Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0SJP6

Protein Details
Accession A0A0L0SJP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MDRDKYQRPAKVKNKTPAEIHydrophilic
54-74EYRFHKRKTFEDAIRRNKHHIBasic
611-632ETVQRMFPRVIKKRRRVEEGSDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF13428  TPR_14  
Amino Acid Sequences MDRDKYQRPAKVKNKTPAEIQITAEQVLRDATDRAEPVHTVPAQKITDAEELHEYRFHKRKTFEDAIRRNKHHIAHWLKYAAWEESQKEFDRARSVFERVLEIDARNPAIWIRYAEMEMRHKNINLARNLWDRACTQLPRVDQFWYKYAYMEEMLGEIAKARQIFERWMQWRPTEDAWQAYAAFETRYREIDRARSVYRRMVETHPDPANWIAFAKFEESQNAIANARQVYEDAVAYLTDEHVTASLLSSFARFEARHKETARARAVYQYALSVLPKSQTTEIYRQYANFEKQCGDRTTIETVVASKRRWVYEAEIAANPFNYDVWFDLIRLEEDAHETAKAREAYERAVANVPPVDGGKRVWRRYIYLWLQYAVFEETTANDADRARAVYETALQLVPHKQFTFAKLWLAYAKFLIRAPRLDVGAARKALGMALGMCPKPRLFKGYIELELALREFDRVRLLYEKFLEADAANVGAWVKYAELEKMVGDGDRSRAILELAVAQPVLDMPEVLWKAYIDYETEEEEWSRARDLYERLLQRTSHVKVWISYAKYEMQCAELDSVPLRADRARAIFQRANTALKDRRAHDERVVLLESWRDFEREFGGRERAETVQRMFPRVIKKRRRVEEGSDATEEYLEYVWPDDEARQPSLKLLAKAQQWKLKMQLGAGGGGDAAAAPAAPAPAPVPPGPVPDASELADGDVCVTRSKELLNGEVRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.78
3 0.76
4 0.74
5 0.71
6 0.64
7 0.57
8 0.52
9 0.45
10 0.42
11 0.38
12 0.29
13 0.22
14 0.19
15 0.17
16 0.13
17 0.12
18 0.13
19 0.16
20 0.17
21 0.18
22 0.2
23 0.2
24 0.21
25 0.27
26 0.28
27 0.26
28 0.27
29 0.33
30 0.31
31 0.31
32 0.3
33 0.26
34 0.3
35 0.27
36 0.28
37 0.28
38 0.29
39 0.3
40 0.33
41 0.3
42 0.33
43 0.42
44 0.44
45 0.44
46 0.47
47 0.52
48 0.58
49 0.66
50 0.66
51 0.68
52 0.74
53 0.78
54 0.82
55 0.8
56 0.77
57 0.73
58 0.68
59 0.63
60 0.63
61 0.61
62 0.57
63 0.6
64 0.56
65 0.5
66 0.49
67 0.46
68 0.38
69 0.32
70 0.31
71 0.28
72 0.3
73 0.35
74 0.33
75 0.34
76 0.34
77 0.33
78 0.37
79 0.34
80 0.36
81 0.35
82 0.37
83 0.35
84 0.35
85 0.35
86 0.28
87 0.31
88 0.27
89 0.24
90 0.23
91 0.23
92 0.24
93 0.2
94 0.19
95 0.16
96 0.16
97 0.17
98 0.16
99 0.15
100 0.16
101 0.17
102 0.19
103 0.24
104 0.3
105 0.32
106 0.33
107 0.34
108 0.33
109 0.37
110 0.4
111 0.42
112 0.38
113 0.37
114 0.41
115 0.43
116 0.46
117 0.41
118 0.38
119 0.31
120 0.32
121 0.35
122 0.3
123 0.28
124 0.31
125 0.34
126 0.35
127 0.36
128 0.35
129 0.33
130 0.35
131 0.35
132 0.33
133 0.3
134 0.27
135 0.27
136 0.25
137 0.2
138 0.18
139 0.14
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.12
150 0.14
151 0.18
152 0.22
153 0.31
154 0.32
155 0.38
156 0.4
157 0.39
158 0.41
159 0.41
160 0.4
161 0.37
162 0.35
163 0.31
164 0.29
165 0.28
166 0.25
167 0.2
168 0.18
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.13
173 0.13
174 0.17
175 0.19
176 0.21
177 0.24
178 0.3
179 0.34
180 0.36
181 0.39
182 0.4
183 0.42
184 0.44
185 0.44
186 0.4
187 0.38
188 0.37
189 0.4
190 0.38
191 0.42
192 0.38
193 0.35
194 0.33
195 0.31
196 0.27
197 0.2
198 0.18
199 0.11
200 0.1
201 0.11
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.14
206 0.15
207 0.16
208 0.17
209 0.18
210 0.15
211 0.14
212 0.17
213 0.14
214 0.13
215 0.12
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.1
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.09
240 0.08
241 0.11
242 0.21
243 0.25
244 0.31
245 0.32
246 0.39
247 0.42
248 0.5
249 0.52
250 0.44
251 0.41
252 0.39
253 0.38
254 0.32
255 0.27
256 0.19
257 0.15
258 0.14
259 0.13
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.11
265 0.11
266 0.15
267 0.19
268 0.24
269 0.27
270 0.29
271 0.29
272 0.28
273 0.31
274 0.32
275 0.33
276 0.28
277 0.26
278 0.25
279 0.26
280 0.3
281 0.29
282 0.26
283 0.23
284 0.24
285 0.26
286 0.24
287 0.23
288 0.18
289 0.18
290 0.19
291 0.21
292 0.19
293 0.19
294 0.22
295 0.22
296 0.23
297 0.23
298 0.22
299 0.25
300 0.27
301 0.26
302 0.24
303 0.24
304 0.22
305 0.2
306 0.16
307 0.1
308 0.08
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.06
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.12
328 0.13
329 0.12
330 0.13
331 0.14
332 0.15
333 0.18
334 0.18
335 0.14
336 0.15
337 0.15
338 0.14
339 0.13
340 0.12
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.08
346 0.16
347 0.22
348 0.23
349 0.27
350 0.28
351 0.3
352 0.32
353 0.4
354 0.35
355 0.33
356 0.33
357 0.3
358 0.29
359 0.26
360 0.24
361 0.16
362 0.12
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.06
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.13
385 0.14
386 0.14
387 0.14
388 0.15
389 0.16
390 0.2
391 0.22
392 0.19
393 0.21
394 0.19
395 0.19
396 0.2
397 0.19
398 0.16
399 0.13
400 0.13
401 0.12
402 0.13
403 0.16
404 0.15
405 0.16
406 0.18
407 0.19
408 0.19
409 0.18
410 0.19
411 0.18
412 0.21
413 0.2
414 0.18
415 0.16
416 0.15
417 0.15
418 0.13
419 0.09
420 0.05
421 0.07
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.11
426 0.12
427 0.15
428 0.15
429 0.19
430 0.18
431 0.22
432 0.27
433 0.31
434 0.31
435 0.29
436 0.29
437 0.23
438 0.21
439 0.18
440 0.12
441 0.07
442 0.07
443 0.06
444 0.07
445 0.09
446 0.09
447 0.11
448 0.16
449 0.17
450 0.2
451 0.21
452 0.21
453 0.19
454 0.18
455 0.17
456 0.12
457 0.12
458 0.08
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.04
464 0.05
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.06
469 0.06
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.07
476 0.07
477 0.08
478 0.09
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.09
485 0.09
486 0.1
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.05
495 0.04
496 0.04
497 0.11
498 0.11
499 0.11
500 0.12
501 0.11
502 0.12
503 0.13
504 0.13
505 0.08
506 0.09
507 0.11
508 0.12
509 0.13
510 0.13
511 0.13
512 0.13
513 0.13
514 0.12
515 0.12
516 0.11
517 0.11
518 0.14
519 0.17
520 0.22
521 0.28
522 0.31
523 0.32
524 0.35
525 0.34
526 0.33
527 0.39
528 0.36
529 0.33
530 0.32
531 0.31
532 0.29
533 0.35
534 0.37
535 0.32
536 0.3
537 0.28
538 0.31
539 0.29
540 0.3
541 0.25
542 0.21
543 0.19
544 0.19
545 0.2
546 0.14
547 0.14
548 0.13
549 0.14
550 0.13
551 0.13
552 0.13
553 0.11
554 0.12
555 0.15
556 0.18
557 0.23
558 0.26
559 0.33
560 0.35
561 0.35
562 0.42
563 0.41
564 0.4
565 0.35
566 0.4
567 0.38
568 0.42
569 0.47
570 0.41
571 0.49
572 0.5
573 0.53
574 0.5
575 0.5
576 0.44
577 0.43
578 0.42
579 0.33
580 0.29
581 0.29
582 0.24
583 0.21
584 0.2
585 0.17
586 0.15
587 0.17
588 0.21
589 0.2
590 0.23
591 0.24
592 0.29
593 0.28
594 0.29
595 0.31
596 0.29
597 0.3
598 0.31
599 0.31
600 0.33
601 0.34
602 0.37
603 0.35
604 0.37
605 0.44
606 0.5
607 0.57
608 0.6
609 0.68
610 0.75
611 0.82
612 0.85
613 0.81
614 0.79
615 0.79
616 0.76
617 0.7
618 0.62
619 0.54
620 0.45
621 0.39
622 0.3
623 0.2
624 0.13
625 0.08
626 0.07
627 0.08
628 0.08
629 0.08
630 0.09
631 0.11
632 0.17
633 0.21
634 0.24
635 0.25
636 0.25
637 0.26
638 0.34
639 0.36
640 0.32
641 0.33
642 0.36
643 0.41
644 0.5
645 0.56
646 0.54
647 0.52
648 0.54
649 0.55
650 0.55
651 0.49
652 0.4
653 0.38
654 0.33
655 0.32
656 0.27
657 0.21
658 0.15
659 0.13
660 0.12
661 0.06
662 0.05
663 0.03
664 0.03
665 0.03
666 0.04
667 0.04
668 0.04
669 0.05
670 0.06
671 0.08
672 0.12
673 0.13
674 0.17
675 0.18
676 0.23
677 0.25
678 0.26
679 0.27
680 0.26
681 0.28
682 0.24
683 0.24
684 0.2
685 0.19
686 0.17
687 0.14
688 0.13
689 0.13
690 0.13
691 0.13
692 0.14
693 0.14
694 0.15
695 0.17
696 0.19
697 0.2
698 0.27