVPAGRRPNTFERPRKGGKNDKAHPPIHPTRQVSNLIGDEKRVYELITRRFLAACSRDAVGAEATVSIFLSSESFSASGLTVYERNYLDVYPYDRWTMHELPPFQMHEEFIPRVCEMKEGQTSPLSLLTEADLIAHMDANRIGTDAKIHEHIKKILERKYVVKQPAAAAAQGGGPAAMNAGNAGRSGGGNHVLFPTTLRIALVEAFDALATQSLAKPHLRAAMEADLVAISNGAKNKAQVVDQARCQVPERLPARGRARGGPRPPPPPANRPYQPPPPPNSNYPPPNNHYPLPRGGGGGGGYPARPAHGRHSHLRPGPGCGLVAVVKAVGKDGPDKSRSFYTRTKVSQADQCRFFEWADDLANGVAAGGRRGGRGRGSARGGRGGGRGSRGGGRGARKRPRTRGGRVNKRGGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.31
3 0.32
4 0.32
5 0.34
6 0.33
7 0.33
8 0.3
9 0.27
10 0.28
11 0.27
12 0.24
13 0.19
14 0.21
15 0.2
16 0.17
17 0.15
18 0.16
19 0.17
20 0.19
21 0.19
22 0.17
23 0.18
24 0.22
25 0.27
26 0.25
27 0.27
28 0.3
29 0.32
30 0.31
31 0.3
32 0.28
33 0.24
34 0.23
35 0.2
36 0.14
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.19
45 0.19
46 0.19
47 0.19
48 0.18
49 0.16
50 0.17
51 0.16
52 0.06
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.09
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.14
62 0.14
63 0.16
64 0.15
65 0.19
66 0.23
67 0.31
68 0.33
69 0.31
70 0.33
71 0.36
72 0.44
73 0.5
74 0.54
75 0.55
76 0.61
77 0.67
78 0.74
79 0.76
80 0.77
81 0.77
82 0.77
83 0.78
84 0.77
85 0.79
86 0.79
87 0.72
88 0.67
89 0.65
90 0.64
91 0.62
92 0.63
93 0.57
94 0.53
95 0.57
96 0.57
97 0.49
98 0.44
99 0.39
100 0.35
101 0.31
102 0.28
103 0.24
104 0.21
105 0.2
106 0.17
107 0.14
108 0.16
109 0.22
110 0.28
111 0.32
112 0.32
113 0.32
114 0.32
115 0.32
116 0.33
117 0.29
118 0.24
119 0.21
120 0.21
121 0.2
122 0.2
123 0.2
124 0.13
125 0.1
126 0.09
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.13
148 0.12
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.17
155 0.16
156 0.17
157 0.18
158 0.18
159 0.2
160 0.25
161 0.26
162 0.27
163 0.3
164 0.3
165 0.31
166 0.34
167 0.32
168 0.28
169 0.24
170 0.2
171 0.16
172 0.19
173 0.17
174 0.15
175 0.16
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.12
181 0.17
182 0.2
183 0.2
184 0.21
185 0.21
186 0.21
187 0.19
188 0.2
189 0.15
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.12
212 0.14
213 0.16
214 0.19
215 0.21
216 0.24
217 0.28
218 0.32
219 0.34
220 0.37
221 0.36
222 0.38
223 0.42
224 0.45
225 0.42
226 0.38
227 0.34
228 0.3
229 0.32
230 0.28
231 0.21
232 0.14
233 0.12
234 0.11
235 0.1
236 0.09
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.07
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.04
276 0.05
277 0.06
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.11
282 0.16
283 0.16
284 0.15
285 0.18
286 0.19
287 0.18
288 0.17
289 0.16
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.06
294 0.03
295 0.05
296 0.06
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.11
301 0.13
302 0.13
303 0.18
304 0.23
305 0.25
306 0.27
307 0.32
308 0.3
309 0.3
310 0.31
311 0.31
312 0.26
313 0.31
314 0.3
315 0.33
316 0.34
317 0.41
318 0.44
319 0.45
320 0.45
321 0.43
322 0.49
323 0.5
324 0.54
325 0.55
326 0.56
327 0.57
328 0.59
329 0.61
330 0.59
331 0.6
332 0.58
333 0.58
334 0.55
335 0.57
336 0.6
337 0.61
338 0.64
339 0.62
340 0.63
341 0.63
342 0.64
343 0.63
344 0.63
345 0.62
346 0.61
347 0.6
348 0.61
349 0.58
350 0.63
351 0.6
352 0.56
353 0.53
354 0.49
355 0.47
356 0.44
357 0.39
358 0.31
359 0.27
360 0.25
361 0.2
362 0.17
363 0.14
364 0.1
365 0.09
366 0.1
367 0.09
368 0.1
369 0.11
370 0.13
371 0.21
372 0.29
373 0.34
374 0.41
375 0.48
376 0.55
377 0.57
378 0.63
379 0.54
380 0.52
381 0.5
382 0.43
383 0.36
384 0.27
385 0.24
386 0.18
387 0.17
388 0.11
389 0.09
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.08
394 0.09
395 0.14
396 0.18
397 0.24
398 0.28
399 0.29
400 0.33
401 0.41
402 0.42
403 0.44
404 0.46
405 0.47
406 0.52
407 0.55
408 0.57
409 0.53
410 0.55
411 0.57
412 0.59
413 0.6
414 0.56
415 0.54
416 0.49
417 0.47
418 0.42
419 0.36
420 0.29
421 0.23
422 0.2
423 0.18
424 0.17
425 0.15
426 0.15
427 0.12
428 0.09
429 0.08
430 0.06
431 0.07
432 0.09
433 0.1
434 0.12
435 0.15
436 0.18
437 0.2
438 0.27
439 0.31
440 0.35
441 0.41
442 0.44
443 0.46
444 0.48
445 0.46
446 0.42
447 0.41
448 0.38
449 0.35
450 0.34
451 0.32
452 0.29
453 0.32
454 0.31
455 0.33
456 0.34
457 0.4
458 0.46
459 0.54
460 0.62
461 0.68
462 0.76
463 0.81
464 0.86
465 0.86
466 0.86
467 0.87
468 0.88
469 0.89
470 0.89